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毛钧等
, 2011,
斑茅初级核心种质秩数加权平均取样策略
,
分子植物育种
Vol.9 No.1 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0001)
1007
表
7
最优取样策略在不同总体取样量下的参数比较
Table 7 Comparison of parameters for different sampling ratio in best sampling strategy
取样策略
Sampling
strategy
总体取样量
Sampling
ratio
多样性指数
I
变异系数
CV
表型方差
VPV
表型频率方差
VPF
表型保留比例
RPR
秩数平均值
Average rank
LLC
10%
1.42 (4.00)
0.04 (1.00) 0.04 (1.00) 0.10 (1.00)
3.24 (7.00)
4.84 (2.80)
15%
1.06 (3.00)
0.08 (2.00) 0.06 (1.50) 0.10 (1.00)
2.77 (6.00)
4.08 (2.70)
20%
1.06 (3.00)
0.04 (1.00) 0.06 (1.50) 0.10 (1.00)
2.77 (6.00)
4.04 (2.50)
25%
0.71 (2.00)
0.04 (1.00) 0.11 (2.5)
0.10 (1.00)
2.31 (5.00)
3.27 (2.30)
30%
0.71 (2.00)
0.04 (1.00) 0.11 (2.5)
0.10 (1.00)
2.08 (4.50)
3.04 (2.20)
35%
0.71 (2.00)
0.04 (1.00) 0.11 (2.5)
0.10 (1.00)
1.62 (3.50)
2.57 (2.00)
40%
0.53 (1.50)
0.04 (1.00) 0.13 (3.00) 0.10 (1.00)
1.16 (2.50)
1.96 (1.80)
45%
0.53 (1.50)
0.04 (1.00) 0.11 (2.5)
0.10 (1.00)
1.16 (2.50)
1.93 (1.70)
50%
0.35 (1.00)
0.04 (1.00) 0.11 (2.5)
0.10 (1.00)
0.92 (2.00)
1.53 (1.50)
原始库
Original bank
100%
0.20 (1.00)
0.60 (3.00)
0.60 (3.00)
0.40 (2.00)
0.20 (1.00)
2.00 (2.00)
注
:
表中参数缩写和数据格式同表
3
Note: Abbreviations and data format as in Table 3
表
8
最优核心库
LLC35
％的表型性状丢失情况
Table 8 Phenotypic trait lost in the best pre-core collection LLC35
％
表型性状
Phenotypic trait
代码描述
Code discription
总份数
Total Number
丢失表型性状情况及处理
Phenotypic trait lost situation and processing
节间形状
4
Internodes shape 4
圆锥形
Conoidal
2
丢失
,
原始库中取样
1
份
Lost, 1 sampled from original pool
节间形状
5
Internodes shape 5
倒圆锥型
Obconoidal
3
部分重复丢失
;
未丢失重复里取样
1
份
Lost some replication, 1 sampled from other replication
茎径
10
Salk diameter 10
第
10
组
10 Group
3
部分重复丢失
;
未丢失重复里取样
1
份
Lost some replication, 1 sampled from other replication
叶长
9
Lamina length 9
第
9
组
9 Group
3
部分重复丢失
;
未丢失重复里取样
1
份
Lost some replication, 1 sampled from other replication
叶宽分组
10
Lamina width
第
10
组
10 Goup
3
部分重复丢失
;
未丢失重复里取样
1
份
Lost some replication, 1 sampled from other replication
2.2
取样策略评价与分析
取样方法、分组原则和组内取样比例单独评价
的结果表明，斑茅核心种质较好的取样方法是聚类
取样，较好的分组原则是叶型分组、海拔分组和总
体聚类分组，较好的组内取样比例为对数比例和多
样性比例。但方差分析结果表明，取样方法、分组
原则、组内取样比例等因素之间存在互作关系，因
此最好的取样方法、最好的分组原则和最好的组内
取样比例不一定能组合出最好的取样策略。鉴于此，
本研究在确定最佳取样策略时，采用了综合分析的
方法，即先分析
42
种取样策略组合的秩数加权平均
值，寻找实际效果最佳的组合，再结合方差分析中
的主效参数确定最佳组合下的最佳总体取样量，从
而得到最优的取样结果。
2.3
结论
本文研究结果表明，在斑茅初级核心种质构建
中，聚类取样优于随机取样。聚类取样中，叶型分
组按对数比例聚类取样
(LLC)
是分组原则、组内取样
比例和取样方法的最佳组合。在最佳总体取样量
35%
的基础上，将未入选的极值表型、丢失表型和特殊
性状
(
如抗病性
)
个体加入核心库，最终形成含
58
份材
料的初级核心库，占总资源的
39.46%
，香农多样性
指数
0.6834
，变异系数
37.577 4
，表型方差
0.494 8
，
表型频率方差
0.107 9
，表型保留比例
100%
，效率明
显优于原始库。