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分子植物育种
(
网络版
), 2010
,
8
9
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2010, Vol.8, No.9
http://mpb.
5th
.sophia
p
ublisher.com 
2
页,共
10
列已知,鉴定插入位点基因组序列容易,因此突变表
型和被突变的基因的之间的联系很容易建立,已成为
植物功能基因分离鉴定的重要策略之一
(Krishnan et
al., 2009)
。在近十年内,各国科学家在水稻中利用
T-DNA
或转座子已经创建了大量的突变体
(Martienssen 1998; Jeon et al., 2000; Wu et al., 2003;
Hirochika et al., 2004)
。虽然已经创建了大量的突变
体,然而只有
50%
的水稻基因被
标记
,因此还需要
利用各种不同的方法创建插入标签,使每一个基因都
能被
标记
”(Krishnan et al., 2009)
Tos17
是水稻中的一个内源的复制型反转录转
座子,全长
4 114 bp
,在栽培稻中含有
1-5
个拷贝
(Cheng et al., 2006)
Tos17
已被用于创建水稻转座子
插入突变体库。
Hirochika
等在
1996
年发现了
15
个水
稻中的反转录转座子,其中
Tos10
Tos17
Tos19
组培的条件下被激活。后经过大量研究后发现
Tos17
具有以下优点:
(1)
Tos17
在组培的条件下激活,分
化成植株后失活,因此
Tos17
插入引起的突变可以稳
定遗传;
(2)
Tos17
的拷贝数随着组培的时间而增多,
5
个月的组培时间下,可平均产生
10
个拷贝,可
以通过控制组织培养时间来控制转座的拷贝数;
(3)
Tos17
突变体的产生不涉及转基因过程,因此在一些
转基因控制严格的国家也可以使用。
(4)
Tos17
的转
座是随机的并能覆盖整个基因组
(Miyao et al., 2003;
Piffanelli et al., 2007)
Miyao
(2007)
构建了超过
50,000
个独立的再生植株,大约含有
500,000
个插入
位点并对突变产生的表型进行了分类。并且分离克
隆一些重要基因例如控制同源染色体配对的基因
Pair1
(Nonomura et al., 2004a)
Pair2
(Nonomura et
al., 2004b)
中花
11
号是一个典型的粳稻品种,由于其遗传
转化效率高、栽种地区适应性强,已成为我国水稻
功能基因组研究的模式品种之一。本实验室利用水
稻品种中花
11
号创建了超过
120 000
独立的
T-DNA
插入突变体
(Wu et al., 2003; http://rmd.ncpgr.cn/)
。农
杆菌介导的
T-DNA
转化经历了组培过程,研究发现
Tos17
在转化体中有新的转座
(Long et al.,
unpublished)
。然而,由于不同批次的转化植株组培
时间不一样,
Tos17
在有些批次的材料中没有转座或
转座的位点较少,难以采用高通量的方法批量鉴定
我室
T-DNA
库中
Tos17
的插入位点。同时为了丰富水
稻的突变体资源,实现水稻全基因组饱和突变体的
目标,本研究利用水稻中花
11
号为材料,创建了水
Tos17
突变体库。本研究共创建独立的水稻
Tos17
突变体
15 543
株,分离非重复插入位点侧翼序列
524
条,并对
T
1
1,881
个家系进行了表型筛选。本研究
为丰富了水稻突变体资源、发掘分离水稻重要功能
基因奠定了基础。
1
结果与分析
1.1
组织培养时间决定
Tos17
转座的拷贝数
由于不同水稻品种中
Tos17
的拷贝数不一致,
且组织培养的时间导致
Tos17
新的插入拷贝不一
样。为了研究中花
11
号及不同组织培养期限后
Tos17
的拷贝数,我们采用
Southern
杂交的方法,
利用
Tos17
的特异探针检测了不同样本中
Tos17
拷贝数。如图
1
所示,野生型中花
11
号中含有
4
个拷贝,愈伤组织继代
1
个月后分化出的植株中能
检测到
Tos17
的新拷贝,说明
Tos17
的转座在组织
培养的初期就有可能发生转座。在愈伤组织继代培
2
个月的情况下,愈伤组织分化出的植株中几乎
都含有
1
Tos17
的新拷贝。在继代
3
个月的愈伤
分化出的每个植株中都可以检测到
Tos17
新拷贝,
新拷贝数为
1-3
个。随着愈伤组织培养时间的
长,
分化出的植株的中的新拷贝数增加。考虑到要保证
植株中都含有至少一个
Tos17
的新拷贝,而且较少
的拷贝数有利于对突变体与插入标签的共分离,本
研究确定
3
个月的愈伤组织继代的再生植株来大规
模构建的
Tos17
插入突变体库。
1:
愈伤组织不同继代时间再生植株中
Tos17
的拷贝数
: Line 1-10
:继代
3
个月
; Line11-20:
继代
2
个月
; Line
21-30:
继代
1
个月
; CK:
野生型中花
11
号对照
Figure 1 The copy number of
Tos17
in the regenerated rice
plant underwent different calli culture time
Note: Line 1-10, for 3 months; Line 11-20, for 2 months; Line
21-30, for 1 month; Ck, Varity Zhonghua 11 as a control
1.2
创建
Tos17
转座突变体库
将中花
11
号成熟种子放于
N
6
培养基上,经过大
45
天左右产生胚性愈伤组织,然后挑选结构紧
实、颜色鲜黄的胚性愈伤组织转移到继代培养基上