分子植物育种
(
网络版
), 2010
年
,
第
8
卷
,
第
7
篇
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2010, Vol.8, No.7
http://mpb.
5th
.sophia
p
ublisher.com
共
5
页,第
2
页
强等特征,是一种重要的牧草和草坪兼用型草种,
在国内外农牧业和草坪业中占据重要的地位
(
黄新
等
, 2008)
。获取高质量的
RNA
是进行高羊茅分子
生物学研究的必要前提和关键技术,如目的基因的
克隆、
cDNA
文库的构建、
RT-PCR
分析、印迹杂
交分析等都需要高质量的
RNA(
赵军胜
, 2007)
。尽
管
RNA
的提取已经成为很成熟的技术,但在实际
研究中经常很难做到顺利获得高质量的
RNA(
何庆
元等
, 2009)
。对许多植物而言,由于缺乏有效的高
质量
RNA
提取方法,使其分子生物学研究受到限
制
(Bahloul and Burkard, 1993)
。由于植物体内含有
多种次生代谢产物以及蛋白质和多糖等大分子物
质,影响
RNA
的提取效率,干扰之后的逆转录、
酶切等试验,此外不同植物的代谢产物差异非常显
著,加之植物组织本身的特异性,所以很难有一种方
法适合于所有植物总
RNA
的提取
(Ainsworth, 1994)
。
目前,国内关于植物组织总
RNA
提取方法的
报道很多,绝大多数常规的植物组织总
RNA
提取
方法均存在有比较费时的缺点
(
李聪等
, 2008)
。由于
RNA
易降解,所以在操作过程中时间越短,降解的
可能性才会越小。
Trizol
试剂盒是一个省时的方法,
但价钱较为昂贵。异硫氰酸胍法是利用异硫氰酸
胍、
β-
巯基乙醇、十二烷基肌氨酸钠等使
RNase
变
性,并使
RNA
在酸性条件下游离进入水相,而变
性的
RNase
和其他的蛋白连同基因组
DNA
进入有
机相。经反复的酚氯仿抽提后的水相用异丙醇沉淀
可得高质量的
RNA
。其优点在于步骤简单,省时快
速,能同时处理多个样品
(Gasic et al., 2004)
。我们
通过对常用的异硫氰酸胍法进行改进,旨在建立一
种简单快速并适于高羊茅总
RNA
的提取方法,为
进行后续的分子生物学研究奠定基础。
1
结果与分析
1.1
不同方法提取高羊茅总
RNA
完整性检测
琼脂糖凝胶电泳检测结果显示
Trizol
法能够从
成熟的高羊茅叶片中提取出总
RNA
,
28S rRNA
与
18S rRNA
条带亮度接近于
2
:
1
,说明
RNA
未被降
解
(
见图
1A)
。
Trizol
法虽然有快速高效的特点,但
其价格昂贵,不适用于大量植物组织提取。
异硫氰酸胍法提取高羊茅总
RNA
的电泳检测
显示
(
图
1B)
:
28S rRNA
与
18S rRNA
条带均有拖尾
现象,
5S rRNA
条带较亮,说明总
RNA
有部分降
解,且存在
DNA
污染。同时点样孔有亮带,说明
蛋白质污染严重。
实验对异硫氰酸胍法进行改进后,琼脂糖凝胶
电泳检测结果显示
(
图
1C)
,点样孔中没有亮带,证
明没有蛋白质的污染,图中
28S rRNA
和
18S rRNA
两条带非常清晰,并且这两条带的亮度接近
2
:
1
,
同时
5S rRNA
条带很弱,证明总
RNA
中没有
DNA
污染,且纯度高、完整性好,没有明显的降解。
1.2
不同方法提取高羊茅总
RNA
纯度及浓度检测
吸光度比值大小直接反映多糖、多酚和蛋白质
的污染程度。由表
1
可知,采用改良后的异硫氰酸
胍法和
Trizol
法提取的总
RNA
其
OD
260
/OD
280
比值
在
1.8~2.0
之间,表明
RNA
完整性很好,可以用于
图
1
不同方法提取高羊茅叶片总
RNA
的检测结果
注
: A: Trizol
法
; B:
异硫氰酸胍法
; C:
改良的异硫氰酸胍法
Figure 1 Agarose gel electrophoresis of total RNA by different methods
Note: A: Trizol method, B: Isothiocyanate method, C: Improved isothiocyanate method