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分子植物育种
(
网络版
), 2010
,
8
,
5
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2010, Vol.8, No.5
http://mpb.
5th
.sophiapublisher.com
8
页,第
1
研究论文
Research Article
Shotgun
蛋白质组学技术在致病性烟草青枯菌分泌蛋白研究中的应用
宋浩
1
,
丁伟
2
,
沙伟
2
,
刘翀
2
,
周燕
1
,
陈薇
2
1.
湖南中烟工业有限责任公司
,
长沙
, 410014
2.
上海中科新生命生物科技有限公司
,
上海
, 200233
通讯作者
:
wchen@sibs.ac.cn;
作者
分子植物育种
, 2010
,
8
,
5
doi: 10.5376/mpb.cn.2010.08.0005
收稿日期:
2010
6
22
接受日期:
2010
9
12
发表日期:
2010
9
18
这是一篇采用
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,
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宋浩等
, 2010,
烟草青枯菌分泌蛋白
shotgun
蛋白质组学研究
,
分子植物育种
Vol .8 No.5 (doi: 10.5376/mpb.cn.2010.08.0005)
摘要
烟草青枯病是由茄科劳尔氏菌
(
Ralstonia solanacearum
)
引起的一种毁灭性的烟草种植灾害,可造成烟草的巨大减产。
本实验首次采用
shotgun
蛋白质组学技术对致病性烟草青枯菌菌株的分泌蛋白进行系统分析,结果鉴定得到了
384
个蛋白质。
按照青枯菌的致病特点和侵染过程将这
384
个蛋白分为糖蛋白、信号肽蛋白和跨膜蛋白等
7
个功能类群。其中,
17
个被前
人研究报道为与青枯菌致病相关的蛋白质,表明使用
shotgun
蛋白质组学技术可有效的分析青枯菌分泌蛋白,具有可行性和
有效性。
327
个迄今为止尚无文献报道其与青枯菌致病性相关,
40
个为未知蛋白。这些研究结果为进一步揭示青枯菌对烟草
的致病机理及抗病基因的功能克隆提供了依据。
关键词
烟草青枯菌
;
分泌蛋白
;
致病性
; Shotgun
蛋白质组学
The Application of Shotgun Proteomics in Tobacco
Ralstonia Solanacearum
Secretory Proteins
Hao Song
1
, Wei Ding
2
, Wei Sha
2
, Chong Liu
2
, Yan Zhou
1
, Wei Chen
2
1 China Tobacco Hunan Industry Co. Ltd., Changsha, 410014; 2 Shanghai Applied Protein Techology Co. LTD., Shanghai, 200233
Corresponding author, wchen@sibs.ac.cn;
Authors
This article was first published in Molecular Plant Breeding, and was distributed in Chinese under the terms of th
Abstract
Ralstonia solanacearum
(synonym pseudomonas solanacearum) is a widely spread soil-borne plant pathogen which
causes “bacterial wilt”, a major bacterial plant disease that greatly impact the production of tobacco. In this study, we analyzed the
structure and function of
Ralstonia solanacearum
secreted proteins by employing shotgun technology, and identified 384 proteins.
Base on the
pathogenic
characteristics and infection process, the 384 proteins were classified into seven clusters: such as
glycoprotein, signal peptide protein, transmembrane protein. 17 of these proteins were reported in the previous studies as
Ralstonia
solanacearum
pathogenicity proteins, 327 have been identified for the first time as pathogenicity proteins of
Ralstonia solanacearum
,
and 40 were uncharacterized proteins. This result provides us with the basic information for further studying the
pathogenic
mechanism and for conducting functional cloning of the resistant-related genes in tobacco to
Ralstonia solanacearum
.
Keywords
Tobacco Ralstonia; Solanacearum; Srcretory proteins; Pathogenicity; Shotgun proteomics
烟草青枯菌
(
Ralstonia solanacearum
)
是在世界
范围内危害烟草生产,引起烟草青枯病的主要致病
菌,致使每年烟草种植的大量减产。该病菌还会危
害其它诸如土豆,番茄等世界主要经济作物
(
李林章
, 2005)
。因此,明确青枯菌的致病机理,阐明
烟草的抗病基因功能,对高产栽培调控和抗病分子
育种都有十分重要的意义。到目前为止,国内外已
经从基因定位和分子标记辅助育种
(
扬友才等
, 2006;
Jiang et al, 2007)
、基因组序列比对
(Remenant et al.,
2010; Fujiwara et al., 2008; Guidot et al., 2007)
、转录
组学
(Guidot et al., 2009)
、蛋白质组学
(
宋浩等
, 2010;
Dahal et al., 2010)
以及抗性基因转化
(Zhang et al.,