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分子植物育种
(
网络版
), 2010
,
8
,
12
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2010, Vol.8, No.12
http://mpb. c
hin
ese.sophiapublisher.com
2
页,共
9
and improved further.
Keywords
Plant; Transcription factor; Transcriptional repressor; EAR-motif; Chimeric Repressor Gene-Silencing Technology
研究背景
转录因子
(Transcription Factor)
可分为转录激活
(Transcription Activator)
和转录抑制子
(Transcription
Repressor)
两大类
(
杜娟等
, 2008)
。转录抑制子是起
负调控作用的反式作用因子,具有防止激活子过度
激活,保证基因能够在最适的水平上表达,避免过
度表达对植物本身造成伤害或能量浪费的功能
(Hanna-Rose et al., 1996)
EAR
型转录抑制子
(EAR-
type Transcriptional Repressor)
是指含有
EAR
基序
(ERF-associated amphiphilic repression motif EAR-
motif) (Ohta et al., 2001)
或类
EAR
基序的一类植物
特有的转录抑制子。研究发现它们普遍存在于植物
体内多个蛋白家族中,在植物生长、发育、抗逆和
抗病等生理过程的调节及多种生理过程之间关系的
协调
(Hiratsu et al., 2002; Kazan et al., 2006; Ciftci-
Yilmaz et al., 2007)
等方面发挥着重要作用。
2003
年,
Hiratsu
等运用基因工程手段在激活
C
末端附加一段
EAR
基序,融合形成嵌合蛋白,
将其转变为高效的负调控子,从而提出了嵌合抑制
子基因沉默技术
(Chimeric Repressor Silencing Tech-
nology, CREST)
。后来研究表明,该技术在转录激
活子功能的快速鉴定、研究蛋白质间的相互作用和
农作物性状的改良等研究领域有着广阔的应用前景。
为了促进对
EAR
型抑制子抑制作用机理的认识,
促进
CREST
技术的发展完善,本文对有关
EAR
转录抑制子概念、功能和调控机制,以及
CREST
技术原理和应用进行综述。
1
EAR
型转录抑制子的发现及概念
Fujimoto
(2000)
克隆出了
5
个编码拟南芥
(
Arabidopsis thaliana
At)ERF(Ethylene responesive
factor)
蛋白的
cDNA
序列,分别命名为
AtERF
1
AtERF
2
AtERF
3
AtERF
4
AtERF
5
。根据对它们
所编码的蛋白氨基酸序列的比对分析结果,把它们
分为三大类:
Class I (
AtERF
1
AtERF
2)
Class II
(
AtERF
3
AtERF
4)
Class III (
AtERF
5)
。其中
AtERF
1
AtERF
2
AtERF
5
为转录激活子,而
AtERF
3
AtERF
4
是转录抑制子。同年,
Ohta
(2000)
研究发
现烟草
(
Nicotiana tabacum
Nt)
中的
NtERF3
也是一
种转录抑制子。
Ohta
(2001)
Class II
ERF
TFIII
ZFP
(Zinc Finger Protein)
转录抑制子的氨基酸序列比对分
析发现在它们序列的
C
末端都含有一个保守基序
(L/FDLN L/F(X)P)
,进一步研究表明该序列是抑制
作用所必需的,并且富含亮氨酸,具有双亲性,研
究者称之为
EAR
基序。
Hiratsu
(2002)
ZFP
族的
SUPERMAN
蛋白中发现与
ERF
基序相似的保
守序列
(DLDLEL)
,作者称之为类
EAR
基序
(EAR-like
motif)
。后来,
Tiwari
(2004)
Tsukagoshi
(2005)
又分别在
Aux/IAA(auxin/indoleacetic acid)
B3
(B3 DNA-binding domain protein)
HIS (High-Sugar
Induced)
蛋白中发现与
ERF
基序相似的保守序列
(LxLxL, I/LDLNS/FXP)
。本文用
EAR
型转录抑制
子一词表示这类含有
EAR
基序或类
EAR
基序的转
录抑制子。
2 EAR
型转录抑制子的特征
2.1 EAR
型转录抑制子的分布特征
EAR
型转录抑制子是一类普遍存在于植物界
并为植物所特有的的转录抑制子。在多种植物常见
的转录因子如
ERF
ZFP
等家族中都发现了
EAR
型转录抑制子的存在
(
1)
。由表
1
可见,
EAR
转录抑制子不仅存在于单子叶植物中,还存在于双
子叶植物中。目前,在动物界还没有发现与
EAR
基序同源的抑制序列。
2.2 EAR
型转录抑制子的序列特征
EAR
基序是
EAR
型转录抑制子的共同特征。
当缺失
EAR
基序时,转录抑制子失去抑制功能,
表明
EAR
基序是该型抑制子的抑制作用所必需的
(Ohta et al., 2001)
EAR
基序中氨基酸残基改变将
导致抑制功能的降低或缺少
(Ohta et al., 2001
Tiwari
et al., 2001,2004)
,如
AtERF
3
EAR
基序
(LDLNLA
P)
中的
D
氨基酸残基被
A
取代,将使转录抑制子失
去抑制功能
(Ohta et al., 2001)
EAR
基序富含亮氨