Page 9 - cmdr-Vol.01-No.01

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计算分子生物
(
网络版
), 2012
,
1
,
1
-
6
Jisuan Fenzi Shengwu (Online), 2012, Vol.1, 1
-
6
http://cmb.5th.sophiapublisher.com
5
参与了损伤
DNA
所在的染色质结构的松散,提高损
DNA
的修复效率。在接下来的研究中,我们将针
对损伤部位核小体松散的程度进行检测,观察
BRG1
ATP
酶活性对损伤后核小体结构调整的影响。
3
材料和方法
3.1
材料
人宫颈癌细胞株
HeLa
和人肾上腺皮质腺癌细
胞株
SW13
购自上海细胞研究所细胞库。
IMDM
培养基购自
Invitrogen
公司;四季青胎
牛血清购自杭州四季青生物工程材料有限公司;兔
源 抗
BRG1
单 克 隆 抗 体
(SMTRCA4)
购 自 于
Santacruz
公司;鼠源
Tubulin
单克隆抗体
(AR819)
购自
Sigma
公司;二抗分别为山羊抗小鼠
IgG
和山
羊抗兔
IgG
,均为
Santacruz
公司产品;
ECL
发光液
购自
GE Health
公司;凯基细胞凋亡检测试剂盒购
自南京生物科技发展有限公司。
绿色荧光蛋白质量
GFP
BRG1
真核表达质粒
pBJ5-BRG1
和载体质粒
pBJ5 (Dr. Keji Zhao, NIH,
Maryland
惠赠
)
3.2
细胞培养
人宫颈癌细胞株
HeLa
和人肾上腺皮质腺癌细胞
SW13
及用含有
10%
胎牛血清、青霉素
(100μg/mL)
和链霉素
(0.01 g/mL)
IMDM
培养基于
37
5% CO
2
的培养箱中培养。
3.3
脂质体瞬时转染
转染
24 h
,将
0.5~2×10
5
细胞接种到
500 L
含抗生素的培养基中,使转染时细胞密度达到
90%~95%
0.8 g DNA 50 L
无血清培养基中。轻混
lipofectamine
TM
2000
,取
2.0 L
混入
50 L
无血清培
养基中,温育
5 min
。将混合
DNA
lipofectamine
作用
20 min
后将
100 L
混合物加入每个含细胞的
小室内,轻混。
37
培养,转染
4~6 h
后可换液,
18~48 h
后检测。
3.4
核蛋白的提取
待细胞丰度达到
75%~80%
时,用胰酶消化并
收集细胞,
1000 r/min
离心
5 min
,去上清。将沉淀
重悬于
PBS
中,
1500 r/min
离心
5 min
。将沉淀重
悬于
400 L
冰冷的缓冲液
A (10 mmol/L Hepes-KOH,
pH 7.9, 1.5 mmol/L MgCl
2
, 10 mmol/L KCl, 1 mmol/L
DTT, PMSF)
,置冰上冰浴
30 min
NP-40
添加至终体
积的
0.6% (V/V)
,剧烈振荡
10 s
,置冰上冰浴
30 min
将沉淀的细胞核重悬于缓冲液
B ( 20 mmol/L
Hepes-KOH, pH 7.9, 1.5 mmol/L MgCl
2
, 400 mmol/L
NaCl, 0.5 mmol/L EDTA, 25%
甘油
, 1 mmol/L DTT,
PMSF)
,置于
4
摇床剧烈摇动
30 s
13 000 r/min
5 min
,核蛋白上清液于
-70
保存。
3.5 Western bloting
分析
将样品进行
SDS-PAGE
,经电转移至硝酸纤维
素膜,
5%
脱脂奶粉室温封闭
1 h
,弃溶液,加入
TBST
稀释的一抗,室温轻摇
1 h
TBST
3
次后,加入
5% BSA
稀释的二抗,室温轻摇
1 h
TBST
3
后;用
ECL
显色
5 min
,压片显影。
3.6
流式细胞仪检测凋亡
用胰酶消化并收集细胞。
PBS
洗涤细胞二次。
收集细胞,将
5 LAnnexinV-FITC
加入到含有
500 L
Binding Buffer
的细胞悬液中混匀,然后加入
5 L
propidium Iodide
混匀,
25
℃避光
5~15 min
。反应结
束后利用流式细胞仪检测。
作者贡献
通讯作者曾宪录为本研究提供了实验平台及整体的研
究框架和思路,并对论文进行了修改和定稿;王晓光进行了
实验设计并撰写论文;王蕊进行了流式检测;王玲对本文文
字和图片进行了编辑。
致谢
感谢美国
Maryland
NIH
中心的
Keji Zhao
先生惠赠
BRG1
真核表达质粒
pBJ5-BRG1
和载体质粒
pBJ5
。本研究
由国家自然科学基金
(90608021)
、吉林省自然科学基金
(201112165)
和吉林省教育厅科研基金
(
吉教科合字
2012
221
)
共同资助。
参考文献
Alessio N., Squillaro T., Cipollaro M., Bagella L., Giordano A.,
and Galderisi U., 2010, The BRG1 ATPase of chromatin
remodeling complexes is involved in modulation of
mesenchymal stem cell senescence through RB-P53
pathways, Oncogene, 29(40): 5452-5463 http://dx.doi.org/
10.1038/onc.2010.285 PMid:20697355
Bergink S., Salomons F.A., Hoogstraten D., Groothuis T.A., de
Waard H., Wu J., Yuan L., Citterio E., Houtsmuller A.B.,
Neefjes J., Hoeijmakers J.H., Vermeulen W., and Dantuma
N.P., 2006, DNA damage triggers nucleotide excision
repair-dependent monoubiquitylation of histone H2A,
Genes Dev., 20(10): 1343-1352 http://dx.doi.org/10.1101/
5TH