分子植物育种 - page 6

分子植物育种
(
网络版
), 2016
,
14
,
1048-1054
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2016, Vol.14, 1048-1054
Copyright © 2016 BioPublisher 1050
主要来自于居群内部,辐照群体内的遗传分化大于
辐照群体间。分子方差变异分析
(AMOVA)
结果
(
4)
,也再次证实,总的遗传变异中有
78.9%
的变异
存在于辐照群体内,
0.5%
发生在辐照群体间,
20.6%
发生在组间。
1.3
遗传距离和聚类分析
通过
(
5)
可以看出经过辐照处理的
3
个辐照
群体间遗传距离近,相似程度高,而对照群体与之
相距较远,相似程度略低。从辐照群体关系聚类图
(
1)
中可看出,
4
个辐照群体聚为
2
支:一支包括
3
个辐照处理辐照群体;另一支为对照群体,其
中辐照剂量高的
2
个辐照群体先聚为一类,然后再
与辐照群体
1(
辐照剂量低
)
相聚。
4
个辐照群体的聚
类结果表现出了明显的特征。
3
辐照群体的遗传结构分析
Table 3 Nei’s analysis of genetic diversity of irrigation populations
居群总遗传多样性
Total gene
diversity (
Ht
)
居群内遗传多样性
Gene diversity within
population (
Hs
)
各居群间的遗传分化指数
The coefficient of gene
differentiation (
Gst
)
基因流
Indicates gene
flow (Nm)
平均值
Mean
0.264 4
0.207 8
0.214 0
1.836 0
标准差
SD
0.033 8
0.018 1
4
分子变异的
AMOVA
分析
Table 4 Analysis of molecular variance (AMOVA) within/among irrigation populations
变异来源
Source of variation
自由度
d. f.
平方和
Sum of squares
方差组分
Variance
components
方差比率
Percentage
of variation
Fst
P
-value
组间
Among groups
1
0.201
0.110 00 Va
20.6
组内辐照群体间
Among irrigation
populations
2
0.733
0.002 72 Vb
0.5
辐照群体内
within groups
58
24.000
0.421 05 Vc
78.9
总变异
Within irrigation
populations
61
24.934
0.533 77
0.211
0.050
: Va:
组间变异组分
; Vb:
辐照群体间变异组分
; Vc:
辐照群体内变异组分。
Note: Va: Varinance components among groups; Vb: Varinance components among irrigation populations; Vc: Varinance components
within irrigation population
5
辐照群体的遗传相似系数
(
上三角
)
及遗传距离
(
下三角
)
Table 5 Nei’s genetic identity (
Id
) (above diagonal) and genetic
distance (
D
) (below diagonal) of 5 populations
1
2
3
4
1
****
0.963 6
0.982 4
0.883 5
2
0.037 1
****
0.989 5
0.819 2
3
0.017 8
0.010 5
****
0.859 5
4
0.123 9
0.199 4
0.151 4
****
1 UPGMA
法构建的试验群体的聚类
Figure 1 Dendrogram of tested strawberry clustered using UPGMA
1.4
单倍型分析
62
个样本共享
19
个单倍型,它们在各群体中的
分布表
6
。根据遗传相似度通过
UPGMA
聚类
(
2)
1,2,3,4,5 7,8,9,10,11,12
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