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分子植物育种
(
网络版
), 2016
,
14
,
1029
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1034
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2016, Vol.14, 1029
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Copyright © 2016 BioPublisher 1031
1 DataFormater
软件的数据处理流程图
Figure 1 Flow chart of data processing for DataFormater
1.3
用户界面
该软件提供了友好的图形用户界面,其主界面
为典型的窗口程序布置
(
2;
3)
。最上方为标题
栏,其下为菜单栏和工具栏,再下方为显示用户数
据的窗体表格,最下方是状态栏。通过“文件”菜
单可以从磁盘读取数据,或保存数据到磁盘;通过
“工具”菜单可以调用软件提供的各种数据处理功
能;通过“转换”菜单下的各命令,可以直接从用
户数据生成目标软件的输入文件。因此,在未加载
用户数据时,“转换”菜单下的命令呈不可用状态。
软件的工具栏则提供了常用数据处理和数据转换
命令的快捷访问。
2 DataFormater
软件的用户界面
Figure 2 User interface of DataFormater
3 DataFormater
软件的命令菜单
Figure 3 Command menu of DataFormater
1.4 DataFormater
软件的使用方法
1.4.1
读取“
01
带型”格式的用户数据
01
带型”格式的用户数据必须首先转换成
bp
值型”格式的原始数据后才能进行下一步的
数据处理或数据转换。因此,打开
DataFormater
件,点击用户界面工具栏中“
01
bp
”按钮,选
择需进行“
01
bp
”的用户原始数据,如果原始
数据中无格式错误,软件将自动把用户数据变换为
bp
值型”格式。如果用户数据中存在格式错误,
软件将给出相应的提示,用户可根据提示修改相应
的错误,并重复“
01
bp
”直至成功。
1.4.2
过滤稀有等位
如果需要过滤稀有等位位点,则在打开“
bp
型”用户原始数据后,点菜单栏
“工具”菜单中
的“过滤稀有等位”菜单项,在弹出的对话框中输
入要过滤的稀有等位频率,接着点击“确认变更”
菜单项完成稀有等位过滤。过滤后的数据还可进一
步过滤无多态的位点或者保存数据到磁盘文件。
1.4.3
用户数据到输入文件的生成
当用户数据正确读取后,该软件就可以根据用
户的原始数据直接生成各种分析软件的输入文件。
例如,若生成
PowerMarker
软件的数据输入文件,
就点击菜单栏“转换”菜单中的“
PowerMarker
菜单项,或工具栏中“
PowerMarker
”快捷按钮,
在弹出的“保存”对话框中选择保存文件的目录
和文件名即可。生成其他软件输入文件的操作步骤
以此类推。
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