 
          分子植物育种
        
        
          (
        
        
          网络版
        
        
          ), 2016
        
        
          年
        
        
          ,
        
        
          第
        
        
          14
        
        
          卷
        
        
          ,
        
        
          第
        
        
          1072
        
        
          -
        
        
          1079
        
        
          页
        
        
          Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2016, Vol.14, 1072
        
        
          -
        
        
          1079
        
        
        
          Copyright © 2016 BioPublisher                                                                            1076
        
        
          的遗传差异较小,亲缘关系较近,遗传背景相对狭
        
        
          窄。研究结果与郭晶心等
        
        
          (2002)
        
        
          、刘冬媛等
        
        
          (2014)
        
        
          和楼钰张等
        
        
          (2015)
        
        
          研究认为白菜类蔬菜之间的遗传
        
        
          背景很复杂的观点相反,这可能与采用的标记技术
        
        
          不同和所选的材料不同有关。由于原始的白菜类蔬
        
        
          菜品种已经在自然选择过程中被淘汰,加之人们在
        
        
          种植过程中倾向性地选择,从而导致了其遗传背景
        
        
          相对狭窄。在今后的白菜类蔬菜的育种过程中,应
        
        
          注重育种材料遗传基础的扩增,并加强白菜类蔬菜
        
        
          与其近缘植物的基因交流以扩宽其种质基础。
        
        
          过程中有更多可供选择和利用的基因,了解育
        
        
          种材料的遗传差异,有利于育种中扩大种质来源以
        
        
          及更好地利用种质资源
        
        
          (
        
        
          楼珏张等
        
        
          , 2015)
        
        
          。从
        
        
          Chs
        
        
          基
        
        
          因序列对比结果来看,
        
        
          11
        
        
          份白菜类蔬菜的
        
        
          Chs
        
        
          基因
        
        
          序列没有大于
        
        
          3 bp
        
        
          的插入
        
        
          /
        
        
          缺失,说明白菜类蔬菜
        
        
          的
        
        
          Chs
        
        
          基因是一个非常保守的基因,在进化过程中
        
        
          发生变异的可能性小。从系统发育树来看,
        
        
          11
        
        
          份白
        
        
          菜类蔬菜材料分为两大类。从网状进化式样的分析
        
        
          看,
        
        
          11
        
        
          份白菜类蔬菜也被分为两类,但它们的网状
        
        
          支系距离都很短。从
        
        
          MJ
        
        
          网状支系分析结果看,可
        
        
          将
        
        
          11
        
        
          份白菜类蔬菜分为两类且每个品种之间的
        
        
          变异结点较近。以上研究结果均表明,
        
        
          11
        
        
          份白菜
        
        
          类蔬菜之间的遗传差异较小,亲缘关系较近,遗
        
        
          传背景相对狭窄。研究结果与郭晶心等
        
        
          (2002)
        
        
          、
        
        
          刘冬媛等
        
        
          (2014)
        
        
          和楼钰张等
        
        
          (2015)
        
        
          研究认为白菜
        
        
          类蔬菜之间的遗传背景很复杂的观点相反,这可
        
        
          能与采用的标记技术不同和所选的材料不同有
        
        
          关。由于原始的白菜类蔬菜品种已经在自然选择
        
        
          过程中被淘汰,加之人们在种植过程中倾向性地
        
        
          选择,从而导致了其遗传背景相对狭窄。在今后
        
        
          的白菜类蔬菜的育种过程中,应注重育种材料遗
        
        
          传基础的扩增,并加强白菜类蔬菜与其近缘植物
        
        
          的基因交流以扩宽其种质基础。
        
        
          2.2
        
        
          白菜类蔬菜系统发育关系分析
        
        
          白菜类蔬菜在中国广泛种植且与人们的生产
        
        
          生活息息相关。许多学者在白菜类蔬菜的分类及起
        
        
          源等方面做了大量研究。本研究将供试的白菜类蔬
        
        
          菜材料分为两大类,第一类包括山东白菜、塌棵菜、
        
        
          雅安白菜、紫菜苔、重庆白菜和伊犁野生油菜,相
        
        
          对较进化;第二类包括广西菜心、青菜、雅安黄油
        
        
          菜、芜菁和涪陵野生油菜,相对较原始。结果表明
        
        
          结球白菜和不结球白菜并未完全的分开,塌棵菜和
        
        
          结球白菜聚在一起,重庆白菜和伊犁野生油菜聚在
        
        
          一起,这与孙德岭等
        
        
          (2001)
        
        
          认为结球白菜与不结球
        
        
          白菜遗传差异较大的结果不一致。芜菁和不结球白
        
        
          菜聚在一起,与孙德岭等
        
        
          (2001)
        
        
          、郭晶心等
        
        
          (2002)
        
        
          和林建丽等
        
        
          (2008)
        
        
          的研究认为芜菁与其它白菜类蔬
        
        
          菜遗传差异较大的观点不一致。在大白菜的起源、
        
        
          进化方面有两种观点,一种观点认为大白菜是由小
        
        
          白菜与芜菁自然杂交进化而来,另一种观点认为大
        
        
          白菜是从普通白菜中分化而来
        
        
          (
        
        
          郭晶心,
        
        
          2002)
        
        
          。本
        
        
          研究网状支系分析中网状结构图没有显示明显的
        
        
          星状结构,说明所选材料中没有白菜类蔬菜进化的
        
        
          共同祖先,
        
        
          11
        
        
          份白菜类蔬菜之间都是平行进化的。
        
        
          从网状进化式样分析中发现供试的不同白菜类蔬
        
        
          菜变种间除了支状的进化关系外,不同白菜类蔬菜
        
        
          变种间还存在大量的网状进化关系,说明在白菜类
        
        
          蔬菜栽培、驯化中存在较多的杂交事件。这可能与
        
        
          白菜类蔬菜品种之间不存在生殖隔离,可以相互杂
        
        
          交有关。研究结果支持谭起猛的
        
        
          “
        
        
          分化起源
        
        
          ”
        
        
          假说,
        
        
          认为现代栽培的白菜类蔬菜是由更加原始祖先进
        
        
          化而来。
        
        
          3
        
        
          材料与方法
        
        
          3.1
        
        
          试验材料
        
        
          以
        
        
          11
        
        
          份具代表性的白菜类蔬菜品种、
        
        
          1
        
        
          份新疆
        
        
          黑芥品种、
        
        
          2
        
        
          份甘蓝类蔬菜品种和
        
        
          2
        
        
          份萝卜属品种
        
        
          作为研究材料
        
        
          (
        
        
          表
        
        
          1)
        
        
          。
        
        
          3.2 DNA
        
        
          提取
        
        
          在培养箱中发芽供试材料种子,各材料取黄化
        
        
          幼苗叶片约
        
        
          3 g
        
        
          在液氮中研磨,采用
        
        
          2×CTAB
        
        
          法抽
        
        
          提并纯化基因
        
        
          DNA (Doyle and Doyle, 1986)
        
        
          。
        
        
          3.3 PCR
        
        
          扩增及
        
        
          DNA
        
        
          测序
        
        
          经过
        
        
          PCR
        
        
          扩增后,得到的片段是
        
        
          Chs
        
        
          基因的
        
        
          第
        
        
          1
        
        
          和
        
        
          2
        
        
          外显子,序列长度大在
        
        
          1 200 bp
        
        
          左右。
        
        
          Chs
        
        
          基因扩增引物序列为:
        
        
          Chs-F: 5'-CTTCATCTG
        
        
          CCCGTCCATCATACC-3'
        
        
          ,
        
        
          Chs-R: 5'-GGAACGCT
        
        
          GTGCAAG AC-3'(Zhang
        
        
          等
        
        
          , 2010)
        
        
          ,
        
        
          PCR
        
        
          扩增体系
        
        
          为:
        
        
          12.5 μL 2×
        
        
          Taq
        
        
          MasterMix
        
        
          ,上、下引物各
        
        
          2 μL
        
        
          ,
        
        
          DNA 1 μL
        
        
          ,
        
        
          RNase Free Water 7.5 μL
        
        
          ,共
        
        
          25μl
        
        
          。
        
        
          将
        
        
          PCR
        
        
          扩增程序为:
        
        
          95
        
        
          ℃变性
        
        
          5 min
        
        
          ,
        
        
          1
        
        
          个循环;
        
        
          95
        
        
          ℃变性
        
        
          60 s
        
        
          ,
        
        
          55
        
        
          ℃退火
        
        
          60 s
        
        
          ,
        
        
          72
        
        
          ℃延伸
        
        
          2 min
        
        
          ,
        
        
          35
        
        
          个循环;
        
        
          72
        
        
          ℃延伸
        
        
          10 min
        
        
          ;
        
        
          12
        
        
          ℃保存。电泳后
        
        
          利用
        
        
          AxyPrep DNA
        
        
          凝胶回收试剂盒对目的
        
        
          PCR
        
        
          产
        
        
          物进行回收和纯化。并将纯化后的扩增产物连接到
        
        
          质粒载体
        
        
          PMD18-T(TaKaRa)
        
        
          上,再转染感受态大肠
        
        
          杆菌菌株
        
        
          DH5a
        
        
          ,在含有氨苄青霉素的培养基上培
        
        
          养大肠杆菌感受态菌株,挑取
        
        
          3~5
        
        
          个阳性克隆,最
        
        
          后再进行
        
        
          DNA
        
        
          测序。测序由上海生工生物工程有
        
        
          限公司完成。
        
        
          用
        
        
          DNAman6.0
        
        
          进行序列比对,设计不同基因
        
        
          组
        
        
          Chs
        
        
          基因的特异引物。筛选到
        
        
          A
        
        
          基因组特异引物
        
        
          为
        
        
          5'-GCA TTG ATC AAC CTC TTG TAA CT-3' (
        
        
          上
        
        
          引物
        
        
          )
        
        
          ,
        
        
          5'-GGA ACG CTG TGC AAG AC-3' (
        
        
          下引
        
        
          物
        
        
          )
        
        
          。
        
        
          B
        
        
          基因组特异引物为:
        
        
          5'-TTG CAT AAA GTC
        
        
          ACA CAT CC-3'(
        
        
          上引物
        
        
          )
        
        
          ,
        
        
          5'-GGA ACG CTG TGC
        
        
          AAG AC-3' (
        
        
          下引物
        
        
          )
        
        
          。