12 - cmb-2012, Vol. 1, No. 2页

基本HTML版本

计算分子生物学
(
网络版
), 2012
,
1
,
2
,
7
-1
5
Jisuan Fenzi Shengwuxue (Online), 2012, Vol.1, No.2, 7
-
15
http://cmb.5th.sophiapublisher.com
15
续附录
1
Continuing
supplement 1
物种
Organism
登录号
Accession
分类
ID
TaxaID
进化谱系
NCBI Lineage
Clostridium perfringens
str
.
13
NC_003366
195102
F.2.1.1.2.7
Clostridium tetani
E88
NC_004557
212717
F.2.1.1.2.8
Bartonella bacilliformis
KC583
NC_008783
360095
P.1.1.1.1.1
Bartonella henselae
str
.
Houston
-
1
NC_005956
283166
P.1.1.1.1.2
Bartonella quintana
str
.
Toulouse
NC_005955
283165
P.1.1.1.1.3
Bartonella tribocorum
CIP 105476
NC_010161
382640
P.1.1.1.1.4
Bradyrhizobium
sp
.
ORS278
NC_009445
114615
P.1.1.2.1.1
Mesorhizobium
sp
.
BNC1
NC_008254
266779
P.1.1.3.1.1
Mesorhizobium loti
MAFF303099
NC_002678
266835
P.1.1.3.2.1
Agrobacterium tumefaciens
str
.
C58
NC_003304
176299
P.1.1.4.1.1
Dinoroseobacter shibae
DFL 12
NC_009952
398580
P.1.2.1.1.1
Ruegeria pomeroyi
DSS
-
3
NC_003911
246200
P.1.2.1.2.1
Anaplasma phagocytophilum
HZ
NC_007797
212042
P.1.3.1.1.1
Anaplasma marginale
str
.
St. Maries
NC_004842
234826
P.1.3.1.1.2
Ehrlichia canis
str
.
Jake
NC_007354
269484
P.1.3.1.2.1
Ehrlichia chaffeensis
str
.
Arkansas
NC_007799
205920
P.1.3.1.2.2
Ehrlichia ruminantium
str
.
Welgevonden
NC_005295
254945
P.1.3.1.2.3
Acidovorax avenae
subsp.
citrulli
AAC00
-
1
NC_008752
397945
P.2.1.1.1.1
Acidovorax
sp. JS42
NC_008782
232721
P.2.1.1.1.2
Rhodoferax ferrireducens
T118
NC_007908
338969
P.2.1.1.2.1
Polaromonas naphthalenivorans
CJ2
NC_008781
365044
P.2.1.1.3.1
Polaromonas
sp
.
JS666
NC_007948
296591
P.2.1.1.3.2
Verminephrobacter eiseniae
EF01
-
2
NC_008786
391735
P.2.1.1.4.1
Aeromonas hydrophila
subsp
. hydrophila
ATCC 7966
NC_008570
380703
P.3.1.1.1.1
Aeromonas salmonicida
subsp.
salmonicida
A449
NC_009348
382245
P.3.1.1.1.2
Actinobacillus pleuropneumoniae
L20
NC_009053
416269
P.3.2.1.1.1
Haemophilus ducreyi
35000HP
NC_002940
233412
P.3.2.1.2.1
Pasteurella multocida
subsp.
multocida str.
Pm70
NC_002663
272843
P.3.2.1.3.1
Desulfovibrio vulgaris
str. Hildenborough
NC_002937
882
P.4.1.1.1.1
Desulfovibrio vulgaris
subsp.
vulgaris
DP4
NC_008751
391774
P.4.1.1.1.1
Geobacter metallireducens
GS
-
15
NC_007517
269799
P.4.2.1.1.1
Geobacter sulfurreducens
PCA
NC_002939
243231
P.4.2.1.1.2
Anaeromyxobacter dehalogenans
2CP-C
NC_007760
290397
P.4.3.1.1.1
Anaeromyxobacter
sp
.
Fw109
-
5
NC_009675
404589
P.4.3.1.1.2
Campylobacter jejuni
subsp
. jejuni
81116
NC_009839
407148
P.5.1.1.1.1
Campylobacter jejuni
RM1221
NC_003912
195099
P.5.1.1.1.1
Acholeplasma laidlawii
PG
-
8A
NC_010163
441768
T.1.1.1.1.1
Aster yellows witches'-broom phytoplasma
AYWB
NC_007716
322098
T.1.1.1.2.1
Mesoplasma florum
L1
NC_006055
265311
T.1.2.1.1.1
Mycoplasma capricolum
subsp.
capricolum
ATCC 27343
NC_007633
340047
T.1.3.1.1.1
Mycoplasma agalactiae
PG2
NC_009497
347257
T.1.3.1.1.2
Mycoplasma gallisepticum
str. R(low)
NC_004829
710127
T.1.3.1.1.3
Mycoplasma genitalium
G37
NC_000908
243273
T.1.3.1.1.4
Mycoplasma hyopneumoniae
7448
NC_007332
262722
T.1.3.1.1.5
Mycoplasma mobile
163K
NC_006908
267748
T.1.3.1.1.6
Mycoplasma penetrans
HF
-
2
NC_004432
272633
T.1.3.1.1.7
Mycoplasma pneumoniae
M129
NC_000912
272634
T.1.3.1.1.8
Mycoplasma pulmonis
UAB CTIP
NC_002771
272635
T.1.3.1.1.9
Mycoplasma synoviae
53
NC_007294
262723
T.1.3.1.1.10
Ureaplasma parvum serovar
3 str
.
ATCC 700970
NC_002162
273119
T.1.3.1.2.1