Page 23 - 2011no43

Basic HTML Version

叶春秀等
, 2011,
应用
RAPD
分析新疆六个核桃品种的遗传多样性
,
分子植物育种
Vol.9 No.43 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0043)
1330
µL
dNTPs (10 mmol/L) 0.5 µL
,引物
1.87 µL
Taq
(5 U/µL) 0.2 µL
DNA
模板
(20 ng/µL)1.5 µL
ddH
2
O 18.43 µL
。扩增反应程序为
:94
℃预变性
5
min
94
℃变性
1 min
36
℃退火
1 min
72
℃延伸
90s
,共
42
个循环;
72
℃延伸
7 min
。在冰盒上加完
反应物后在微型离心机上微甩放入
PCR
仪中进行反
应,反应完成后取扩增产物
10 µL
点入含
EB
1.2%
的凝胶中电泳,然后在凝胶成像分析仪下观察并记
录结果。
3.2.3
数据处理
RAPD
扩增实验重复
2
次,统计所有能产生多态
性位点的引物在六个核桃品种母本和
F
1
代单株上扩
增的总带数和多态性条带数。在电泳图谱同一
RAPD
位点上有电泳带的记为
“1”
,无带的记为
“0”
,做
[0
1]
矩阵输入计算机,统计总带数,共有带,计算多态
性:多态性
=(
总带数
-
共有带
)/
总带数,采用
SPSS 16.0
软件进行分析,用欧式距离平方法计算遗传距离
(D)
,根据遗传距离采用非加权类平均法
(UPGMA
)
构建聚类分析图,对结果进行统计与分析。
作者贡献
叶春秀、牛建新是本研究的实验设计和实验研究执行
人;叶春秀完成实验操作及数据分析,论文初稿的写作;吕
建强、王林、李荣、张虎平参与实验设计,结果分析;牛建
新是项目的构思者及负责人,指导实验设计,数据分析,论
文写作与修改。全体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
本研究由国家自然科学基金
(30560090)
资助。作者感谢
实验室同学在实验中给予的帮助和建议,感谢石河子大学果
树生物技术实验室给予的技术支持。感谢同行评审人给予的
评审建议和修改意见。
参考文献
Guo C.Y., Huang J.Q., Wang Z.J., and Fang Y.M., 2006,
RAPD analysis for natural population genetic structure
of Carya cathayensis, Nanjing Nongye Daxue Xuebao
(Nanjing Agricultural Sciences), 29(3): 12-17 (
郭传友
,
黄坚钦
,
王正加
,
方炎明
,
山核桃天然群体遗传结构
RAPD
分析
,
南京农业大学学报
, 29(3): 12-17)
Jin Q., Yang Y., Wang X.J., Wu C.Y., and Guo L., 2009,
Analysis of
Juglans
varieties of Xinjiang Province by
AFLP, Jiangsu Nongye Kexue (Jiangsu Agricultural
Sciences), 2: 28-31 (
金强
,
杨 宇
,
王新建
,
吴翠云
,
, 2009,
新疆核桃种质资源遗传多样性
AFLP
分析
,
江苏农业科学
, 2: 28-31)
Li G.H., 2007, Studies on germ plasm resources of walnuts,
Thesis for D.C., Agricultural University of Sichuan,
Supervisor: Yang D.S., and Hu T.X., pp.1 (
李国和
, 2007,
核桃种质资源研究
,
博士学位论文
,
四川农业大学
,
导师
:
杨冬升
,
胡庭兴
, pp.1)
Lin P.J., and Cui N.R., 2000, Researching wild fruit resources
of TianShan and YiLi, Beijing: Publishing Forest Press,
pp.178-192(
林培均
,
崔乃然
, 2000,
天山野果林资源
-
伊犁野果林综合研究
,
北京
:
中国林业出版社
,
pp.178-192)
Liu X.L., and Chen X.S., 2008, Analysis of three walnut
group’s heredity by SSR, Guoshu Xuebao (Journal of
Fruit Science), 25(4): 526-530 (
刘晓丽
,
陈学森
, 2008,
普通核桃
(Juglansregia)
3
个群体遗传结构的
SSR
分析
,
果树学报
, 25(4): 526-530)
Proberki S.L., Bailey G., and Baum R.B., 1997, Modification of
a CTAB extraction protocol for plant containing high
polysaccharide and polyphone components, Plant Mol.
Rep., 12: 8-15
Wang B.Q., 2007, Study on genetic diversity of Juglans in the
western of Sichuan province, Thesis For M.S.,
Agriculture University of Nei Meng-gu, Supersor:
Zhang M.T., pp.25 (
王宝庆
, 2007,
四川西部核桃属植
物遗传多样性研究
,
硕士学位论文
,
内蒙古农业大学
,
导师
:
张明铁
, pp.25)
Wang H.X., 2006, Analysis of Genetic Diversity and
Establishment of Core Collection of Walnut Varieties
with AFLP Markers, Thesis For D.C., Agriculture
University of Hebei, Supervisor: Zhang Z.H.,pp.56 (
红霞
, 2006,
核桃遗传多样性分析及核心种质的构建
,
博士学位论文
,
河北农业大学
,
导师:张志华
, pp.56)
Wu Y.M., Liu Y., and Dong F.X., and Xi S.K., 2000, Study on
different ecological types of Chinese walnut using RAPD
markers, Beijing Linye Daxue Xuebao (Journal of
Forestry University of Beijing), 22(5): 23-27 (
吴燕民
,
刘英
,
董凤祥
,
奚声珂
, 2000,
应用
RAPD
对我国栽培
核桃不同地理生态型的研究
,
北京林业大学学报
,
22(5): 23-27)