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王艳敏等
, 2011,
山杨种源遗传多样性的
SSR
分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.27 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0027)
1200
(
4)
Nei
遗传多样性指数的变化范围在
0.4421~
0.5944
之间,其中江山娇种源最低,湖上种源最高。
1.4
山杨各种源间的遗传分化分析
6
个山杨种源间的基因分化指数
G
st
0.1143
基因流系数
N
m
1.9366
。山杨种源内的遗传多样
性占总群体的
88.57%
,种源间遗传多样性占总群
体的
11.43%
,这说明山杨种源内变异占较大比例。
1.5
山杨各种源间的聚类分析
山杨种源间的遗传一致度
(
I
)
和遗传距离
(
D
)
5
。从表中可以看出,遗传一致度
(
I
)
和遗传距
(
D
)
的变化范围分别为
0.6079~0.9801
0.0201~
0.4978
。其中,湖上种源与江山娇种源的遗传距离
最小,曙光种源与方正种源的遗传距离最大。
由遗传相似系数,进行
UPGMA
聚类分析,
构建出
6
个不同山杨种源的遗传关系图
(
2)
。其
中,湖上种源和江山娇种源的遗传距离比较近,
聚为一类,方正种源与苇河种源距离比较近,聚
为一类。
2
讨论
应用分子标记研究生物间的遗传关系时,引物
数目和标记位点数对研究结果会有一定的影响。从
理论上讲,所用引物数目越多、检测的位点数越多,
提供的信息越可靠。但在实际操作中,受生物本身
情况及时间、经费等因素制约,供分析利用的引物
等采用
5
SSR
引物对
52
个山杨杂种无性系进行
了遗传多样性检测,结果表明在研究的
5
个位点上
4
不同山杨种源的基因杂合度
Table 4 Genic heterozygosity frequency of different origins of
P. davidiana
resources
种源
Provenance
观察纯合度
Obs_Hom
观察杂合度
Obs_Het
总体期望纯合度
Exp_Hom*
总体期望杂合度
Exp_Het*
基因多样度
Nei**
平均基因杂合度
Ave_Het
方正
FZ
0.4626
0.5374
0.4070
0.5930
0.5879
0.5126
湖上
HS
0.3917
0.6083
0.3904
0.6096
0.5944
0.5126
江山娇
JSJ
0.5167
0.4833
0.5466
0.4534
0.4421
0.5126
苇河
WH
0.4786
0.5214
0.4670
0.5330
0.5262
0.5126
铁力
TL
0.4917
0.5083
0.5459
0.4541
0.4427
0.5126
曙光
SG
0.4252
0.5748
0.5126
0.4874
0.4825
0.5126
总计
Total
0.4579
0.5421
0.4029
0.5971
0.5957
0.5126
5
山杨种源间遗传距离
(
下三角
)
与遗传相似度
Table 5 Nei's genetic distance (below diagonal) and genetic identity of provenances of
P. davidiana
ID
FZ
HS
JSJ
WH
TL
SG
FZ
****
0.7894
0.6887
0.7065
0.6369
0.6079
HS
0.2365
****
0.9801
0.9431
0.8822
0.9279
JSJ
0.3729
0.0201
****
0.9650
0.9114
0.9623
WH
0.3474
0.0586
0.0357
****
0.9550
0.9552
TL
0.4511
0.1254
0.0928
0.0460
****
0.8732
SG
0.4978
0.0748
0.0385
0.0458
0.1356
****