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王艳敏等
, 2011,
山杨种源遗传多样性的
SSR
分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.27 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0027)
1199
表
2 6
对有效引物在
6
个种源中的扩增情况
Table 2 The amplification result of 6 effective primers in 6
provenances
引物名称
Primer code
扩增条带数
Number of amplified bands
多态性条带数
Number of polymorphic bands
多态位点百分率
(%)
Percentage of polymorphic loci (%)
PN1297289
4
4
100.00
PN1297291
4
4
100.00
PMGC-2675
7
7
100.00
PTR14
7
7
100.00
WPMS01
3
3
100.00
WPMS011
4
4
100.00
合计
Total
29
29
均值
Mean
4.83
4.83
100.00
1.3
山杨遗传多样性分析
利用
PopGen32
软件对山杨种源进行遗传多样
性分析，由表
3
可知，山杨总体的
Shannon
指数为
1.1001
，各个种源的
Shannon
多态性信息指数变化
范围在
0.7508~1.1111
之间，其中方正种源最大，铁
力种源最小。
Shannon
指数总体平均值为
0.9038
。
根据
Shannon
指数各种源排序为：方正＞湖上＞苇
河＞曙光＞江山娇＞铁力。山杨种源总的
Nei
遗传
多样性指数为
0.5957
，不同种源的
Nei
指数分布在
0.4421~0.5944
范围内。不同种源根据
Nei
指数排列
的顺序与
Shannon
指数排列的顺序基本上一致。
表
3
山杨
6
个种源的多态性及遗传差异统计
Table 3 The polymorphic loci and genetic diversity in 6 provenances of
P. davidiana
种源
Provenance
多态位点比率
Percent of polymaorphic loci
等位基因数
Na
*
有效等位基因数
Ne
*
Shannon
指数
I
*
Nei
指数
H
*
方正
FZ
100.00
4.5000
2.9472
1.1111
0.5879
湖上
HS
100.00
3.6667
2.6562
1.0596
0.5944
江山娇
JSJ
100.00
3.0000
1.9874
0.7528
0.4421
苇河
WH
100.00
3.3333
2.2728
0.9042
0.5262
铁力
TL
100.00
3.0000
2.0664
0.7508
0.4427
曙光
SG
100.00
3.3333
2.1635
0.8443
0.4825
总计
Total
100.00
5.0000
2.6951
1.1001
0.5957
由表
4
可以看到：山杨的平均基因杂合度
(Ave_Het)
为
0.5126
。总体期望杂合度
(Exp_Het*)
为
0.5971
，不同种源间的变化范围为
0.4534~0.6096
，
其中江山娇种源最低，湖上种源的期望杂合度的值
最高。总体期望纯合度
(Exp_Hom*)
为
0.4029
，不同
种源间的变化范围为
0.3904~0.5466
，其中湖上种源
最低，江山娇种源最高。观察杂合度
(Obs_Het)
在
0.4833~0.6083
之间，其中江山娇种源最低，湖上种
源最高。观察纯合度
(Obs_Hom)
变化范围为
0.3917~0.5167
，其中湖上种源最低，江山娇种源最