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水生生物研究
, 2012
年
,
第
1
卷
,
第
1-6
页
Shuisheng Shengwu Yanjiu, 2012, Vol.1, 1-6
http://aor.5th.sophiapublisher.com
1
研究报告
A Letter
中华鳖
5
个群体遗传多样性的微卫星分析
刘阳
1,2
,
史燕
1
,
朱新平
1,2
,
赵建
1
,
周贵谭
3
,
洪孝友
1
1.
中国水产科学研究院珠江水产研究所
,
农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室
,
广州
, 510380
2.
上海海洋大学水产与生命学院
,
上海
, 201306
3.
广东绿卡实业有限公司
,
东莞
, 523912
通讯作者
:
zhuxinping_1964@yahoo.com.cn
作者
水生生物研究
, 2012
年
,
第
1
卷
,
第
1
篇
doi: 10.5376/aor.cn.2012.01.0001
本文首次发表在《基因组学与应用生物学》
(2012
年第
31
卷第
2
期
141-146
页
)
上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用
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引用格式
(
中文
)
：
刘阳等
, 2012,
中华鳖
5
个群体遗传多样性的微卫星分析
,
水生生物研究
Vol.2 No.1 pp.1-6 (doi: 10.5376/aor.cn.2012.01.0001)
引用格式
(
英文
)
：
Liu et al., 2012, Genetic Diversity in Five Populations of Trionyx sinensis Revealed by Microsatellite Markers, Shuisheng Shengwu Yanjiu (Aquatic
Organism Research) Vol.1 No.1 pp.1-6 (doi: 10.5376/aor.cn.2012.01.0001)
摘
要
利用微卫星分子标记技术对洞庭
(DT)
、黄河
(HH)
、黄沙
(HS)
、日本
(RB)
以及洞庭
(DT)
与黄河
(HH)
的杂交子代
(DT
♀×
HH
♂
)
绿卡
(LK)5
个中华鳖群体的
150
个个体进行遗传多样性分析。
11
对微卫星引物扩增出的等位基因数为
3~6
个，
平均等位基因数为
4.181 8
。五个种群相比，绿卡
(LK)
的平均有效等位基因数、平均期望杂合度、平均观测杂合度和平均多
态信息含量最高，分别是
2.396 9
、
0.527 4
、
0.554 5
和
0.466 0
。对种群间的遗传分化分析表明，黄河
(HH)
和洞庭
(DT)
之间的
遗传分化最小，为
0.0233
，而洞庭
(DT)
和日本
(RB)
之间的遗传分化最大，为
0.096 9
。基于
Nei's
遗传距离构建的
UPGMA
系
统进化树显示黄河
(HH)
和洞庭
(DT)
及其子代绿卡
(LK)
亲缘关系较近，而与黄沙
(HS)
和日本
(RB)
的亲缘关系较远，最远的为
日本
(RB)
群体。
关键词
中华鳖
;
微卫星
;
遗传多样性
;
种群分化
Genetic Diversity of Five Populations of
Trionyx sinensis
Revealed by Microsatellite
Markers
Liu Yang
1,2
, Shi Yan
1
, Zhu Xinping
1,2
, Zhao Jian
1
, Zhou Guitan
3
, Hong Xiaoyou
1
1. Key Laboratory of Tropical & Subtropical Fishery Resource Application
＆
Cultivation of Ministry of Agriculture, Pearl River Fisheries Research Institute,
Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou, 510380;
2. College of Life Science and Fisheries, Shanghai Ocean University, Shanghai, 201306;
3. Guangdong LuKa Enterprise CO., LTD., Dongguan, 523912
Corresponding author, zhuxinping_1964@yahoo.com.cn;
Authors
Abstract
In this paper, microsatellite markers were used to analyze the genetic diversity of 150 individuals from five populations,
Dongting (DT), Yellow River (HH), Huangsha (HS), Japan (RB), Luka (LK) of
Trionyx sinensis
. The LK population is the hybrid of
DT and HH population. The number of alleles amplified from each locus was 3 to 6, and the mean allele number was 4.181 8. The
effective number of alleles (
N
e
), observed heterozygosity (
H
O
), expected heterozygosity (
H
E
) and polymorphism information content
were all the highest in LK population as 2.396 9, 0.554 5, 0.527 4, and 0.466 0 respectively. F
ST
index between every two populations
of all loci indicated that the DT population shared the most genetic similarity with HH population and the lest genetic similarity with
RB population, with the Fst index of 0.023 3 and 0.096 9 separately. The UPGMA dendrogram based on Nei's genetic distances
showed that the DT population, the HH population and the LK population were grouped in one cluster, which was then clustered with
the HS population. The RB population was grouped in a separate cluster.
Keywords
Trionyx sinensis
; Microsatellite; Genetic diversity; Population differentiation
研究背景
中华鳖
(
Trionyx sinensis
)
，分类学上隶属爬行纲
(Repitlia)
、龟鳖目
(Tesmdinata)
、鳖科
(Trionychidae)
、
鳖属
(
Trionyx
)
。俗名鳖、团鱼、王八等。除西藏、
青海和新疆外，其它地区均有分布，以长江流域和华
南地区为多见
(
王培潮
, 2000,
中国的龟鳖
, pp.50-56)
；
国外主要分布于朝鲜、日本和越南
(
杨渡远等
, 1997,
中国龟鳖类原色图谱
, pp.48)
。近年来，由于食用、
药用等的大量需求，中华鳖的养殖业发展迅猛，其
养殖方式主要有鱼鳖混养、池塘单养、工厂化温室
养殖等，其年产量突破了
20
万
t (
中华人民共和国农
业部渔业局
, 2010,
中国渔业统计年鉴
, pp.27)
。伴随