乔燕春等:
SRAP
标记在丝瓜种质资源研究中的应用
1026
2
讨论
种质资源是新品种选育的基础
(
罗少波等
, 2006,
广东农业科学
, (1): 15-17)
,丝瓜资源丰富,从表型
上来分主要有有棱丝瓜和普通丝瓜两大类型,有棱
丝瓜又分为长条绿皮有棱丝瓜和大肉瓜两种,为了
从分子水平对丝瓜材料进行评价,本研究利用
SRAP
分子标记对
31
份丝瓜材料开展了遗传多样性
研究,遗传多样性非常丰富,而且普通丝瓜和有棱
丝瓜的遗传关系较远,本研究认为将普通丝瓜定位
为丝瓜的亚种更合适。而且分子标记和田间表现较
为吻合,说明
SRAP
标记较适合分析丝瓜的遗传多
样性。这与前人利用
ISSR (
苏小俊等
, 2010)
和
SRAP
(
崔竣杰等
, 2012)
分析丝瓜的结果比较接近,而和前
人
RAPD (
夏军辉和向长萍
, 2008)
的实验结果存在
差异。说明
SRAP
标记对丝瓜开展遗传多样性分析
较为适用。本研究中的部分材料如:
F
-
9
、
F
-
12
-
2
来自
05
秋资
s
-
11
,
E
-
33
号、
F
-
2
来自
06
年转-
13
的后
代,
C
-
33
、
C
-
41
-
3
来自
05
-
M
-
24
的后代;又如
G26
、
G36
分别来自
06
转
16
、
06
转
12
,均单独聚类,说明
SRAP
标记还适合丝瓜亲缘关系较近材料间的遗传
分析。以上结果可见,
SRAP
可以作为丝瓜田间选
育种的有效辅助手段,本研究的结果对丝瓜育种研
究具有重要指导意义。
3
材料与方法
3.1
材料
供试材料:丝瓜重要性状资源
31
份,其中
28
份丝瓜为有棱丝瓜,
3
份为普通丝瓜;
28
份有棱丝
瓜中
18
份丝瓜为长条绿皮有棱丝瓜,长棒形、皮
色深绿;
10
份丝瓜为大肉瓜,短棒形、皮色绿白,
有斑点
(
表
1)
。
3.2
方法
3.2.1 DNA
提取
DNA
提取采用改良
CTAB
法,浓度为
2%
,参
照陈洁等方法略作改动(陈洁等
, 2008,
江苏农业科
学
, (5): 61-62, 269
)。用
0.8%
的琼脂糖凝胶电泳检测
DNA
的浓度及纯度,将每个样品浓度调至
50 ng/Μl
-
20
℃备用。
3.2.2
建立丝瓜
SRAP
反应体系
本研究采用均匀设计方案,建立丝瓜
SRAP
反
应体系,首先以普通丝瓜材料为模板,采用正交实
验设计L
16
(4
5
)
在4个水平上对影响丝瓜
SRAP
反应
的
Taq
酶、
Mg
2
+
、模板、
dNTP
及引物等
5
个因素
进行了优化,建立了丝瓜
SRAP-PCR
的最佳反应体
系
, 2008;
李莲芳等
, 2011)
。
表
1
供试
31
份丝瓜材料
Table 1 A list of names of 31 Loofah
编号
No.
种质
Germplasm
编号
No.
种质
Germplasm
1
Y
-
17
17
F
-
9
2
05
-
DZ
-
3
18
F
-
12
-
2
3
D
-
15
-
1
19
A
-
24
4
D
-
28
-
4
20
A
-
11
5
NEA
21
A
-
15
6
E
-
15
22
A
-
4
-
2
7
G
-
24
23
C
-
11
8
C
-
(A+B)
24
C
-
33
9
D
-
4
-
1
25
C
-
41
-
3
10
2
-
1
-
1
26
09
-
Z-D
-
4
11
G
-
26
27
09
-
Z-D
-
5
12
E
-
33
28
DRZH
-
0
13
F
-
2
29
6
-
SG
14
G
-
36
30
27
-
SG
15
G
-
3
31
20
-
SG
16
G
-
15
SRAP
扩增程序参照吴红等
(2009)
并略加优化,
建立的适合本研究的扩增程序为:
94
℃
5 min
,
1
个循环;
94
℃
1 min, 35
℃
1 min
,
72
℃
1.5 min
,
5
个循环;
94
℃
1 min
,
50
℃
1 min
,
72
℃
1.5 min
,
35
个循环;
72
℃延伸
8 min
。
PCR
扩增完成后,再
在
2%
琼脂糖凝胶下电泳
2 h
,检测并拍照。
3.2.3
遗传多样性分析
研究中,将供试的
9
条正向引物和
11
条反向
引物,两两配对组合,组成
99
组引物对,以任意
两份材料为模板,利用
99
个引物组合对材料进行
PCR
扩增,筛选出
20
对稳定扩增的引物组合
(
表
2)
,
对
31
份丝瓜材料进行扩增,进一步在
4%
聚丙烯酰
胺凝胶上电泳分析。将
PCR
产物点样在
4%
聚丙烯
酰胺上,通过在
0.5×TBE
缓冲液中以
2000 v
电压
电泳
1.0
小时,通过干胶,数据采集、数据分析。
利用
NTSYS2.1
软件对采集数据进行
UPGMA
法聚
类分析,得出
31
份丝瓜材料的遗传距离。
分子植物育种
F
enzi Zhiwu Yuzhong