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分子植物育种
(
网络版
), 2013
年
,
第
11
卷
,
第
1123
-
1130
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2013, Vol.11, 1123
-
1130
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
Copyright © 2013 5
th
Publisher 1123
研究报告
Article Report
新疆主栽海岛棉品种
(
系
)
遗传多样性的
SSR
分析
郭欢乐
1
,
刘霞
2
,
张明菊
3
,
林忠旭
1
1.
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室与国家植物基因研究中心
,
武汉
, 430070
2.
新疆溢达纺织有限公司
,
乌鲁木齐
, 830000
3.
黄冈师范学院化学与生命科学学院
,
黄冈
, 438000
通讯作者：
zmjf97@126.com
；
作者
分子植物育种
, 2013
年
,
第
11
卷
,
第
18
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0018
这是一篇采用
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引用格式
(
中文
)
：
郭欢乐等
, 2013,
新疆主栽海岛棉品种
(
系
)
遗传多样性的
SSR
分析
,
分子植物育种
(online), 11(18): 1123-1130 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0018)
引用格式
(
英文
)
：
Guo et al., 2013, Genetic Diversity Analysis of Widely Cultivated Sea-island Cultivars (Lines) in Xinjiang Using SSR Markers, Fenzi Zhiwu Yuzhong
(online) (Molecular Plant Breeding), 11(18): 1123-1130 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0018)
摘
要
为了揭示新疆主栽海岛棉品种
(
系
)
的遗传差异，更好地指导新疆海岛棉育种，利用
187
对覆盖棉花全基因组的
SSR
引物对
20
个新疆海岛棉主栽品种
(
系
)
进行了遗传多样性分析。共有
55
对引物表现多态性，占总引物数的
29.4%
，共得到多
态性位点
97
个，平均每对引物产生
1.8
个多态性位点。等位基因变异的多态性信息含量
(PIC)
在
0.095~0.829
之间，平均为
0.560
。成对品种间遗传相似系数在
0.18~0.93
之间，平均成对相似系数为
0.44
。聚类结果显示阈值为
0.38
时，
20
个品种
(
系
)
可分为两大类；在阈值为
0.43
和
0.48
时，两大类材料可分别分为两个亚类。本研究结果表明新疆主栽海岛棉品种
(
系
)
的遗
传基础较宽，生产风险较小。
关键词
新疆
;
海岛棉
;
遗传多样性
; SSR
Genetic Diversity Analysis of Widely Cultivated Sea-island Cultivars (Lines) in
Xinjiang Using SSR Markers
Guo Huanle
1
,
Liu Xia
2
,
Zhang Mingju
3
,
Lin Zhongxu
1
1. National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement and National Center of Plant Gene Research, Huazhong Agricultural University, Wuhan, 430070,
P.R. China
2. Xinjiang Esquel Textile Co. LTD, Urumqi, 830000, P.R. China
3. Department of Chemistry and Life Science, Huanggang Normal College, Huanggang, 438000, P.R. China
Corresponding authors, wangyykm@gmail.com; yxuehui66@163.com;
Authors
Abstract
In order
to better guide Sea-island cotton breeding in Xinjiang, a total of 187 pairs of SSR primers which spanned the
whole genome of cotton were selected to evaluate the genetic diversity of 20 widely cultivated Sea-island cotton cultivars (lines) in
Xinjiang. Fifty-five pairs (29.4%) of SSR primers showed polymorphism, and 97 polymorphic loci were obtained with an average of
1.8 polymorphic loci per SSR marker. The polymorphism information content (PIC) for a marker locus was 0.095~0.829 with an
average of 0.560. Pairwise genetic similarity coefficients of the 20 cultivars (1ines) ranged from 0.18 to 0.93, with a mean of 0.44.
UPGMA cluster analysis showed that the 20 cultivars (1ines) were clustered into two main groups; and when the threshold value was
set to 0.43 and 0.48, respectively, the two groups were divided into 2 sub-groups, respectively. The results of this study indicated that
the genetic diversity of the 20 cultivars (1ines) was broad and the risk in production was low.
Keywords
Xinjiang; Sea-island cotton; Genetic diversity; SSR
研究背景
棉花是重要的经济作物，也是纺织业重要的
原料来源。在棉花纤维产量中，虽然长绒棉
(
海岛
棉
)
产量占棉花总产量不到
10%
，但是由于长绒棉
具有的纤维长度长、丝光好和强力高等优点，是
高档面料的重要来源，在纺织业中占有不可替代
的作用。随着近年来人民生活水平的提高，高档
面料的需求日趋旺盛，同时随着纺织业的快速发
收稿日期：
2013
年
03
月
20
日
接受日期：
2013
年
05
月
08
日
发表日期：
2013
年
06
月
18
日
基金项目：本研究由国家自然科学基金
(30871559)
资助