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刘凤栾等
: 31
种欧美观赏海棠遗传多样性的
AFLP
分析
1054
差异:
E86M51C
引物组合显示的
Nei′s
基因多样性
Shannon
信息指数最低,
E84M51C
组合最高
(
1)
,表明合适的引物组合筛选对全面揭示供试
31
种海棠种质资源遗传多样性十分重要。
1.5 31
种欧美观赏海棠种质的聚类分析
31
份海棠种质进行
UPGMA
聚类分析并绘
制树状图
(
2)
。以遗传距离
0.204
为界,可将供试
样品分为以下
5
类。第一类有
17
份种质,包括
海棠、
盛花
海棠、
美丽
海棠和
印第安魔力
海棠等。其中
爱丽
海棠、
盛花
海棠和
莱姆
海棠
遗传距离最小,表明三者亲缘关系最近。第二类有
11
份种质,包括
春雪
海棠、
道格
海棠、
琥珀
海棠、森林苹果海棠和
绚丽
海棠等。其中
琥珀
海棠、
鲁道夫
海棠、
奈微利考伯曼
海棠和
霹雳
贝贝
海棠亲缘关系较近。第三、四和五类均只有
1
份样品,分别为
粉芽
海棠、钟诺斯海棠和
王族
海棠,各自单成一类,三者之间以及与第一、二类
群中品种
(
)
遗传距离大,亲缘关系远。
1
引物
E83/M51C
组合对
31
个样品
AFLP
选择性扩增图谱
: M: DNA 2000 maker;1~31:
各个样品编号
;
箭头
:
部分种质的指纹标记
Figure 1 Map of AFLP selection amplification in primers E83/M51C for 31 samples
Note: M: DNA 2000 maker; 1~31: Samples number; Arrows: Fingerprint of some samples
1 31
个样本
AFLP
扩增产物的多态性及遗传多样性
Table 1 The polymorphism of AFLP amplified bands and genetic diversity among the 31 samples
引物
Primers
总位点
N
b
多态位点
N
p
多态位点
比率
(%)
PPL (%)
观测等位基因
N
a
有效等位基因数
N
ei
遗传多样性
H
Shannon
信息指数
I
E41M51C
55
42
76.36
1.763 6 1.331 3
0.207 0
0.325 6
E42M51G
65
57
87.69
1.876 9
1.467 9
0.277 3
0.422 2
E41M51G
62
50
80.65
1.806 5
1.388 5
0.238 0
0.368 9
E44M51C
55
47
85.45
1.854 5
1.359 7
0.230 9
0.366 1
E44M51G
71
65
91.55
1.915 5
1.377 3
0.243 7
0.387 0
E83M51C
61
58
95.08
1.950 8
1.424 5
0.260 8
0.408 0
E83M51G
52
46
88.46
1.884 6
1.350 1
0.228 3
0.365 9
E84M51C
63
51
80.95
1.809 5
1.283 2
0.184 4
0.300 5
E85M51G
58
48
82.76
1.827 6
1.359 6
0.222 2
0.349 6
E86M51C
59
55
93.22
1.932 2
1.536 1
0.313 0
0.470 8
均值
Mean
60.1
51.9
86.22
1.862 2
1.387 8
0.240 6
0.376 5
注:
N
b:
总位点
;
N
p:
多态位点
; PPL:
多态位点比率
;
N
a:
观测等位基因
;
N
ei:
有效等位基因数
(Kimura and Crow, 1964);
H
:
传多样性
(Nei, 1973);
I
: Shannon
信息指数
(Lewontin, 1995)
Note
N
b: Number of bands;
N
p: Number of polymorphic bands; PPL: Percentage of polymorphic loci;
N
a: Observed number of
alleles;
N
ei: Effective number of alleles (Kimura and Crow, 1964);
H
: Nei's gene diversity (Nei, 1973);
I
: Shannon's information
index (Lewontin, 1995)