刘凤栾等
: 31
种欧美观赏海棠遗传多样性的
AFLP
分析
1054
差异:
E86M51C
引物组合显示的
Nei′s
基因多样性
和
Shannon
信息指数最低,
E84M51C
组合最高
(
表
1)
,表明合适的引物组合筛选对全面揭示供试
31
种海棠种质资源遗传多样性十分重要。
1.5 31
种欧美观赏海棠种质的聚类分析
对
31
份海棠种质进行
UPGMA
聚类分析并绘
制树状图
(
图
2)
。以遗传距离
0.204
为界,可将供试
样品分为以下
5
类。第一类有
17
份种质,包括
‘
爱
丽
’
海棠、
‘
盛花
’
海棠、
‘
美丽
’
海棠和
‘
印第安魔力
’
海棠等。其中
‘
爱丽
’
海棠、
‘
盛花
’
海棠和
‘
莱姆
’
海棠
遗传距离最小,表明三者亲缘关系最近。第二类有
11
份种质,包括
‘
春雪
’
海棠、
‘
道格
’
海棠、
‘
琥珀
’
海棠、森林苹果海棠和
‘
绚丽
’
海棠等。其中
‘
琥珀
’
海棠、
‘
鲁道夫
’
海棠、
‘
奈微利考伯曼
’
海棠和
‘
霹雳
贝贝
’
海棠亲缘关系较近。第三、四和五类均只有
1
份样品,分别为
‘
粉芽
’
海棠、钟诺斯海棠和
‘
王族
’
海棠,各自单成一类,三者之间以及与第一、二类
群中品种
(
种
)
遗传距离大,亲缘关系远。
图
1
引物
E83/M51C
组合对
31
个样品
AFLP
选择性扩增图谱
注
: M: DNA 2000 maker;1~31:
各个样品编号
;
箭头
:
部分种质的指纹标记
Figure 1 Map of AFLP selection amplification in primers E83/M51C for 31 samples
Note: M: DNA 2000 maker; 1~31: Samples number; Arrows: Fingerprint of some samples
表
1 31
个样本
AFLP
扩增产物的多态性及遗传多样性
Table 1 The polymorphism of AFLP amplified bands and genetic diversity among the 31 samples
引物
Primers
总位点
N
b
多态位点
N
p
多态位点
比率
(%)
PPL (%)
观测等位基因
N
a
有效等位基因数
N
ei
遗传多样性
H
Shannon
信息指数
I
E41M51C
55
42
76.36
1.763 6 1.331 3
0.207 0
0.325 6
E42M51G
65
57
87.69
1.876 9
1.467 9
0.277 3
0.422 2
E41M51G
62
50
80.65
1.806 5
1.388 5
0.238 0
0.368 9
E44M51C
55
47
85.45
1.854 5
1.359 7
0.230 9
0.366 1
E44M51G
71
65
91.55
1.915 5
1.377 3
0.243 7
0.387 0
E83M51C
61
58
95.08
1.950 8
1.424 5
0.260 8
0.408 0
E83M51G
52
46
88.46
1.884 6
1.350 1
0.228 3
0.365 9
E84M51C
63
51
80.95
1.809 5
1.283 2
0.184 4
0.300 5
E85M51G
58
48
82.76
1.827 6
1.359 6
0.222 2
0.349 6
E86M51C
59
55
93.22
1.932 2
1.536 1
0.313 0
0.470 8
均值
Mean
60.1
51.9
86.22
1.862 2
1.387 8
0.240 6
0.376 5
注:
N
b:
总位点
;
N
p:
多态位点
; PPL:
多态位点比率
;
N
a:
观测等位基因
;
N
ei:
有效等位基因数
(Kimura and Crow, 1964);
H
:
遗
传多样性
(Nei, 1973);
I
: Shannon
信息指数
(Lewontin, 1995)
Note
:
N
b: Number of bands;
N
p: Number of polymorphic bands; PPL: Percentage of polymorphic loci;
N
a: Observed number of
alleles;
N
ei: Effective number of alleles (Kimura and Crow, 1964);
H
: Nei's gene diversity (Nei, 1973);
I
: Shannon's information
index (Lewontin, 1995)