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分子植物育种
(
网络版
)
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online)
1009
源的遗传多样性，努力推进改良创新利用是当前乃
至长远种质资源研究工作的主要内容，也是实施农
业可持续发展战略的重要举措。目前，稻种质资源
的保护方式有原位保护
(
in-situ
conservation)
和异位
保护
(
ex-situ
conservation)
两种。原位保护是通过保
护物种原生境，在原生地保存其完整的遗传多样性
和其固有的遗传进化途径
(
杨庆文等
, 2003)
；异位保
护是将种质保存于其原产地以外的地方，如种质
库、种质圃等
(
杨庆文等
, 2005)
。异位保护导致自然
进化的终止，还可能产生遗传飘移和基因重组，导
致具潜在利用价值的基因受到破坏或丢失
(
杨庆文
等
, 2005)
。为了评估原、异位保护的效果及其代表
性，以普通野生稻为代表开展了广泛的研究。李小
湘等
(2007)
以
5
个保护居群和
3
个未保护居群为研
究对象，评价了普通野生稻自然居群的遗传多样
性；王家祥等
(2009)
以全国已建立的
15
个普通野生
稻原生境保护居群和全国范围内随机选取的
15
个
未保护居群为研究对象，进行了中国普通野生稻原
生境保护与未保护居群的遗传多样性比较。杨庆文
等
(2005)
以江西省东乡县庵家山和水桃树
2
个野生
稻保护居群和
1982
年从上述保护点取样并保存于
江西农业科学院野生稻保存圃中的所有个体为研
究对象，评价了我国异位保存的普通野生稻能否代
表原居群遗传多样性的完整性；李小湘等
(2006)
用
48
对
SSR
引物对湖南江永普通野生稻异位保存和
原位保存居群进行了遗传多样性分析；余丽琴等
(2007)
以庵家山普通野生稻原、异位群体为研究对
象，比较了原、异位保存东乡野生稻主要农艺性状
的变化。
有关地方稻种种子库保存遗传多样性变化的
研究鲜有报道，郑爱清等
(2009)
以保山地区
20
世纪
80
年代收集并保存于种质库中的
12
个水稻品种和
目前仍在种植的对应
12
个水稻品种为研究对象，
分析了原位和种子库保存对水稻种质资源遗传多
样性的影响。云南元阳梯田原位保护着丰富的地方
稻种资源
(
高东等
, 2009b)
。但有关元阳梯田地方稻
种资源原位保护和种子库保存的研究鲜有报道，徐
福荣等
(2010; 2011)
以
20
世纪
70
年代收集于元阳
县，现保存于种质库和当前种植的品种为材料，研
究了水稻地方品种表型多样性和遗传多样性的变
化；严红梅等
(2012)
以
20
世纪
70
年代种植的
6
个
和近
10
年间种植的对应
6
个代表性水稻地方品种
为研究对象，揭示了元阳水稻地方品种
30
年的遗
传变异状况。本研究选取云南元阳哈尼梯田农户连
续种植的
3
个地方品种，以及
20
世纪
70
年代收集
并保存于种子库的对应
3
个品种，利用
SSR
标记分
析其遗传多样性及等位基因变异，旨在为制订水稻
地方品种安全有效的保护措施提供参考。
1
结果与分析
1.1 SSR
位点多态性信息
供试
24
对
SSR
标记共检测到
70
个等位基因
(
A
)
，各位点等位基因
1~4
个不等，原位保护聚群较
种子库保护聚群多
8
个等位基因。位点多态性信息
比较结果表明，在原位保护聚群中共检测出
66
个
等位基因
(
表
1)
，平均每位点
2.75
个；有效等位基
因
(
Ae
)
为
51.20
个，平均每位点
2.13
个；位点多态
信息含量
(
PIC
)
变幅为
0.28~0.72
，平均为
0.51
；基
因型多样性
(
H′
)
变幅为
0.45~1.33
，平均为
0.84
。在
种子库保护聚群中共检测出
54
个等位基因，平均
每位点
2.25
个；有效等位基因为
43.35
个，平均每
位点
1.81
个；位点多态信息含量
(
PIC
)
变幅为
0.28~0.61
；平均为
0.42
，基因型多样性
(
H′
)
变幅为
0.45~1.01
，平均为
0.62
。结果显示，原位保护聚群
的各
SSR
位点等位基因数、有效等位基因数、位点
多态信息含量和基因型多样性等指标均高于种子
库保护聚群。
1.2
聚群多态性信息
供试
24
对
SSR
标记在月亮谷原位和种子库聚
群检测到的等位基因数为
3.46
对
1.54
，
5
聚群变幅
为
1.71~2.46
对
1~1.5
；有效等位基因数
1.23
对
1.08
，
5
聚群变幅为
1.17~1.27
对
1~1.27
；多态性位点百分
率为
95.83%
对
33.33%
，
5
聚群变幅为
58.33~75%
对
0~33.33%
；香农指数为
0.31
对
0.11
，
5
聚群变幅为
0.2~0.28
对
0~0.22
。在白脚老粳聚群检测到上述参数
对应为
3.04→1.33
，
1.42~2.04→1.04~1.21
；
1.53→1.01
，
1.03~1.24→1~1.01
；
91.67%→29.17%
，
33.33~66.67%
→8.33~16.67%
；
0.49→0.02
，
0.06~0.29
→1.01~0.02
。
在红脚老粳聚群检测到上述参数对应为
3.17→1.21
，
2.13~2.46→1~1.13
；
1.76→1.03
，
1.39~1.58→1~1.01
；
87.5%→16.67%
，
70.83~83.33%→0~12.5%
；
0.59→0.04
，
0.34~0.45→0~0.02
。结果显示，原位保护各聚群的
等位基因数、有效等位基因数、多态性位点百分
率和香农指数等指标均高于种子库保护各聚群
(
表
2)
。