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分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1401
-
1407
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1401
-
1407
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1401
研究报告
Research Report
大豆豆荚开裂性状的相关分析及
QTL
定位
罗汝叶
1,4
,
巩鹏涛
2,4
,
赵德刚
1
,
刘学义
3
1
贵州大学生命科学院
,
贵州省农业生物工程重点实验室
,
贵阳
, 550025
2
东北林业大学盐碱地生物资源环境研究中心
,
哈尔滨
, 150040
3
山西省农科院经济作物研究所
,
汾阳
, 032200
4
海南省农作物分子育种重点实验室
,
海南省热带农业资源开发利用研究所
,
三亚
, 572025
通讯作者
:
gpt321@gmail.com; Lxy1959@126.com
作者
分子植物育种
, 2012
年
,
第
10
卷
,
第
55
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0055
收稿日期：
2012
年
12
月
06
日
接受日期：
2012
年
12
月
07
日
发表日期：
2012
年
12
月
14
日
本文首次以英文发表在
Legume Genomics and Genetics
上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用
Creative Commons Attribution License
协议
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,
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歧义，请以英文原文为播。
引用格式
(
英文
)
：
Luo et al., 2012, QTL Mapping and Analysis of Traits Related to Pod Dehiscence in Soybean, Legume Genomics and Genetics, Vol.3, No.3 14-20 (doi:
10.5376/lgg. 2012.03.0003)
摘
要
大豆豆荚开裂
(pod dehiscence)
是大豆重要的生育特性，而在生产上豆荚开裂则是影响大豆产量的重要不利因素之一。
本研究利用大豆重组自交系群体
(JINF
群体
)
的
112
个株系，采用复合区间作图法
(composite interval mapping, CIM)
法，对大豆豆
荚开裂性状
(PDH)
，豆荚厚宽比
(RTW)
以及完熟天数
(DFM) 3
个性状进行相关性分析及
QTL
定位。研究结果表明，
PDH
与
RTW
之间呈现出极显著的负相关性
(P=0.01,
-
0.960)
，与
DFM
呈显著负相关性
(P=0.05,
-
0.740)
；而
RTW
和
DFM
之间呈现显著正相
关性
(P=0.05, 0.867)
。
QTL
定位分析表明，在
C2
连锁群
(
即第
6
染色体
)
上检测到一个控制豆荚开裂的
QTL
座位，命名为
qPDH6
-
1
连锁，位于标记
Satt062
和
Satt520
之间，
LOD
值为
12.15
，遗传距离为
3.1 cM
，可解释的表型变异率为
49.44%
。对于完熟天
数，我们检测
3
个与之连锁的
QTL
座位，分别命名为
qDFM6
-
1
、
qDFM6
-
2
和
qDFM18
-
1
，分别位于标记
Sat_062
和
Satt520
、
Satt291
和
Satt305
及
Satt217
和
Satt13
0
之间，
LOD
值分别为
6.59
、
2.85
和
2.81
，遗传距离为
7.2 cM
、
12.3 cM
和
0.6 cM
，可解
释的表型变异率为
21.77%
、
9.74%
及
7.74%
。其中
qDFM6
-
1
座位与
qPDH6
-
1
位于相同的标记区间
(
Satt062
和
Satt520
之间
)
；
qDFM6
-
2
和
qDFM18
-
1
分别位于第
6
和第
18
染色体的
Satt291
和
Satt305
之间以及
Satt217
和
Satt130
之间。我们还检测到
3
个与大豆豆荚厚宽比连锁的
QTL
座位，分别位于第
11
、
4
和
8
染色体上，命名为
qRTW11
-
1
、
qRTW4
-
1
和
qRTW8
-
1
，分别位
于标记
Satt426
和
Satt509
、
Satt361
和
Satt399
及
Satt187
和
Satt377
之间，
LOD
值分别为
3.00
、
2.77
和
2.14
，遗传距离分别
为
10.0 cM
、
0.4 cM
及
3.7 cM
，可解释的表型变异率为
9.03%
、
8.20%
和
7.02%
。
关键词
大豆
(
Glycine ma
x L.); QTL
定位
;
豆荚开裂性状
;
豆荚厚
/
宽比
;
完熟天数
QTLMapping and Analysis of Traits Related to Pod Dehiscence in Soybean
Luo Ruye
1,4
, Gong Pengtao
2,4
, Zhao Degang
1
, Liu xueyi
3
1 Guizhou Key Lab of Agro-Bioengineering, College of Life and Science, Guizhou University, Guiyang, 550025, P.R. China
2 Alkali Soil Natural Environmental Science Center (ASNESC), Northeast Forestry University, Harbin, 150040, P.R. China
3 Industrial Crop Research Institute, Shaiaxi Academy of Agriculture Sciences, Fenyang, 032200, P.R. China
4 Hainan Key Lab of Crop Molecular Breeding, Hainan Institute of Tropical Agricultural Resources (HITAR), Sanya, 572025, P.R. China
Corresponding author, gpt321@gmail.com; Lxy1959@126.com ;
Authors
Abstract
Pod dehiscence (Pod shattering) (PD) is an important reproductive trait in soybean, while this trait also causes major yield
losses in the mechanically harvested soybeans. In this research, QTL mapping and correlation analysis of three related traits (PD trait
(PDH), ratio of thickness to width (RTW) and days of full maturity (DFM) ) were performeded in 112 strains of soybean recombinant
inbred lines (RIL) population (JINF population) by using methods of composite interval mapping (CIM). The results showed that there was
an extremely significant negative correlation between PDH and RTW (P=0.01,
-
0.960), a significant negative correlation between PDH
and DFM (P=0.05,
-
0.740), and also a significant positive correlation between RTW and DFM (P=0.05, 0.867). The results of QTL mapping
demonstrated that there was a major QTL controlling PD, designated as
qPDH6
-
1
, mapped on soybean molecular linkage group (LG)
C2 (chromosome 6) between
Sat_062
and
Satt520
with a linkage distance of 3.1 cM. The LOD value was found to be 12.15, and about
49.44% of the total variance was accounted for. Total of 3 QTLs linked to DFM, designated as
qDFM6
-
1
,
qDFM6
-
2
and,
qDFM18
-
1
,