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分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1376
-
1382
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1376
-
1382
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1376
研究报告
Research Report
普通油茶泛素结合酶
(E2S)
的蛋白质结构分析
林萍
1
,
姚小华
1
,
王开良
1
,
曹永庆
1
,
滕建华
2
1.
中国林科院亚热带林业研究所
,
富阳
, 311400
2.
浙江省金华市婺城区东方红林场
,
金华
, 321025
通讯作者
:
linping80@126.com
作者
分子植物育种
, 2012
年
,
第
10
卷
,
第
51
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0051
收稿日期：
2012
年
09
月
05
日
接受日期：
2012
年
10
月
19
日
发表日期：
2012
年
11
月
17
日
这是一篇采用
Creative Commons Attribution License
进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用
,
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引用格式
(
中文
)
：
林萍等
, 2012,
普通油茶泛素结合酶
(E2S)
的蛋白质结构分析
,
分子植物育种
(online) Vol.10 No.51 pp.1376-1382 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0051)
引用格式
(
英文
)
：
Lin et al., 2012, Characterization of Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2S from
Camellia Oleifera
, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant
Breeding) Vol.10 No.51 pp.1376-1382 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0051)
摘
要
泛素结合酶
(E2)
是泛素
/26S
蛋白酶体途径中三个关键酶之一，在靶蛋白识别、与泛素连接酶
(E3)
互作等蛋白的泛素
依赖性水解和
N
-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。本研究采用
Solexa
测序技术获得了一条油茶
E2
的全
长
cDNA
序列，命名为
UBE2S
，该基因编码
270AA
，与其它物种的
E2
具有较高的一致性和相似性，
UBE2S
蛋白具有泛素
结合酶催化位点
(UBCc)
，第
13~145
位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域，第
79~127
位氨基酸残基区域中有
21
个残基与泛素形成硫酯键中间产物的残基，其中
94
位的半胱氨酸残基是活性位点，有
5
个残基是与
E3
酶相互作用的位
点。
UBE2S
具有
C
端延伸结构，所以在普通油茶
E2
基因家族中属于Ⅱ类
E2
。
关键词
普通油茶
;
泛素结合酶
; solexa
测序
;
生物信息学
Characterization of Ubiquitin-Conjugating Enzyme E2S from
Camellia Oleifera
Lin Ping
1
, Yao Xiaohua
1
, Wang Kailiang
1
, Cao Yongqing
1
, Teng Jianhua
2
1. Research Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Fuyang, 311400, P.R. China
2. Dongfanghong Forest Farm of Zhejiang Province, Jinhua, 321025, P.R. China
Corresponding author, linping80@126.com;
Authors
Abstract
Ubiquitin-conjugating enzyme (E2) is one of three key enzymes in the ubiquitin-proteasome pathway (UPP). It is very
important in the protein degradation pathways depend on ubiquitin or N-end rule, including identify the target protein, interaction
with ubiquitin-protein ligating enzymes (E3), and so on. A full length cDNA sequence of E2 was cloned by Solexa sequencing
technology and named UBE2S. This cDNA codes 270 amino acids, and had significant amino acid sequence identity and similarity
with E2S from other organisms. The UBE2S protein had an ubiquitin-conjugating enzyme E2 catalytic (UBCc) domain from 13
th
to
145
th
amino acid residue. There are 21 residues to compose Ubiquitin thioester intermediate interaction residues, 5 residues to
compose E3 interaction residues and the 94
th
residue was the active site cysteine on conserved domain UBCc. UBE2S was a class
Ⅱ
member of E2 family of
Camellia oleifera
according to bioinformatics analysis.
Keywords
Camellia oleifera
; Ubiquitin-conjugating; enzyme (E2); Solexa sequencing; Bioinformatics
研究背景
泛素
/26S
蛋白酶体途径
(ubiquitin-proteasome
pathway, UPP)
是目前已知的有选择性的降解蛋白
质的最重要途径之一
(
郭启芳等
, 2004)
，该途径通过
调节功能蛋白质的周转或降解不正常蛋白质，实现
对多重代谢过程的调节
(
朱经春等
, 1999)
，在维持细
胞功能以及抵御环境胁迫、细胞周期运转、激素响
应、胚胎发育和衰老等方面起重要作用
(
董发才和宋
纯鹏
, 1999;
盛仙永等
, 2004; Ingvardsen and Veier-
skov, 2001; Moon et al., 2004; Smalle and Vierstra,
2004; Dreher and Callis, 2007; Zhang et al., 2007; Shi
et al., 2009;
王金利等
, 2010;
徐晨曦等
, 2007)
。
泛素化过程是一个受到高度调控的复杂过程，
有
3
种类型的酶参与催化
3
个级联反应，这
3
类酶
是泛素激活酶
(ubiquitin activating enzyme, E1)
、泛
素结合酶，也称泛素缀合酶
(ubiquitin-conjugating
enzymes, E2)
和泛素-蛋白连接酶
(ubiquitin-protein
ligating enzymes, E3) (
黄海杰和陈雄庭
, 2008)
。