分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1346
-
1353
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1346
-
1353
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1349
利用
GenAlEx 6.4
软件计算
18
份品种的
Nei
遗传距
离,分布范围是
0.004~0.467
,平均值为
0.095 8
,表
明遗传多样性水平较低。中花芥蓝和顺宝芥蓝的遗
传距离最小
(0.004)
,泰国中迟花粗茎尖叶芥篮与澄
海芥蓝菜最大
(0.467)
。
按照
UPGMA
方法,利用
Nei
遗传距离进行聚
类分析,在遗传距离
0.04
处,可以将
18
份品种分
为
3
类,第一类中花芥蓝、顺宝芥蓝、正源大笋香
菇芥蓝、甜脆黄花尖叶芥蓝、正源大笋迟花芥蓝、
绿宝芥蓝、香港白花甜芥蓝、正源澄海粗条芥蓝、
甜脆白花尖叶芥蓝、大丰芥蓝、大芯四季香菇芥蓝
104
、白花甜芥蓝、正源大笋黄花芥蓝、澄海芥蓝
菜、白花尖叶粗苔甜芥蓝。第二类为泰国芥蓝。第
三类为正源四季甜芥蓝。第四类为泰国中迟花粗茎
尖叶芥篮
(
图
3)
。
图
3 18
个芥蓝品种的
MSAP
电泳图
注
: M: Marker ; 1~18
品种见表
1; H,M:
Eco
R
Ⅰ
+
Hpa
Ⅱ和
Eco
R
Ⅰ
+
Msp
I
酶切组合
Figure 3 MSAP electrophoresiso of 18 Chinese kales
Note: M: Marker; 1~18: 1~18 variety names were showed in
table 1; H,M: Combinations of
Eco
R
Ⅰ
+
Hpa
Ⅱ
and
Eco
R
Ⅰ
+
Msp
I
1.3
芥蓝齐口期和
MSAP
相关性检验
18
份芥篮的
MSAP
与齐口期聚类分析结果不
一致,为验证两种分析的相关程度,利用
mantel test
检验齐口期遗传距离和
MSAP
遗传距离相关性,相
关系数为-
0.136 6
,表明齐口期、叶片数和基因组
DNA
甲基化相关不显著。
1.4
芥篮
DNA
甲基化模式分析
DNA
甲基化多态性片段可以归纳为
3
种带型
(
表
2)
,类型一为两种内切酶均能酶切的带型
(
Eco
R
Ⅰ
+
Msp
I/
Eco
R
Ⅰ
+
Hpa
Ⅱ
)
,代表非甲基化;类型二为
Eco
R
Ⅰ
+M
sp
Ⅰ酶切带型,表示双链内胞嘧啶甲基
化
(M)
。类型三为
Eco
R
Ⅰ
+
Hpa
Ⅱ酶切带型,表示单
链外部胞嘧啶的半甲基化
(H)
。本研究非甲基化片段
为
110
条,甲基化多态性片段为
322
条,可分
3
种类
型,类型一的变化范围为
110
条
(
澄海芥蓝菜
)~160
条
(
泰国中迟花粗茎尖叶芥篮
)
,类型二为
63
条
(
澄
海芥蓝菜
)~172
条
(
泰国中迟花粗茎尖叶芥篮
)
,类型
三为
52
条
(
白花甜芥蓝
)~116
条
(
香港白花甜芥蓝
)
。
类型二平均数量为
110
条,少于类型三的
152
条,
类型三为半甲基化类型。在不同品种之间,
78%
(86/110)
的非甲基化片段和
92% (141/152)
的半甲基
化片段呈现多态性,而甲基化片段中,多态性与单
态性相差不大,表明芥蓝较高的
MSAP
多态性主要
来源于前两者,甲基化模式以半甲基化为主。
2
讨论
作为南方地区的重要叶菜,芥蓝形态性状丰
富,其中齐口期作为重要的商品和产量性状,受环
境
(
特别是低温
)
、生长发育规律、品种、播种期及矿
质营养等的影响较大
(
关佩聪和梁承愈
, 1989;
杨暹
和杨运英
, 2002;
张静和张鲁刚
, 2008)
。本研究
18
份芥蓝齐口期变异系数达
21%
,正是诸多影响因素
的综合反映。聚类分析中除香港白花甜芥蓝、正源
大笋黄花芥蓝、白花尖叶粗苔甜芥蓝和甜脆黄花尖
叶芥蓝外,其余
14
份芥蓝基本按照齐口期分类,证
明齐口期可以作为种质资源鉴定的可靠指标,但香
港白花甜芥蓝和正源大笋黄花芥蓝、白花尖叶粗苔
甜芥蓝和甜脆黄花尖叶芥蓝具有非常小的遗传距
离,显示其亲缘关系紧密,而黄花和白花芥蓝属于
不同的栽培品种
(
刘海涛和关佩聪
, 1997)
,这又说明
齐口期分类仍具有局限性,不能反映出其它表型特
征,所以在利用表型研究遗传多样性时,性状一定
要丰富和典型,才可能反映种质资源的真实特性。
高等植物
DNA
的甲基化比例变化很大
(Finnegan et al., 1996)
,与拟南芥、甘蓝、油菜和
萝卜等的
MSAP
分析相比,本研究中
MSAP
检测
的芥篮甲基化比例为
47%
,低于芥蓝与萝卜四倍体