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分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1317
-
1322
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1317
-
1322
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1319
1.3
对水稻直立穗分离群体中直立穗单株的鉴定分析
2009
年以弯穗品种农垦
57
与直立穗品种南粳
45
配制杂交组合，同年于海南种植杂交种
F
1
，于海
南收获
F
2
种子。
2010
年在南京种植
F
2
群体。对
F
2
群
体进行挂牌取样，提取单株
DNA
，利用
InDel-E5
对
F
2
群体进行
PCR
扩增结果见图
2
，结合成熟后穗部性
状的调查结果发现：所有扩增出
732 bp
特征条带的
单株都表现为直立穗，而扩增出
1 357 bp
的特征条
带或者
732 bp
和
1 357 bp
特征条带的单株都表现出
弯穗性状，且弯穗与直立穗符合
3:1
的分离比，说明
穗部弯曲度是受一对主效基因控制，直立穗型为隐
性性状。
图
1
直立穗功能标记
InDel-E5
对不同的水稻品种的
PCR
扩增后在
1%
的琼脂糖胶电泳结果
注
: M: DNA ladder DL2000 marker; 1:
明恢
63; 2:
镇恢
084; 3: 9311; 4:
明恢
81; 5:
南粳
34; 6:
盐稻
5
号
; 7:
苏粳
5
号
; 8:
泗稻
8
号
; 9:
泗稻
10
号
; 10:
农垦
57; 11:
武育粳
3
号
; 12:
武运粳
23
号
; 13:
南粳
44; 14:
南粳
45; 15:
徐稻
3
号
; 16:
镇稻
11
号
; 17:
镇稻
88; 18:
盐稻
15
号
; 19:
淮稻
10
号
; 20:
宁粳
1
号
; 21:
连粳
7
号
; 22:
嘉花
1
号
; 23:
辽粳
5; 24:
沈农
265
Figure 1 PCR amplification products of deferent rice varieties using InDel-E5
Note: M: DNA ladder DL2000 marker; 1: Minghui63; 2: Zhenhui084; 3: 9311; 4: Minghui81; 5: Nanjing34; 6: Yandao5; 7: Sujing5;
8: Sidao8; 9: Sidao10; 10: Nongken57; 11: Wuyujing3; 12: Wuyunjing23; 13: Nanjing44; 14: Nanjing45; 15: Xudao3; 16:
Zhendao11; 17: Zhendao88; 18: Yandao15; 19: Huaidao10; 20: Ningjing1; 21: Lianjing7; 22: Jiahua1; 23: Liaojing5; 24:
Shennong265
图
2
直立穗功能标记
InDel-E5
对
F
2
群体中不同单株
PCR
扩增后在
1%
的琼脂糖胶电泳结果
注
: M: DNA ladder DL2000 marker; 1~24:
弯穗品种农垦
57
与直立穗品种南粳
45
的
F
2
中的部分单株
Figure 2 PCR amplification products of individuals from F
2
segregating population using InDel-E5
Note: M: DNA ladder DL2000 marker; 1~24: Part individuals of F
2
segregating population using curved panicle variety Nongken57
and erect panicle variety Nanjing45 as two parents
2
讨论
DNA
标记是利用种内个体间
DNA
序列差异设
计的分子标记，主要有
SSR
、
RFLPs
、
AFLPs
、
SNPs
和
InDel
等，这些标记既有基因连锁标记
(Zhang et al.,
2006)
，也有基因标记
(
王军等
, 2008)
。
Andersen
等
(2003)
把基因标记分为基因靶向标记和基因功能标
记，这两种基因标记都是根据等位基因的序列差异
而开发的，不同的是功能标记的多态性来源于造成
等位基因功能差异区段的
DNA
序列差异。基因功能
标记是指一个分子标记位点代表一个特定的等位
基因，同时与该基因控制的性状相关联，通过对分
子标记的筛选即能准确的对性状进行筛选
(
王丰等
,
2008;
陆艳婷等
, 2008)
。因此开发相关性状基因的
功能标记能有效的提高水稻育种效率。本研究根据
已被克隆的水稻直立穗基因
qpe9
-
1
的
DNA
序列差
异设计了基于
PCR
的功能标记，利用该标记对水稻
品种资源材料进行了分析验证，结合田间表型性状
分析发现所有表现为直立穗的品种扩增的带型为