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分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1317
-
1322
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1317
-
1322
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1317
研究报告
Research Report
一个与水稻直立穗基因
qPE9
-
1
关联的
InDel
标记的设计与验证
朱金燕
1
,
王军
1
,
杨杰
1
,
范方军
1
,
杨金欢
2
,
仲维功
1
1.
江苏省农业科学院粮食作物研究所
,
江苏省优质水稻工程技术研究中心
,
国家水稻改良中心南京分中心
,
南京
, 210014;
2.
安徽农业大学生命科学院
,
合肥
, 230036
通讯作者
:
wgzhong0503@yahoo.com.cn
作者
分子植物育种
, 2012
年
,
第
10
卷
,
第
43
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0043
收稿日期：
2012
年
05
月
02
日
接受日期：
2012
年
05
月
31
日
发表日期：
2012
年
09
月
25
日
本文首次发表在《分子植物育种》
(2012
年第
10
卷第
5
期
583-588
页
)
上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用
Creative Commons Attribution
License
协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用
,
版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
引用格式
(
中文
)
：
朱金燕等
, 2012,
一个与水稻直立穗基因
qPE9
-
1
关联的
InDel
标记的设计与验证
,
分子植物育种
(online) Vol.10 No.43 pp.1317-1322 (doi: 10.5376/
mpb.cn.2012.10.00043)
引用格式
(
英文
)
：
Zhu et al., 2012, Development and Application for a Functional Marker for Erect Panicle Gene
qPE9
-
1
of Rice, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular
Plant Breeding) Vol.10 No.43 pp.1317-1322 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.00043)
摘
要
水稻穗型是重要的农艺性状，也是水稻高产的重要决定因素之一。本研究根据水稻弯曲穗品种与直立穗品种在直
立穗基因
qpe9
-
1
第
5
外显子处存在的核苷酸差异设计了
1
对插入-缺失标记
(Insert/Delection)
，
InDel-E5
。利用该功能标记对
24
份水稻品种资源材料及直立穗分离群体
F
2
进行标记基因型分析，研究结果表明，直立穗品种均表现为缺失带型，弯曲穗
品种均表现为非缺失带型，
F
2
群体中杂合带型和非缺失带型均为弯曲穗，而缺失带型均为直立穗，说明利用该标记可以快
速、准确的鉴定出直立穗品种和单株。
关键词
水稻
;
直立穗
;
弯曲穗
;
功能标记
Development and Application for a Functional Marker for Erect Panicle Gene
qPE9
-
1
of Rice
Zhu Jinyan
1
, Wang Jun
1
, Yang Jie
1
, Fan Fangjun
1
, Yang Jinhuan
2
, Zhong Weigong
1
1. Institute of Food Crops, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Jiangsu High Quality Rice Research and Development Center, Nanjing Branch of China
National Center for Rice Improvement, Nanjing, 210014;
2. College of Life Sciences, Anhui Agricultural University, Hefei, 230036
Corresponding author, wgzhong0503@yahoo.com.cn;
Authors
Abstract
Rice plant architecture is an important agronomic trait and a major determinant in high productivity. In this study, one
InDel marker, InDel-E5, was designed based on the difference of extron 5 between curved panicle gene
qPE9
-
1
and erect panicle
qpe9
-
1
. 24 rice varieties and F
2
segregated populations were detected for genotype analysis using InDel-E5 marker. The results
showed that InDel-E5 was cosegregated with the rice panicle erectness, allowing to identify the homozygous erect panicle genotype,
homozygous curved panicle genotype and heterozygous curved panicle genotype individuals. Therefore, InDel-E5 can be used to
determined rice panicle genotype rapidly and exactly.
Keywords
Rice; Erect panicle; Curved panicle; Functional marker
研究背景
水稻是重要的粮食作物之一，为世界一半以上
的人口提供食物和营养来源。水稻产量占中国粮食
总产的一半以上，可以说，提高水稻产量是关系中
国社会经济发展的全局性问题。中国水稻育种史上
共有两次单产飞跃：水稻矮化育种使中国水稻单产
水平提高了
20%
以上，三系配套及杂种优势的应用，
实现了中国水稻单产水平的又一次飞跃。但是，最
近
20
多年，水稻产量水平徘徊不前，水稻品种产量
潜力难以提高，没有新的突破
(
徐正进等
, 2000)
。目
前，已经初步形成了具有重要导向作用的“理想株
型与优势利用相结合”理论，在育种界普遍被认为
是水稻产量水平实现第三次飞跃的重要途径
(
陈温
福等
, 2003)
，因此备受重视。
穗型是水稻理想株型研究的重要内容。杨守仁
等
(1984)
早在
20
世纪
80
年代初提出“短枝立叶，大
穗直穗”的北方地区粳稻理想株型模式，提倡培育
直立穗型粳稻品种。自此，中国北方地区涌现了一