Basic HTML Version
分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1287
-
1296
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1287
-
1296
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1295
续表
5
Continuing table 5
编号
品种名称
编号
品种名称
编号
品种名称
编号
品种名称
Code Name
Code Name
Code Name
Code Name
25
奥富优
1199
59
云两优
209
93
Ⅱ优
6078
127
保粳杂
2
号
Aofuyou 1199
Yunliangyou 209
Ⅱ
you 6078
Baojingza 2
26
Ⅱ优
1127
60
江优
381
94
泸优
578
128
滇杂
701
Ⅱ
you 1127
Hongyou 381
Luyou578
Dianza 701
27
特优
586
61
花香
7
号
95
圣丰优
819
129
两优
5519
Teyou 586
Huaxiang 7
Shefengyou819
Liangyou 5519
28
内
5
优
8015
62
汕优联合
2
号
96
皖稻
131
130
滇杂
42
Nei5you 8015
Shanyoulianhe 2
Wandao 131
Dianza 42
29
中优
727
63
珍优
17
97
滇优
37
131
滇杂
43
Zhongyou 727
Zhenyou 17
Dianyou 37
Dianza 43
30
宜优
039
64
花香
926
98
滇优
38
132
滇杂
44
Yiyou 039
Huaxiang 926
Dianyou 38
Dianza 44
31
冈优
550
65
金香
6
号
99
宜香
2516
133
滇杂
47
Gangyou 550
Jinxiang 6
Yixiang 2516
Dianza 47
32
Ⅱ优
3301
66
友稻
5
号
100
奇丰优
518
134
滇杂
49
Ⅱ
you 3301
Youdao 5
Qifengyou 518
Dianza 49
33
K
优
8602
67
德优
4727
101
宜香
37
Kyou 8602
Deyou 4727
Yixiang 37
34
内优
15
68
抗丰优
7329
102
2002
－
11
Neiyou 15
Kangfengyou 7329
其中，
n
表示供试的
SSR
引物总数，
m
表示同
一品种中待测模板总数
(
本实验中
m=5)
，
V
i
表示第
i
对引物检测到差异位点的模板总数
(0
≤
V
i
≤
m)
。
多态性信息含量
(polymorphism information
content, PIC)
按照
Smith
等
(1997)
描述公式计算。
该参数是衡量微卫星片段多态性的指标。其计
算公式为：
2
1
1
n
i
i
p
PIC
式中，
n
为所分析的某个微卫星标记在水稻品
种中检测到的多态性片段总数，
p
i
为第
i
个等位基
因出现的频率。
利用
POPGENE32
软件计算
Shannon
多样性指
数
(Shannon, 1948) (Shannon's Information index)
，等
位基因频率
(Allele Frequency)
，有效等位基因数
(Kimura and Crow, 1964) (Effective number of alleles)
。
同时，应用软件
NTSYSpc2.10
处理数据，利用
DICE
参数计算水稻品种间的遗传相似系数
(Genetic
similarity, GS)
，并按非加权平均数
(unweighted pair
group method, UPGMA)
进行聚类分析，构建
134
个水稻新品种的聚类图。
作者贡献
吴毅歆是项目的构思者和负责人，指导实验设计，论
文写作与修改；刘春明是本实验研究的执行人，负责分子
标记实验，参与实验数据整理与分析，论文写作与修改，
与第一作者同等贡献；李学进参与样品的采集，实验设计；
何月秋、毛自朝是项目的构思者，参与实验设计，试验结
果分析和论文修改。全体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
本研究由农业部公益性行业
(
农业
)
科研专项
(201203014)
资助。作者感谢中国水稻研究所庄杰云老师在实验数据统
计以及云南农业大学郭力维、尹海霞、张照然同学在实验
数据获得过程中提供帮助。
参考文献
Akagi H., Yokozeki Y., Inagaki A., and Fujimura T., 1997,
Highly polymorphic microsatellites of rice consist of AT
repeats, and a classification of closely related cultivars with
these microsatellite loci, Theor. Appl. Genet., 94(1): 61-67
http://dx.doi.org/10.1007/s001220050382
PMid:19352746
Cong X.H., Li L., Teng B., Liu H.Z., Ni D.H., Lu X.Z., Song F.S.,
and Yang J.B., 2010, Establishment of SSR fingerprint
map and analysis of genetic similarity among 56
backbone parental lines in hybrid rice, Shengwuxue
Zazhi (Journal of Biology), 27(1): 87-91 (
从夕汉
,
李莉
,
滕斌
,
刘海珍
,
倪大虎
,
陆徐忠
,
宋丰顺
,
杨剑波
,
2010, 56
个杂交水稻骨干亲本
SSR
指纹图谱的构建及
遗传相似性分析
,
生物学杂志
, 27(1): 87-91)
Chen Y.H., Hou Y.M., Li H.Y., Li M.B., Yuan Y., and Xu Z.J.,
2009, Establishment of DNA Fingerprinting and Analysis