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分子植物育种
(
网络版
), 2012
,
10
,
1535
-
1541
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1535
-
1541
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1540
2.0 µL 10
×
PCR Buffer
1.6 µL dNTP (2.5 mmol/L)
0.3 µL
Taq DNA
聚合酶
(5 U/µL)
0.7 µL
的随机
引物
(10 mmol/L)
13.4 µL
ddH
2
O
补足反应体系。
PCR
的扩增反应程序如下:首先
94
℃预变性
4 min
,后
94
℃变性
45 s
38
℃退火
1 min
72
℃延伸
1.5 min
,进行
40
个反应循环,最后
72
℃延伸
10 min
4
℃保存。
扩增产物用
1.5%
琼脂糖凝胶在
1
×
TAE
电泳缓
冲液中进行电泳,电场为
5 V/cm
,电泳后用
EB
染色,
UVP GelDoc-It
凝胶成像系统拍照记录。
3.5
数据处理与分析
对凝胶电泳成像图进行人工读带,将成像图上可
重复的、清晰的扩增条带计为“
1
”,同一扩增位点处
无条带或肉眼不易分辨的弱带计为“
0
”,建立原始
矩阵。使用
SPSS18.0
软件分析其
Jaccard
遗传系数,
采用
UPGMA
法进行测试样本的聚类分析,建立聚
类树状图。
作者贡献
陈志丹、李振刚和孙威江是本研究的实验设计和实验研
究的执行人;陈志丹、李振刚完成数据分析,论文初稿的写
作;孙威江是项目的构思者及负责人,指导实验设计,数据
分析,论文写作与修改。全体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
本研究由国家科技部科技项目
(2010DFB330304,
S2011C400031, 2011BAD01B01)
和福建省农业科技重大项
(2011N5006)
共同资助。
参考文献
Chen B.S., Xu H.F., Gu Z.Z., Sun S.Y., Zhou Y.M., and Yang
J.Y., 2011, Establishment of SSR fingerprint map and
analysis of genetic diversity among main wheat cultivars
(
Triticum aestivwm
L.) in Huai'an region, Zhejiang Nongye
Xuebao (Acta Agriculturae Zhejiangensis), 23(1): 20-24
(
程保山
,
徐海风
,
顾正中
,
孙苏阳
,
周羊梅
,
杨加银
, 2011,
淮安地区主栽小麦品种指纹图谱的构建及遗传多样性
分析
,
浙江农业学报
, 23(1): 20-24)
Chen W.X., Ji P.Z., Huang X.Q., Zhang J., and Tang Y.C., 2008,
Parentage identification of suspicious filial generations
from
BenShan tea
and
MengKu tea
using RAPD
marker, Beifang Yuanyi (Northern Horticulture), (10):
153-155 (
陈文雄
,
季鹏章
,
黄兴奇
,
张俊
,
唐一春
, 2008,
本山茶与勐库茶疑似杂交后代的
RAPD
鉴定
,
北方园艺
,
(10): 153-155)
Gao X., Zhao J.F., He W.P., Ma J.X., and Yi F.Y., 2011,
Analysis on RAPD fingerprints and genetic relationship of
Astragalus hybrid, Zhongzi (Seed), 30(1): 27-30 (
高霞
,
赵景峰
,
何为平
,
马金星
,
伊风艳
, 2011,
黄芪杂交种
RAPD
指纹图谱及其亲缘关系分析
,
种子
, 30(1): 27-30)
Li J., Jiang C.J., and Wang C.X., 2005, RAPD analysis on
genetic diversity of the preconcentrated core germplasms
of Camellia sinensis in China, Yichuan (Hereditas), 27(5):
765-771 (
李娟
,
江昌俊
,
王朝霞
, 2005,
中国茶树初选核
心种质遗传多样性的
RAPD
分析
,
遗传
, 27(5): 765-771)
Li X.H., Zhang C.Z., Liu C.L., Shi Z.P., Luo J.W., and Chen X.,
2007, RAPD analysis of the genetic diversity in Chinese
tea germplasm, Yuanyi Xuebao (Acta Hoticulturae Sinica),
34(2): 507-508 (
黎星辉
,
章传政
,
刘春林
,
施兆鹏
,
军武
,
陈暄
, 2007,
中国茶组植物种质资源遗传多样性
RAPD
分析
,
园艺学报
, 34(2): 507-508)
Lin Z.H., Chen C.S., and Chen R.B., 2006, RAPD analysis of
the thirty-nine tea cultivars in China, Fenzi Zhiwu Yuzhong
(Molecular Plant Breeding), 4(5): 695-701 (
林政和
,
陈常
,
陈荣冰
, 2006,
我国
39
个茶树品种的
RAPD
分析
,
子植物育种
, 4(5): 695-701)
Liu B.Y., Wang L.Y., Zhou J., Tang Y.C., Chen H., Wang P.S.,
and Jiang Y.W., 2008, Fingerprinting construction and
genetic diversity analysis of Yunnan dayezhong tea
germplasm resources by ISSR markers, Zhiwu Yichuan
Ziyuan Xuebao (Journal of Plant Genntic Resources), 9(4):
458-464 (
刘本英
,
王丽鸳
,
周健
,
唐一春
,
成浩
,
王平
,
江用文
, 2008,
云南大叶种茶树种质资源
ISSR
指纹
图谱构建及遗传多样性分析
,
植物遗传资源学报
, 9(4):
458-464)
Liu L.J., Qian C.T., Chen J.F., and Yu J.Z., 2009, Construction
of RAPD fingerprinting and genetic similarity analysis
among cucumber varieties, Jiangsu Nongye Xuebao
(Jiangsu Journal of Agricultural Sciences), 25(4): 824-828
(
刘丽娟
,
钱春桃
,
陈劲枫
,
余纪柱
, 2009,
黄瓜品种
RAPD
指纹图谱的构建及遗传相似性分析
,
江苏农业学
, 25(4): 824-828)
Mirshra R.K., and Sen-Mandi S., 2004, Genetic diversity esti-
mates for Darjeeling tea clones based on amplified fragment
length polymorphism markers, Journal of Tea Science,
24(2): 86-92
Tong Q.Z., Zhou R.B., Liu X.D., Sheng X.B., and Wang C.H.,
2010, Study on genetic relationship between different
resources of lily and RAPD fingerprint of lily, Hunan
Zhongyiyao Daxue Xuebao (Journal of Traditional
Chinese Medicine University of Hunan), 30(3): 32-36 (
巧珍
,
周日宝
,
刘湘丹
,
盛孝邦
,
王朝晖
, 2010,
百合种质
资源间亲缘关系及
RAPD
指纹图谱分析
,
湖南中医药大
学学报
, 30(3): 32-36)
Wachira F.N., Waugh R., Hackett C.A., and Powell W., 1995,