分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1438
-
1446
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1438
-
1446
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1445
1/2MS
培养液进行水培培养
(16 h
光照
/8 h
黑暗
)
。当
幼苗生长至三叶期,移至塑料培养瓶,用
200 mmol/L
NaCl
、
200 μmol/L ABA
和
25% PEG6000
分别处理
40 h
、
40 h
和
16 h
,黄化苗的获得则通过暗培养至三
叶期幼苗完全出现黄化。所有样品液氮速冻后贮存
于-
80
℃下用于
RNA
提取。
3.3
定量
RT-PCR
引物的设计
使用引物设计软件
Primer Premier 5.0
对
30
个
OsDof
基因进行荧光定量引物设计并送往广州英伟
创津公司进行合成。本实验用的荧光定量引物序列
如表
1
所示。
3.4
水稻总
RNA
的提取及反转录
水稻总
RNA
的提取采用
RNAsimple Total RNA
Kit (
天根
)
,经
Dnase
Ⅰ
(TakaRa
公司
)
处理后,用
RNA-
clean Kit (
天根
)
纯化。通过琼脂糖凝胶电泳检测,
选取具有清晰
18S
和
28S
带的总
RNA
用于反转录,即
cDNA
第一链合成,使用
Promega A3500
试剂盒。具
体方法按试剂盒说明书进行,然后保存于-
20
℃备用。
3.5
定量
RT-PCR
定量
RT-PCR
反应使用罗氏公司的
SYBR Green
法荧光定量试剂盒。
20 μL
反应体系包含:
1 μL
反转
录产物,
10 μL Faststart Univeral SYBR Green Master
(ROX)
及
10 μmol/L
的上下游引物各
0.6 μL
。定量
PCR
在
ABI7500
定量
PCR
仪
(Applied Biosystems,
美国
)
上进行,采用
2
-△△CT
相对定量的方法进行表达量的比
较。运行的反应程序为:
95
℃
10 min
;
95
℃
15 s
,
60
℃
(
或
64
℃
) 1 min
,
40
个循环;
60
℃收集荧光。定
量
PCR
反应利用
Actin
基因作为内参。
作者贡献
周淑芬和颜静宛是本研究的实验设计和实验研究的执
行人,周淑芬完成数据分析和论文初稿的写作;刘华清、林
智敏、陈睿和杨绍华参与实验设计,试验结果分析;王锋是
项目的构思者及负责人,指导实验设计,数据分析,论文写
作与修改。全体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
本研究由福建省自然科学基金项目
(2009J01091)
和福建
省财政专项-福建省农业科学院科技创新团队项目
(CXTD-
2011
-
09)
共同资助。
参考文献
BBaumann K., De Paolis A., Costantino P., and Gualberti G.,
1999, The DNA binding site of the Dof protein NtBBF1 is
essential for tissue-specific and auxin-regulated expression
of the rolB oncogene in plants, Plant Cell, 11(3): 323-333
http://dx.doi.org/10.2307/3870863 http://dx.doi.org/10.11-
05/tpc.11.3.323 PMid:10072394 PMCid:144195
Chen R., Ni Z., Qin Y., Nie X., Lin Z., Dong G., and Sun Q.,
2005, Isolation and characterization of TaDof1 transcript-
ion factor in wheat (
Triticum aestivum
L), DNA Seq., 16
(5): 358-363 http://dx.doi.org/10.1080/104251705002729-
40 PMid:16243726
Chen W.Q., Chao G., and Singh K.B., l996, The promoter of a
H
2
O
2
-inducible,
Arabidopsis
glutathione S-transferase gene
contains closely linked OBF- and OBP1-binding sites, Plant
J., 10(6): 955-966 http://dx.doi.org/10.1046/j.1365-313X.
1996.10060955.x PMid:9011080
Dong G.Q., Ni Z.F., Yao Y.Y., Nie X.L., and Sun Q.X., 2007,
Wheat Dof transcription factor WPBF interacts with
TaQM
and activates transcription of an alphagliadin gene during
wheat seed development, Plant Mol. Biol., 63(1): 73-84
http://dx.doi.org/10.1007/s11103-006-9073-3 PMid:1702-
1941
Gualberti G., Papi M., Bellucci L., Ricci I., Bouchez D.,
Camilleri C., Costantino P., and Vittorioso P., 2002, Mut-
ations in the Dof zinc finger genes
DAG2
and
DAG1
inf-
lunce with opposite effects the germination of Arabidop-
sis seeds, Plant Cell, 14(6): 1253-1263 http://dx.doi.org/1-
0.1105/tpc.010491 PMid:12084825 PMCid:150778
Jiao Y., Lau O.S., and Deng X.W., 2007, Light-regulated trans-
criptional networks in higher plants, Nat. Rev. Genet., 8(3):
217-230 http://dx.doi.org/10.1038/nrg2049 PMid:173042-
47
Kisu Y., Ono T., Shimofurutani N., Suzuki M., and Esaka M.,
1998, Characterization and expression of a new class of
zinc finger protein that binds to silencer region of asc-
orbate oxidase gene, Plant Cell Physiol., 39(10): 1054-1064
http://dx.doi.org/10.1093/oxfordjournals.pcp.a029302 PM-
id:9871365
Kurepin L.V., Emery R.J.N., Pharis R.P., and Reid D.M, 2007,
The interaction of light quality and irradiance with gib-
berellins, cytokinins and auxin in regulating growth of
Helianthus annuus
hypocotyls, Plant Cell Environ., 30(2):
147-155 http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-3040.2006.0161-
2.x PMid:17238906
Kushwaha H., Gupta S., Singh V.K., Rastogi S., and Yadav D.,
2011, Genome wide identification of
Dof
transcription fac-
tor gene family in sorghum and its comparative phylog-
enetic analysis with rice and Arabidopsis, Molecular Biol-
ogy Reports, 38(8): 5037-5053 http://dx.doi.org/10.1007/
s11033-010-0650-9 PMid:21161392