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分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1438
-
1446
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1438
-
1446
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1440
表
1
定量
RT-PCR
引物序列
Table 1 The list of gene specific primers of the
OsDof
genes for qRT-PCR
编号
基因名称
上游引物序列
(5'
-
3')
上游引物序列
(5'
-
3')
扩增大小
(bp)
Tm (
℃
)
Code
Gene locus
Primer sequences forward (5'
-
3')
Primer sequences reverse (5'
-
3')
Amplicon size (bp)
OsDof1 Os01g09720
CGGCAGGTGGTGGAGGATTGG GGCACGCCTTGCAGAAGTGGC 144
60
OsDof2 Os01g15900
CACTGTGGGTTCCCAAGACG
AAGAGCACGAGCAGGACGAG 173
64
OsDof3 Os01g17000
GCATTGCCTTTCCCTACTGG
GGGCAGGGTATCCCATCTTT
131
60
OsDof4 Os01g48290
AAGGTGATCCAGCCCGACG
AGGCGGATGCGGATGAGG
78
64
OsDof5 Os01g55340
CGGCGGGTTCAAGCTGTTC
CCTCCGGTTCAACCTTCTCCC 110
60
OsDof6 Os01g64590
CCTGACATGGTCCTGGAAGGC GGTGGTTCAGAAACTTGGCGTA 130
64
OsDof7 Os02g15350
GGCGAAGCTGTGATGACGA
TCATGGCCGAGCTGCTGTC
187
60
OsDof8 Os02g45200
GGCGATGGAGTTGCTGAGGAG GAGCACGGTCTGAGCTTGTTGC 163
60
OsDof9 Os02g47810
AGCACGGGATGGGGTCGT
GCACTTGAGCGGCTGGTCG
125
64
OsDof10 Os02g49440
CACCATCGCCGTCATAAACC
CCTGCGCTGCGAAGCTGAA
170
60
OsDof11 Os03g07360
CGAGATGCCAGTCGGTTTGT
CACATGGCTCCTCCGTTCAT
138
60
OsDof12 Os03g16850
CCGATGTACCAACTGGGACTGG CCGCCATGTACTGCCTCTGC
178
64
OsDof13 Os03g38870
CCTTCATGCACATGGCTGGT
CGCCGCTGTTGAGGTTACTG
159
64
OsDof14 Os03g42200
GTGGGAGGGAGTAGCAGGGAG ATGGGGACGTTGCGGAGG
155
60
OsDof15 Os03g55610
CAACACGGTCGGGATGGA
CCGTTGGGAGTGGGCAAG
114
64
OsDof16 Os03g60630
CGCCAATGTCCGGCATTTAC
TGAGCGTTGCTGTCCTCCATC 151
64
OsDof17 Os04g47990
CAGGTTGCTGTTCCCGTTCG
CGCCGATCATGCCGTTCCA
194
60
OsDof18 Os04g58190
CGGCTTCCCGTTCCTCAGTG
GCGATGTCGGCGAAGTTGTC
177
60
OsDof19 Os05g02150
GCAGAGCTTCCCGTTCTTCC
TGATGGCATCGCATGGTG
163
60
OsDof20 Os05g36900
AACTTCAGCGTGGACCAGA
CGCGTTGCACCAGACAT
186
64
OsDof21 Os06g17410
CCTTGTCTGCTGCTGTTTC
TTGGGCTGCGCCGTGAA
166
64
OsDof22 Os07g13260
CCCGCACTTCCCGTTCTTAG
TCGTCCATCTTCACCGAGGC
195
64
OsDof23 Os07g32510
GCGTTCGAGATGCACCAGCAG CACGATGGAGCCGGACAGGA 171
60
OsDof24 Os07g48570
CATCTTCAGTTTGGCCCTTCA
TTGTCATCTCCTTGCGGTTTG
178
60
OsDof25 Os08g38220
TCGTCGTCTTCCTCGTCATCC
AGCTTCGGTCGTCGTCTTGG
162
60
OsDof26 Os09g29960
GGCACCAGAAGCCACAACCA
CGAACGGGCTCGTGTCCAG
137
64
OsDof27 Os10g26620
GTCCAGTCTCAGGCCATCTCAT ATCGTCTTCGGCACCCACA
152
60
OsDof28 Os10g35300
AGGCGGCTACAGCATCG
GACCGGGCATGTCATCTT
185
64
OsDof29 Os12g38200
GGAGGAGCACGGCACCAACA
CGACGATGAGCTGAACCCTGAC 133
64
OsDof30 Os12g39990
CGAGGGACACCAAGTTCTG
GCCGATGGGGACGTTGC
119
64
表
2
调控元件的种类及数目
Table 2 Types and numbers of cis-elememts
元件类别
光反应元件
组织表达元件
激素反应元件
逆境反应元件
Types of cis-elements
Elements for light reaction Elements for tissue
expression
Elements for hormone
response
Elements for stress response
元件种类
32
12
11
7
Types of cis-element
元件数目
293
100
81
45
Numbers of cis-element