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分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1252
-
1258
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1252
-
1258
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1252
研究报告
A Letter
不同生态型冬瓜种质资源的
ITS
序列变异分析
江彪
,
刘文睿
,
谢大森
,
何晓明
,
彭庆务
,
赵芹
广东省农业科学院蔬菜研究所
,
广州
, 510640
通讯作者
:
xiedasen@126.com
作者
分子植物育种
, 2012
年
,
第
10
卷
,
第
35
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0035
收稿日期：
2012
年
06
月
12
日
接受日期：
2012
年
06
月
15
日
发表日期：
2012
年
06
月
29
日
这是一篇采用
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,
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件的使用与传播。
引用格式
(
中文
)
：
江彪等
, 2012,
不同生态型冬瓜种质资源的
ITS
序列变异分析
,
分子植物育种
(online) Vol.10 No.35 pp.1252-1258 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0035)
引用格式
(
英文
)
：
Jiang et al., 2012, Genetic Variation of the Different Ecotype Wax Guard Germplasms (
Benincasa hispida
) Based on ITS Sequences, Fenzi Zhiwu Yuzhong
(online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.35 pp.1252-1258 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0035)
摘
要
以不同生态类型的
41
份冬瓜种质资源为材料，对其核糖体
DNA
的内部转录间隔区
(internal transcribed spacers, ITS)
进行
PCR
扩增，并将目的片段回收测序，获得
ITS
序列信息，并用于探讨冬瓜种质资源的系统进化关系。分析结果显示，
这些冬瓜材料的
ITS
序列长度变异较小，且长度变异仅发生在
ITS1
区。以西瓜为外类群，将
ITS1
和
ITS2
序列作为一个共
同的数据矩阵进行系统发育树构建，所有材料主要分在两个分支上。这些结果表明，不同生态型的冬瓜资源的
ITS
序列没有
明显变异，序列非常保守。冬瓜种质资源有着非常相近的遗传背景，其形态学差异可能主要由环境因素造成的。
关键词
冬瓜
;
种质资源
; ITS;
遗传变异
Genetic Variation of the Different Ecotype Wax Guard Germplasms (
Benincasa
hispida
) Based on ITS Sequences
Jiang Biao , Liu Wenri , Xie Dasen , He Xiaoming , Peng Qingwu , Zhao Qin
Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou, 510640
Corresponding author, gaodong521@yahoo.com.cn;
Authors
Abstract
Forty-one different ecotype germplasms of Wax Guards (
Benincasa hispida
) were employed as experimental materials to
amplify the ribosomal DNA internal transcribed spacer region (ITS). The target fragments were recovered and sequenced to generate
the ITS information as well as to analyze the phylogenetic relationships among the tested
Benincasa hispida
germplasms. The results
showed that the length variation of the ITS sequences are very small that only occur in the ITS1 region. Using watermelon (
Citrullus
lanatus
) as outgroup, the phylogenetic tree was constructed by using common data matrix of ITS1 and ITS2 sequences, all tested
materials were grouped into two major clades. The results suggested that the variation of ITS sequences among the different ecotype
germplasms of wax guards (
Benincasa hispida
) should have no significant difference, which indicated that the sequences be very
conservative. Therefore, we might conclude that the germplasms of wax guards (
Benincasa hispida
) share very similar genetic
background, and the morphological differences might be mainly caused by environmental effects.
Keywords
Wax guard;
Benincasa hispida
; ITS; Phylogenetics
研究背景
核糖体内转录间隔区
(internal transcribed spacers,
ITS)
是位于核糖体
18S
、
5.8S
和
26S
之间转录间隔
区的
DNA
片段，被
5.8S
分割成
2
段。由于其进化
速率较快、稳定性好、测序方便等特定，已成为研
究植物分类和亲缘关系的重要工具
(Bellarosa et al.,
2005; Kress et al., 2005)
。陈少风等
(2007)
利用
ITS
序列探讨荻属及其近缘植物的系统发育关系。张利
等
(2007)
基于
ITS
序列分析仲彬草属植物的亲缘关
系，发现形态相似、地理分布一致的物种有聚在一
起的倾向，表现出较近的亲缘关系。为了探讨亚洲
瓠瓜的地理分化，周先治等
(2011)
利用
ITS
序列研
究发现，源自日本的瓠瓜品种与源自中国和泰国的
品种存在明显的地理分化现象。
冬瓜
(
Benincasa hispida
Cogn.)
属于葫芦科
(
Cucurbitaceae
)
冬瓜属的一年生蔓性植物，起源于
中国南部和印度，广泛分布于亚洲的热带、亚热带和
温带地区，是全国性重要蔬菜。冬瓜种质资源丰富，