分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1151
-
1156
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1151
-
1156
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1154
分。我国旱稻地方品种籼亚种地理隔离现象淡化的
原因有待研究。
3
材料与方法
3.1
材料
供试材料来自课题组构建的旱稻地方品种核
心种子库和国家库,以云南、贵州和广西为主,基
于自然地理分布密度,随机抽取
105
份旱稻地方粳
亚种,覆盖了我国
14
个省或地区,核心种子库中
仅存
1~2
份的省份没有覆盖。具体分布为云南、贵
州和广西各
25
份,江苏、湖南、湖北、福建、浙
江和台湾各
4
份,广东和海南各
3
份。
3.2 DNA
抽提及
PCR
检测
参考前人研究结果,每条染色体各筛选
6
对多
态性高的
SSR
引物
(
表
1)
。取
10
个单株代表每份材
料,
CTAB
法混合抽提全基因组
DNA (Song et al.,
2003)
。
PCR
反应体系
(20 μL)
含
1
×
Buffer
,
0.2 mmol/L
dNTP (
每一成分均为
0.2 mmol/L)
,
1 μmol SSR
引
物,
50 ng
模板
DNA
及
1 U Taq
酶。扩增程序为:
94
℃预变性
2 min
,
94
℃
40 s
,
55
℃
30 s
,
72
℃
40 s
,
36
个循环,
72
℃延伸
10 min
。采用
6%
聚丙烯酰胺
变性凝胶电泳及银染法检测扩增结果
(
高东等
,
2009)
。
3.3
数据处理
SSR
扩增带型采用基因型统计,并建立相应的
数据库
(
高东等
, 2011)
。采用
POPGENE (Yeh et al.,
1999)
分析遗传多样性参数。
NTSYS
程序
(Rohlf, 1997)
软件完成参试材料间欧氏距离计算,采用非加权平
均数
(UPGMA)
,依据遗传距离绘制树状聚类图。
作者贡献
高东为本研究的构思者及负责人,刘雪梅,安凤明,
彭燕负责试验设计、试验研究的执行和论文初稿的写作;何
霞红参与数据分析及论文修改。全体作者都阅读并同意最终
的文本。
致谢
本研究由国家重点基础研究发展计划
(973
项目
)
课题
(2011CB100406)
资助。
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