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分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1127
-
1132
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1127
-
1132
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1127
研究报告
Research Report
中国旱稻粳亚种的遗传多样性及其遗传结构
李锐
,
杨木青
,
高东
,
何霞红
云南农业大学农业生物多样性应用技术国家工程中心
,
教育部农作物多样性与病害控制重点实验室
,
昆明
, 650201
通讯作者
:
gaodong521@yahoo.com.cn
作者
分子植物育种
, 2012
年
,
第
10
卷
,
第
17
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0017
收稿日期：
2012
年
03
月
28
日
接受日期：
2012
年
04
月
09
日
发表日期：
2012
年
05
月
14
日
这是一篇采用
Creative Commons Attribution License
进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用
,
版权所有人允许并同意第三方无条
件的使用与传播。
引用格式
(
中文
)
：
李锐等
, 2012,
中国旱稻粳亚种的遗传多样性及其遗传结构
,
分子植物育种
(online) Vol.10 No.17 pp.1127-1132 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0017)
引用格式
(
英文
)
：
Li et al., 2012, Genetic diversity and structure in
Japonica
upland rice in China, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10 No.17
pp.1127-1132 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0017)
摘
要
我国旱稻地方品种资源丰富，蕴藏着大量的优异基因。因此，研究我国旱稻资源的遗传结构和遗传多样性，对在
水稻育种过程中有效利用旱稻种质资源具有重要意义。本研究利用
72
对
SSR
引物对来自中国
14
个省份的
125
份旱稻地方
品种进行了
SSR
遗传多样性、遗传距离和聚类分析。结果表明，共检测到
573
个等位基因，平均每对引物检测到
7.958
个，
变幅为
3~20
，平均有效等位基因座数为
3.357
个。平均
Shannon
指数为
1.327
，变幅为
0.358~2.701
。
Shannon
多样性指数以
广西最高，台湾、云南和贵州次之。系统聚类能较好地区分我国粳型旱稻地方品种的地理来源，各省份粳型旱稻地方品种间
遗传距离与地理位置相关。
关键词
旱稻
;
地方品种
;
微卫星标记
;
遗传多样性
;
遗传结构
Genetic Diversity and Structure in
Japonica
Upland Rice in China
Li Rui , Yang Muqing , Gao Dong , He Xiahong
The National Center for Agricultural Biodiversity, Key Laboratory of the Ministry of Education for Agricultural Biodiversity and Disease Control, Yunnan
Agricultural University, Kunming, 650201, P.R. China
Corresponding author, gaodong521@yahoo.com.cn;
Authors
Abstract
The upland rice landraces in China have rich genetic diversity and contain a large number of excellent genes, which are
basis for rice breeding, so researching the genetic structure and the genetic diversity of upland rice landraces in China is greatly
significant. The polymorphism of SSR markers, the genetic distance and the clusters of 125 upland rice landraces from 14 provinces
of China were analyzed by using 72 pairs of SSR markers. A total of 573 alleles were detected, and it is averagely 7.958 per pair with
a range from 3 to 20, and the mean effective alleles are 3.357. The mean Shannon’s information index is 1.327 with a range from
0.358 to 2.701. Regarding geographical regions, the Shannon’s information index of upland rice in Guangxi was highest, the following
were that in Taiwan, Yunnan and Guizhou. The dendrogram based on Nei’s genetic distance could distinguish the geographical
regions. The
japonica
upland rice landraces from provinces which have geographical proximity have a similar hereditary basis.
Keywords
Upland rice; Landraces; SSR markers; Genetic diversity; Genetic structure
研究背景
遗传理论和育种实践均已表明，育种目标能否
实现的基础与关键是种质资源，特别是特异种质资
源的发掘与利用。纵观近代作物育种成就，几乎无
一例外地取决于关键性优异种质资源的发现与利
用。如籼稻矮源低脚乌尖
(Sasaki et al., 2002)
、小麦
矮源农林
10
号
(Peng et al., 1999)
与世界范围的“绿
色革命”；油菜品种
Liho (Stefansson et al., 1961)
、
Bronowski (Abbadi et al., 2011)
与双低油菜新品种选
育；抗根结线虫的北京小黑豆与美国大豆生产
(Hartwig, 1981)
；矮源矮脚南特和矮子粘与我国水
稻的矮秆育种
(
潘家驹
, 1994)
；
Polima
雄性不育细胞
质与国内外杂交油菜的发展；小麦
IBL/1RS
易位系
与小麦抗锈育种
(Rabinovich, 1998)
；玉米高赖氨酸
突变体
Opaque
-
2 (Yau et al., 1999)
和大麦高蛋白、
赖氨酸
Hiprolys (
潘家驹
, 1994)
与玉米和大麦营养
品质的遗传改良等事实说明，特异种质资源对农作
物遗传改良起到了不可替代的作用。栽培稻经过长