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牛存秀等
, 2011,
小麦中
TAXI-
XIP-
TLXI
三类木聚糖酶抑制剂基因检测
,
分子植物育种
Vol.9 No.79 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0079)
1582
cDNA
序列,发现在病原防御中
XIP-R1
基因起
主要作用。比对
XIP-
XIP-R1
XIP-R2
基因序
列,其相似性较低。推测在不同小麦品种及不同组
织中有不同的
XIP
型基因表达。
TAXI
型基因家族
XIP
型不同,各基因有不同的功能。本实验所检
测的三类基因中,
TAXI-
基因所占比例最少,且
扩出的条带较弱,其原因可能是
TAXI-
型基因序
列变异性高。分析
NCBI
数据库中
TAXI-
型基因
的核苷酸序列发现,同一小麦品种可扩出不同的
TAXI-
基因序列,例如来自中国春的
6
TAXI-
序列相似性仅
70%
左右。
研究表明,
XIP
型抑制剂与糖苷水解酶
18
家族
的几丁质酶
有很高同源性,而
TLXI
型结构上与
类奇异果甜蛋白同源,因此
XIP
型和
TLXI
型可分
别归为病程相关蛋白
(pathogenesis-related proteins)
PR5
PR8
类型。
TAXI-
型抑制剂基因的表达受
病原体的诱导。已证实三类木聚糖酶抑制剂参与植
物的抗病防御反应。本实验只初步分析了不同小麦
品种中
XIP
TAXI-
TLXI
三类木聚糖酶抑制
剂基因的分布,各家族亚型之间的相关性及其与抗
病性的关系还需要进一步深入研究。
3
材料与方法
3.1
试验材料
本实验选用了国内以及国外引种的
260
份小麦
品种进行分子克隆检测,其中包括引种材料
35
份、
地方品种
1
份、育成或推广品种
224
份。国内品种
/
品系分别来自陕西、四川、重庆、河南、山东、河
北、安徽、江苏、云南、湖北等多个不同麦区,实
验材料具有一定的代表性和广泛性。
3.2
试验方法
3.2.1
引物的合成
参 照
Igawa
Fierens
等 人 发 表 的 引 物 ,
XIP-1/F1/XIP-1/R1
引物对特异扩增
XIP-
基因序
列;
TAXI-5/TAXI-3
引物对特异扩增
TAXI-
序列;
Lintf/Xi2
引物对特异扩增
TLXI
序列。
PCR
特异引
物均由上海生工生物工程技术服务有限公司合成
(
见表
1)
1
木聚糖酶抑制蛋白基因扩增引物
Table 1 Xylanase inhibiting protein genes amplification primers
扩增基因
Amplification gene
引物名称
Primers
name
引物序列
(5to3)
Primers sequences (5to3)
扩增长度
Length
退火温度
Annealing
temperature
参考文献
Reference
XIP-
XIP-1/F1
XIP-1/R1
CTAGCCAGTACTTGGAGAAACCAA
GGATCAAACCGACGGTGATGCAAG
939
59
Igawa et al.,
2005
TAXI-
TAXI-5
TAXI-3
CAAGAAAGATGCCACCAGTG
GTAGTGGACGAATCCACCTGTC
1256
58
Fierens et al.,
2003
TLXI
Lintf
Xi2
CAAGCGCGGCACCGCTCACCATC
AATACCTGACACACGTGTACGG
561
55
Fierens et al.,
2003
3.2.2
基因组总
DNA
的提取
2
粒小麦籽粒磨碎,参照孙道杰博士论文
麦籽粒
PPO
活性分子标记及面粉黄色素相关基因研
中描述的方法
(
孙道杰
, 2005)
,提取小麦基因组总
DNA
,用
1.2
%琼脂糖凝胶电泳检测
DNA
质量。
3.2.3 PCR
检测
PCR
扩增于
BIO-RAD My Cycler 1.0
上进行。
反应体系为:总体积
10 μL
,其中含有
0.25 mmol/L
dNTP
1×PCR Buffer
2.5 mmol/L Mg
2+
,上下游引
物各
0.25 μmol/L
0.5 U DNA
Taq
聚合酶,
40 ng
板共
30
个循环;最后
72
延伸
5 min
4
保存。
PCR
扩增产物用
2.0
%琼脂糖凝胶,
DNA
PCR
反应条件为:
94
预变性
5 min
94
50 sec
50 ~60
℃ ℃
退火
55 sec
72
延伸
l min
120V
恒压电泳分离,
EB
染色,凝胶成像系统照
相保存。
作者贡献
牛存秀、高雅、陈璨是本研究的实验设计和实验研究