谭君等
, 2011, 2005-2009
年贵州省玉米区试组合遗传多样性的
SSR
分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.58 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0058)
1432
丽华等
, 2009)
,但对贵州省区试组合的遗传多样性
分析却少有报道。本研究采用
SSR
分子标记方法,
从 《 中 华 人 民 共 和 国 农 业 行 业 标 准
(NY/T
1432
-
2007)
》中筛选出
20
对玉米
SSR
核心引物,对
贵州省
2005
-
2009
年区域试验中的
178
个玉米组合
进行遗传多样性分析,旨在了解贵州省玉米新品种
的遗传多样性特点及其近
5
年来的变化趋势,以期
为今后拓宽贵州省玉米种质的遗传基础和新品种
的选育、鉴定以及保护提供参考。
1
结果与分析
1.1 SSR
引物多态性分析
利用
20
对玉米
SSR
核心引物对
178
个玉米参试
组合进行了
DNA
分析,结果表明共检测到
107
个等
位基因位点,每对
SSR
引物等位基因数变异范围为
3~7
个,绝大部分为
5~6
个,平均
5.35
个
(
表
1)
。其中
phi116
的等位基因数最多,有
7
个;
bnlg1191
的等位
基因数最少,只有
3
个。
1.2
供试组合的遗传相似性分析
根据
20
对
SSR
核心引物在
178
份供试组合中获
得的
107
个等位基因,按
Nei
的方法用
NYSYSpc2.1
统
计分析软件计算供试组合间的遗传相似系数。所有
供试组合间的遗传相似系数变化范围在
0.430~0.916
之间,平均值为
0.630
。其中黔玉
818
与荷玉
2062
的
遗传相似系数最大,高达
0.916
;
PGX
-
5
与兴单
13
的遗传相似系数最小,为
0.430
。根据计算获得的遗
传相似系数,以
0.02
为组距进行次数分布分析,结
果见图
1
。由图可知,供试组合的遗传相似系数次
数呈正态分布。遗传相似系数在
0.570~0.710
之间的
表
1 SSR
引物、染色体位置、等位基因数目及多态性信息量
Table 1 Microsatellites, chromosome, and number of alleles for SSR markers
引物
染色体
等位基因数
引物
染色体
等位基因数
Primer
Chromosome
Number of alleles
Primer
Chromosome
Number of alleles
bnlg439
1.03
6
bnlg161
6.00
6
bnlg2331
1.11
5
phi299852
6.07
6
bnlg125
2.02
5
bnlg1792
7.02
5
mmc0191
2.07
6
phi116
7.06
7
umc2105
3.00
5
umc1741
8.03
5
bnlg1496
3.09
4
phi080
8.08
5
phi072
4.00
5
phi065
9.03
7
bnlg2291
4.06
6
bnlg1191
9.07
3
umc1705
5.03
6
umc2163
10.04
5
umc1225
5.08
5
bnlg1450
10.07
5
图
1
遗传相似系数的次数分布
Figure 1 The distribution of genetic similarity