江锡兵等
            
            
              , 2011,
            
            
              毛白杨基因组内转录区域遗传杂合水平估算
            
            
              ,
            
            
              分子植物育种
            
            
              Vol.9 No.55 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0055)
            
            
              1416
            
            
              50 (
            
            
              种植于山东冠县全国毛白杨基因库
            
            
              )
            
            
              和毛新杨无
            
            
              性系雌株
            
            
              TB01 (
            
            
              种植于中国农业大学校园内
            
            
              )
            
            
              。张德
            
            
              强等
            
            
              (2003)
            
            
              于
            
            
              2000
            
            
              年通过人工水培杂交获得
            
            
              694
            
            
              株
            
            
              种间回交子代,并将子代与亲本共同定植于北京林
            
            
              业大学苗圃内。
            
            
              2007
            
            
              年
            
            
              6
            
            
              月,对该群体进行调查,
            
            
              随机选择其中的
            
            
              132
            
            
              株进行遗传杂合度估算。
            
            
              提 取 未 成 熟 木 质 部 组 织 的
            
            
              RNA
            
            
              作 为
            
            
              cDNA-AFLP
            
            
              分析的起始材料。参照
            
            
              Sterky (2002)
            
            
              的
            
            
              方法并进行相关改进,对未成熟木质部进行取样。
            
            
              具体方法如下:用解剖刀在树干胸径处向南一侧树
            
            
              皮上
            
            
              (
            
            
              同一方向取样
            
            
              )
            
            
              切割出
            
            
              5 cm
            
            
              ×
            
            
              5 cm
            
            
              大小的方
            
            
              块,拨开树皮后木质部外的几层水状细胞即为未成
            
            
              熟木质部组织,刮取、收集未成熟木质部组织并迅
            
            
              速冻存至液氮中,带回北京林业大学实验室进行
            
            
              RNA
            
            
              提取工作。
            
            
              3.2 RNA
            
            
              提取
            
            
              RNA
            
            
              提取采用
            
            
              RNessy Plant Mini Kit (Qiagen)
            
            
              ,
            
            
              操作步骤参见试剂盒说明书,在提取过程中,加入
            
            
              DNA
            
            
              酶
            
            
              (Qiagen)
            
            
              完全清除残留的
            
            
              DNA
            
            
              ,
            
            
              50 μL
            
            
              去离子
            
            
              水洗脱后,取
            
            
              2 μL
            
            
              用
            
            
              1%
            
            
              琼脂糖凝胶电泳检测,其余
            
            
              放入-
            
            
              80
            
            
              ℃冰箱中待用。
            
            
              3.3 cDNA
            
            
              合成
            
            
              对提取的总
            
            
              RNA
            
            
              进行电泳检测,选取质量较高
            
            
              的总
            
            
              RNA
            
            
              进行
            
            
              cDNA
            
            
              合成,采用
            
            
              Reverse Transcription
            
            
              System (Promega)
            
            
              合成
            
            
              cDNA
            
            
              第一链,具体操作方法
            
            
              见试剂盒说明书;
            
            
              cDNA
            
            
              第二链的合成参照
            
            
              Sambrook
            
            
              等
            
            
              (2002)
            
            
              方法。
            
            
              3.4 cDNA-AFLP
            
            
              分析
            
            
              cDNA-AFLP
            
            
              操作参考
            
            
              Bachem
            
            
              等
            
            
              (1998)
            
            
              的方法,
            
            
              内切酶为
            
            
              Eco
            
            
              R
            
            
              Ⅰ和
            
            
              Mse
            
            
              Ⅰ。电泳条件为恒功率
            
            
              95 w
            
            
              ,
            
            
              6%
            
            
              聚丙烯酰胺凝胶电泳
            
            
              2 h
            
            
              ,硝酸银染色,碳酸钠
            
            
              溶液显影后进行结果统计分析。
            
            
              3.5
            
            
              杂和水平分析
            
            
              根据
            
            
              Cervera
            
            
              等
            
            
              (2001)
            
            
              研究方法,在子代中分离
            
            
              的总标记数与所观察到的总标记数之比被定义为
            
            
              平均遗传杂合水平。
            
            
              作者贡献
            
            
              江锡兵、李博、宋跃朋和王泽亮是本研究的实验设计和
            
            
              实验研究的执行人;江锡兵及李博完成数据分析,论文初稿
            
            
              的写作;宋跃朋、王泽亮和安新民参与实验设计,试验结果
            
            
              分析;张志毅是项目的构思者及负责人,指导实验设计,数据
            
            
              分析,论文写作与修改。全体作者都阅读并同意最终的文本。
            
            
              致谢
            
            
              本 研 究 由 国 家 林 业 公 益 性 科 研 专 项 经 费 项 目
            
            
              (201004009)
            
            
              资助,作者感谢张德强教授在本实验过程中的
            
            
              技术支持和有益的建议。
            
            
              参考文献
            
            
              Bachem C., Oomen R., and Visser R., 1998, Transcript imaging
            
            
              with cDNA-AFLP: a step by step protocol, Plant Mol. Biol.
            
            
              Rep., 16(2): 157-173
            
            
              Baird N.A., Etter P.D., Atwood T.S., Currey M.C., Shiver A.L.,
            
            
              Lewis Z.A., Selker E.U., Cresko W.A., and Johnson E.A.,
            
            
              2008, Rapid SNP discovery and genetic mapping using
            
            
              sequenced RAD markers, PLoS ONE, 3(10): e3376
            
            
              (doi:10.1371/journal.pone.0003376)
            
            
              Bradshaw H.D., and Stettler R.F., 1995, Molecular genetics of
            
            
              growth and development in
            
            
              Populus
            
            
              ,
            
            
              Ⅳ
            
            
              , Mapping QTLs
            
            
              with large effects on growth, form, and phenology traits in a
            
            
              forest tree, Genetics, 139(2): 963-973
            
            
              Bradshaw H.D., Villar M., Watson B.D., Otto K.G., Stewart S.,
            
            
              and Stettler R.F., 1994, Molecular genetics of growth and
            
            
              development in
            
            
              Populus
            
            
              ,
            
            
              Ⅲ
            
            
              , A genetic linkage map of a
            
            
              hybrid poplar composed of RFLP, STS and RAPD markers,
            
            
              Theor. Appl. Genet., 89(2-3): 167-178
            
            
              Brugmans B., Carmen A.F., and Bachem C.W.B., 2002, A novel
            
            
              method for the construction of genome wide transctiptome
            
            
              maps, The Plant Journal., 31(2): 211-222
            
            
              Cervera M.T., Storme V., Ivens B., Gusmao J., Liu B.H., Hostyn
            
            
              V., Slycken J.V., Montagu M.V., and Boerjan W., 2001,
            
            
              Dense genetic linkage maps of three
            
            
              Populus
            
            
              species
            
            
              (
            
            
              Populus deltoides
            
            
              ,
            
            
              P. nigra
            
            
              and
            
            
              P. trichocarpa
            
            
              ) based on
            
            
              AFLP and Microsatellite markers, Genetics, 158(2): 787-809
            
            
              De Diego J.G., Rodriguez F.D., Lorenzo J.L.R., Granppin P., and
            
            
              Cervantes E., 2006, cDNA-AFLP analysis of seed
            
            
              germination in
            
            
              Arabidopsis thaliana
            
            
              identifies transposons
            
            
              and new genomic sequences, Journal of Plant Physiology,
            
            
              163(4): 452-462
            
            
              Geuna F., Banfi R., and Bassi Daniele., 2005, Identification and
            
            
              characterization of transcripts diffsrentially expressed during
            
            
              development of apricot (
            
            
              Prunus armeniaca
            
            
              L.) fruit, Tree
            
            
              Genet Genomes, 1(2): 69-78
            
            
              He C.Z., 2005, Sutdy on Genetie Diversiy and Origin of
            
            
              Populus
            
            
              tomentosa
            
            
              Carr., Dissertation for Ph.D., Beijng Forestry
            
            
              University, Supervisor: Zhang Z.Y., pp.58-71 (
            
            
              何承忠
            
            
              , 2005,