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李跃飞等
, 2011,
大白菜桔红心基因
or
SSR
标记定位
,
分子植物育种
Vol.9 No.53(doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0053)
1399
由北京赛百盛公司合成。
3.3
桔红心性状遗传分析
配制杂交组合
Chiifu×07 A 163
,利用
120
F
1
代和用于
or
基因定位的
600
F
2
代群体进行桔红
心基因遗传特性的分析,在植株成熟期剖球,肉眼
调查
2
世代各单株心叶颜色。
3.4 DNA
提取和基因池的构建
提取方法采用
CTAB
(Murray and Thompson,
1980)
并略有改动,将提取的
DNA
调整至
50 ng /μ
待用。由于无法区分白心单株基因型,所以只选用
F
2
代桔红心单株构建了
3
个基因池,利用双亲和构
建的
3
个池进行
BSA (bulked segregant analysis)
(Michelmore et al., 1991)
3.5 PCR
扩增程序与产物检测
PCR
反应在
BIO-RAD
上进行,采用
10 μL
应体系:
25 ng
模板
DNA
0.8 μL 2.5 mM d NTP
1.2 μL 10×Buffer (
Mg
2+
)
1μL 0.5 μmol/L primer
1U
Taq
polymerase
PCR
反应程序为:
95
预变性
5 min
95
变性
30 s
57
退火
30 s
72
延伸
30 s
循环
30
次后,
72
保温
5 min
。扩增产物置
4
箱贮藏备用,
6 %
聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,聚丙
烯酰胺凝胶电泳在北京六一
DYCZ 220C
型电泳槽
上进行,预电泳
30 min
后上样
4 μL
60 W
恒功率
电泳
1 h
,银染显色。
3.6
连锁分析与
or
基因定位
根据分离条带基因型,用
Mapmaker/Exp 3.0
(Lander et al., 1987)
or
基因的遗传连锁关系进
行分析
(LOD=3.0)
并将其定位于相应的染色体上,
Kosambi
函数
(Kosambi, 1944)
换算成遗传距离。
作者贡献
冯辉和李跃飞是本研究的实验设计和实验研究的执行
人;李跃飞完成数据分析,论文初稿的写作;冯辉和刘志勇
及刘静参与实验设计,试验结果分析;冯辉是项目的构思者
及负责人,指导实验设计,数据分析,论文写作与修改。全
体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
本研究由国家
863
计划项目
(2006AA10Z170)
和教育部
高 等 学 校 博 士 学 科 点 专 项 科 研 基 金 资 助 课 题
(20092103110001)
共同资助。本文中提到了我们实验中涉及
的有关试剂供应商和测序服务商,这并非我们为这些试剂供
应商和测序服务商的产品和服务提供推荐或背书。
参考文献
Belaj A., Satovic Z., Cipriani G., Baldoni L., Testolin R., Rallo
L., and Trujillo I., 2003, Comparative study of the
discriminating capacity of RAPD, AFLP and SSR markers
and of their effectiveness in establishing genetic
relationships in olive, Theor. Appl. Genet., 107(4):
736-744
Choi S.R., Teakle G.R., Plaha P., Kim J.H., Allender C.J.,
Beynon E., Piao Z.Y., Soengas P., Han T.H., King G.J.,
Barker G.C., Hand P., Lydiate D.J., Batley J., Edwards D.,
Koo D.H., Bang J.W., Park B.S., and Lim Y.P., 2007, The
reference genetic linkage map for the multinational
Brassica rapa genome sequencing project, Theor. Appl.
Genet., 115(6): 777-792
Crisp P., Walkey D G A., Bellman E., and Roberts F., 1975, A
mutation affecting curd colour in cauliflower (
Brassica
oleracea
L. var.
botrytis
D C), Euphytica, 24(1): 173-176
Dickson M.H., Lee C.Y., and Blamble A.E., 1988, Orange-curd
high carotene cauliflower inbreds, HortScience, 23:
778-779
Feng H., Wei P., Piao Z.Y., Liu Z.Y., Li C.Y., Wang Y.G.., Ji
R.Q., Ji S.J., Zou T., Choi S.R., and Lim Y.P., 2009, SSR
and SCAR mapping of a multiple-allele male-sterile gene
in Chinese cabbage (
Brassica rapa
L.), Theor. Appl.
Genet., 119(2): 333-339
Kosambi D.D., 1943, The estimation of map distance from
recombination values, Ann Eugen, 12(1): 172-175
Lander E.S., Green P., Abrahamson J., Barlow A., Daly M.J,
Lincoln S.E, and Newbury L.A, 1987, MAPMAKER: an
interactive computer package for constructing primary
genetic linkage maps of experimental and natural
populations, Genomics, 1(2): 174-181
Li L., Paolillo D.J., Parthasarathy M.V., DiMuzio E.M., and
Garvin D.F., 2001, A novel gene mutation that confers
abnormal patterns of β-carotene accumulation in
cauliflower (
Brassica oleracea
var.
botrytis
), The Plant
Journal, 26(1): 59-67
Li L., Lu S., D.M. O'Halloran, Garvin D.F., and Vrebalov J.,
2003a, High-resolution genetic and physical mapping of
the cauliflower high-β-carotene gene Or (Orange),
Molecular Genetics and Genomics, 270(2): 132-138
Li L., Garvin D.F., 2003b, Molecular mapping of Or, a gene
inducing β-carotene accumulation in cauliflower (
Brassica