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闫小燕等
, 2011,
冷诱导基因
wcs19
与小麦抗寒性关系研究
,
分子植物育种
Vol.9 No.45 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0045)
1341
3.2
试验方法
3.2.1
小麦抗寒性鉴定
采用麦芽冰冻恢复力鉴定法,具体方法为:随
机挑选
50
粒小麦种子,放在铺有湿润滤纸的培养
皿内,室内发芽。当麦芽长到
1 cm~2 cm
时,将其
移到
4
冰箱锻炼
10 d
,然后放置到-
20
冰冻
12 h
取出后移到
4
冰箱解冻一天,最后在室温下恢复
生长
3 d
,记录麦芽总数和存活麦芽数,计算麦芽
冰冻恢复率
(
董玉琛等
, 2000)
麦芽冰冻恢复率
=
存活麦芽数
/
麦芽总数
×100%
根据麦芽冰冻恢复率,比较小麦样品间的抗寒性。
3.2.2
引物的设计与合成
基于
GenBank
登录号为
L13437
mRNA
列,运用
Primer premier 5.0
软件进行引物设计,并
Oliger
软件对引物进行分析,共设计分析了
4
引物,详见表
2
2
wcs19
基因的特异引物序列
Table 2 Specific primers sequence of
wcs19
genes
引物编号
Primer name
引物序列
Primer sequence
引物位置
Primer location
Tm
目标长度
Target length
Wcs19a
F: 5′
-
GACCAATGGCTTCTTCTTCC
-
3′
R: 5′
-
GGCGACTTTGTCCGTGAT
-
3′
44 465
59.7
422 bp
Wcs19b
F: 5′
-
CTACCCTACCCACCCATCC
-
3′
R: 5′
-
ACATTAACAGTGCGGTAATCCT
-
3′
7 631
57.7
625 bp
Wcs19c
F: 5′
-
GACCAATGGCTTCTTCTTCC
-
3′
R: 5′
-
TGAGCGATACAGATCGGACTA
-
3′
44 530
58.9
487 bp
Wcs19d
F: 5′
-
CACAACCTACCCTACCCACC
-
3′
R: 5′
-
CTCCTCCGTCGCCTTCTT
-
3′
1 414
59.2
414 bp
以上引物均由上海生工生物工程技术服务有
限公司合成。
3.2.3
基因组总
DNA
的提取
采用
SDS—Tris
饱和酚法提取小麦基因组总
DNA(Gale et a1., 2001)
,用
1.5%
琼脂糖电泳检测
DNA
质量。
3.2.4 PCR
检测
PCR
扩增于
BIO-RAD My Cycler 1.0
上进行。
反应体系为:总体积
10 μL
,其中含有
0.25 mmol/L
dNTP
1×PCR Buffer
2.5 mmol/L Mg
2+
,上下游引
物各
0.25μmol/L
0.5 U DNA
Taq
聚合酶,
40 ng
DNA
PCR
反应条件为:
94
预变性
5 min
94
1 min
50
~60
退火
1 min
72
延伸
l min
38
个循环;最后
72
延伸
8 min
4
保存。
PCR
扩增产物用
2.0%
琼脂糖凝胶,以
120V
恒压电泳分
离,
EB
染色,凝胶成像系统照相保存。
3.2.5
序列测序与分析
测序由上海英骏公司
(www.invitrogen.com)
成,应用
DNAMAN6.0
软件对测序获得的序列进行
比对分析。
作者贡献
闫小燕、周志良、徐恩静是本研究的实验设计和实验
研究的执行人;司红起、闫小燕完成数据分析,论文初稿的
写作;周志良、徐恩静参与实验设计,试验结果分析;王永
玖为本实验提供实验材料;马传喜、司红起是项目的构思者
及负责人,指导实验设计,数据分析,论文写作与修改。全
体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
本研究由现代农业产业技术体系专项经费和国家科技
支撑计划
(2009BADA6B01)
共同资助,本文中提到了我们实
验中涉及的有关试剂供应商和测序服务商,这并非我们为这
些试剂供应商和测序服务商的产品和服务提供推荐或背书。
参考文献
Chauvin L.P., Houde M., and Sarhan F., 1993, A leaf-specific
gene stimulated by light during wheat acclimation to low
temperature, Plant Molecular Biology, 23: 255-265
Dong Y.C., and Zheng D.S., 2000, Chinese wheat Genetic
resources,Agricultural Press, Beijing, China, pp.240-242