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何建文等
, 2011, 48
个辣椒地方品种
SSR
和
SRAP
标记的遗传多样性和指纹分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.30 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0030)
1224
最少。只 有将标记
CA514272
、
Hpms2-21
、
Hpms1-69
、
CA516439
、
Hpms1-139
、
BM61910
组
合起来，才能完全鉴别
48
个参试品种。这说明在
本研究中，要鉴别
48
个参试品种，最少需要
6
个
SSR
标记。
同样，一对
SRAP
引物
PCR
扩增位点标记不能
独立鉴别
48
个参试品种，
SRAP
标记
me1+em3
、
me3+em3
和
me5+em6
的
PCR
扩增位点标记分别能
鉴别
3
个材料，标记
me1+em6
的能鉴别
8
个材料，
标记
me5+em7
和
me7+em5
的分别能鉴别
12
个材
料，标记
Me2+em8
的能鉴别
16
个材料，标记
me4+em6
的能鉴别
17
个材料，标记
me2+em7
的能
鉴别
24
个材料，标记
me5+em8
的能鉴别
33
个材
料，标记
me1+em7
的能鉴别
42
个材料。利用独立
鉴别能力强的标记
me1 +em7
分别与其他
10
对进
行两两组合，只有标记
“me1+em7”+“me1+em3”
、
“me1+em7”+“me3+em3”
、
“me1+em7”+“me5+em6”
、
“me1+em7”+“me5+em8”
或
“me1+em7”+“me2+em8”
才能分别鉴别全部参试品种。这说明在本研究中，
要鉴别
48
个参试品种，最少需要
2
对
SRAP
标记。
设定品种间最小遗传距离大者为优选组合，则：上
述标记中，以
“me1+em7”+“me2+em8”
的最小遗传距
离为大
(0.28)
，因此该标记是鉴别
48
个参试品种的
最优标记。
2
讨论
在供试材料聚类分析结果中，
48
份地方品种间
最小遗传距离为
0.27
，最大遗传距离为
0.669
，品
种间的遗传差异明显，遗传多样性丰富。无论是
SSR
、
SRAP
、还是
SSR+SRAP
的分子标记聚类，
都是先从线椒开始，表明线椒品种间的遗传差异较
小，亲缘关系较近。可能与线椒
(var. logum)
和圆锥
型椒
(var. conoides)
是较为原始的
2A
核型，辣椒的
进化较早有关
(
李光涛等
, 1992;
李光涛等
, 1993)
。
部分线椒和指型椒品种、牛角椒和羊角椒品种聚为
一类，表明线型椒和指型椒、牛角椒和羊角椒之间
也有较近的亲缘关系。锥型椒则分布在各类群中，
表明锥型椒的遗传差异比较复杂，这可能与锥型椒
是辣椒栽培种中进化较早的品种有关
(
陈学军等
,
2009;
李光涛等
, 1992;
李光涛等
, 1993)
。总体来说，
SSR
、
SRAP
和
SSR+SRAP
聚类基本上可把相同果
型的品种聚为一类。周晶等
(2009)
采用
109
对
SSR
特异引物对
89
份辣椒材料进行分析，
89
份材料在
遗传相似系数
0.6
处分为两类，可以将栽培种和野
生种区分开来，将果实类型相似的种质基本都聚在
一起。罗玉娣等
(2009)
利用
2 1
对
SSR
引物在
33
个
辣椒材料中共检测到
5 4
个等位基因 ，把
33
个辣椒
材料分为五类，同个种的辣椒种质资源基本聚在一
起。这表明分子标记分类结果与形态学分类基本一
致但是，本研究中省内同一原产地的品种却大都未
被分在同一类中，而省外品种则基本上可聚在一起，
表明分子标记的分类结果与省内品种的地理来源没
有什么相关性。可见，在辣椒的遗传改良和育种中，
应主要考虑遗传差异和果型差异，其次才考虑品种
的地理来源，且主要考虑省内和省外来源品种。
在辣椒种质资源遗传多样性评价方面，大多是
利用单个分子标记进行分析评价的
(
罗玉娣等
, 2006;
周晶等
, 2009;
张素琴等
, 2009)
。本研究，利用了
SSR
标记、
SRAP
标记以及
SSR+SRAP
标记在
48
个品种中的检测数据进行聚类分析，评估品种的遗
传差异，并进行比较分析。另外，本研究在
48
个
辣椒地方品种中，
15
个
SSR
标记平均可检测多态
性等位基因
2.7
个，
11
个
SRAP
标记平均可检测多
态性等位基因
16
个，
SRAP
标记平均检测等位数是
SSR
的
5
倍，表明
SRAP
标记较
SSR
标记有较高的
多态性检测能力。这与杜晓华等
(2007)
的研究结论
一致。我们认为，基于
SSR+SRAP
标记的遗传多样
性评价，由于检测的遗传位点较多，其遗传评估比
较切合实际。如
SSR+SRAP
第Ⅳ类把大多数省外品
种分在一起，
10
个品种中
6
个来自省外，占参试
省外品种的
60%
；第Ⅴ类主要是线椒和指型椒，分
别占同类参试材料的
85.7%
和
42.8%
。
在
DNA
指纹图谱构建方面，本研究不仅构建
了
48
个辣椒品种的
SSR
和
SRAP
标记的指纹图谱，
为这些品种的真实性和纯度鉴定提供依据。而且采
用聚类分析方法，假定品种间某
(
些
)
分子标记遗传
距离大于零者为某
(
些
)
分子标记可鉴别的品种，分
析
DNA
分子标记鉴别品种的能力；并且，又假定
以品种间某
(
些
)
分子标记最小遗传距离大者为优，
筛选出鉴定参试品种所需的最小标记数。据此，参
试的
8
个品种，只需选择
CA514272
、
Hpms2-21
、
Hpms1-69
、
CA516439
、
Hpms1-139
和
BM61910
等
6
个
SSR
标记或
“me1+em7”
和
“me2+em8”
两个