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王艳敏等
, 2011,
山杨种源遗传多样性的
SSR
分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.27 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0027)
1198
供高质量的信息以及在单个微卫星位点上可做共
显性的等位基因分析，试验重复性好，结果可靠性
高等优点，是当今流行的分子标记技术之一
(
黄秦军
等
, 2002;
李新军等
, 1999;
唐荣华等
, 2002)
。
本研究对东北地区
6
个山杨纸浆材优良种源的
21
个家系
208
株山杨个体进行遗传多样性分析，为
深入研究山杨良种选育、杂交育种、杂种优势的利
用、山杨定向培育奠定基础。
1
结果与分析
1.1SSR
引物的筛选
查阅相关文献，寻找相关引物
39
对用于本次
实验，以
6
个种源的山杨基因组
DNA
为模板，对
引物进行筛选，每个样品重复
2
次，从中选出
6
对
引物用于本次实验，引物名称与序列见表
1
。
1.2
各引物在不同种源的扩增情况
利用选择的
6
对
SSR
引物
(
见表
1)
对
6
个种源
的
208
株个体进行分析，所有引物均能够在供试品
种中扩增出稳定明显的条带，说明选择的引物是适
合的。图
1
为引物
WPMS011
对部分个体扩增结果。
本研究结果表
2
表明：本研究中从文献中找到
的
39
对引物中筛选出的
6
对引物对所有
6
个种源
208
株个体中进行
PCR
检测，在引物预期产物大小
片段处共扩增出
29
个位点，其中所有条带均具有
多态性，多态位点百分率达到
100%
，每对引物扩
增的
DNA
条带的数目在
3~7
条之间，平均为
4.83
条。可见，本次研究的各种源山杨具有较大的遗传
多样性。
表
1 SSR
引物名称与序列
Table 1 Name and sequence of SSR primer
引物名称
Primer code
重复序列
Repeat sequence
引物序列
Sequence of primer
退火温度
T
m/
℃
PN1297289
GTCATCCC
ACACGACCAGCAGCAGTA
TCCGATGATGACCCTTTA
50
PN1297291
CAC
TGTTTCCGACACCAGAGT
CATAGGACATAGCAGCATC
48
PMGC-2675
GA
CACACCGACAAATTATGAGTG
TTTTAGAGTGAATTTTCCTGCG
55
PTR14
(TGG)
5
TCCGTTTTTGCATCTCAAGAATCAC
ATACTCGCTTTATAACACCATTGTC
55
WPMS01
(GA)
20
AACCACTATGCCACCTTCTT
AACTAACTCCATTCATTGCTAAA
50
WPMS011
(GT)
26
TAAAGATGATGGACTGAAAAGGTA
TAAAGGAGAATATAAGTGACAGTT
55
图
1
引物
WPMS011
对部分个体扩增结果
注
: M:
标准分子量
100 bp DNA Ladder; 1~45:
不同山杨个体代码
Figure 1 The result of PCR for some individuals by primer WPMS011
Note: M: marker Ladder Plus 100 bp DNA Ladder; 1~45: Different codes of
P. davidiana