蔡秋华等
, 2011,
利用
SSR
分子标记评价高代恢复系及遗传多样性分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.17 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0017)
1123
性状的新品种,常常在原有优良亲本材料的基础上
进行杂交改良创制新材料。在加快育种进程的同
时,也造成了创制的新品种遗传基础狭窄,对育种
水平的进一步提高有极大的局限性
(
王颖姮等
,
2009)
。在常规育种中,主要依据育种经验及株型选
择来选育新材料,源于同一供体亲本的株系间较难
筛选到遗传差异大的种质。复合杂交育种、航天诱
变育种等技术能够在一定程度上创造更多的变异
类型,丰富遗传基础,但在丰富遗传基础的同时,
性状的稳定需更多的世代,甚至加代至高代仍未能
稳定性状,给新品种选育带来了新的挑战。
DNA
分子标记在研究水稻材料遗传多样性中
被广泛应用。其中基于
PCR
的
SSR
分子标记快捷
简便,重复性好且多态性丰富,在水稻遗传多样性
检测中得到广泛应用,此外
SSR
标记不仅能够鉴
定纯合体和杂合体,而且结果可靠,方法简单,省
时省力
(
白玉
, 2007)
。王秋实
2007)
利用
64
对
SSR
引物对
38
份材料进行分析,鉴定到多份遗
传差异较大的材料,并提出选用抗病材料与遗传差
异大的材料杂交选育新的抗病新品种的策略。段世
华等
(2002)
采用
SSR
分子标记技术对
35
份恢复系
材料进行遗传多样性分析,结果表明我国杂交水稻
恢复系资源丰富但遗传差异较小,遗传背景较为单
一。吕广磊等
(2009)
采用
64
对
SSR
标记对
96
份云
南地方品种及选育品种进行比较分析,表明云南栽
培稻选育品种与地方品种亲缘关系较近,其遗传基
础可能源于云南地方品种,同时也认为云南地方品
种遗传多样性丰富,存在大量优质性状可供育种实
践选择。因此,如何有效地利用较为丰富的种质资
源,创制新材料,提高育种效率是目前急待解决的
难题。运用
SSR
标记技术分析评价复合杂交系谱选
育的高代恢复系
(8~10
代
)
稳定性及遗传多样性尚未
见到报道。本研究采用
SSR
分子标记技术,对源于
诱变、籼粳杂交及复合杂交为一体的高代恢复系材
料
(8~10
代
)
进行遗传稳定性评价和遗传多样性分
析,为进一步利用这些高代恢复系材料进行杂交水
稻新组合的配制提供依据并为分子标记技术评价
遗传稳定性提供参考。
1
结果与分析
1.1 27
份高代恢复系材料的
SSR
扩增结果
本实验选用水稻新品种鉴定用的
24
对
SSR
标
记对
27
份水稻高代恢复系材料进行遗传多样性分
析,结果显示所有引物均能扩增出稳定清晰可辨的
扩增产物。
24
对引物共扩增出
165
条
DNA
带,其
中
9
对引物具有共
38
个多态性位点,占总条带的
23.03%
。每对引物检测出
2~8
个多态性片段,平均
4.2
个。每个多态性
SSR
位点的多态性信息量
(PIC)
变化范围在
0.299~0.866
,平均值为
0.592 (
表
1)
。
图
1
为引物
RM71
对供试的
27
份材料的
SSR
电泳
图,图中所示的具有不同的
SSR
带型,多态性检测
率较高,另从该图也可看出部分株系具有共显性的
杂合带型,说明该部分株系材料还有待进一步加代
稳定农艺性状。
表
1 9
对
SSR
引物在
27
份高代恢复系材料中检测到的等位变异数和多态性
Table1 Allele numbers and PIC value of 9 SSR loci detected in 27 high generation restorer lines of hybrid rice
编号
NO.
SSR
引物
SSR Markers
染色体位置
NO.of Chromosome
重复单位
Repeat Units
多态位点数
Allele numbers of polymorphisms
PIC
值
Value of PIC
1
RM17
12
(GA)
21
6
0.847
2
RM18
7
(GA)4AA(GA)(AG)
16
8
0.865
3
RM71
2
(ATT)10T(ATT)
4
8
0.866
4
RM209
11
(CT)
18
3
0.571
5
RM219
9
(CT)
17
3
0.537
6
RM224
11
(AAG)8(AG)
13
2
0.493
7
RM273
4
(GA)
11
2
0.495
8
RM336
7
(CTT)
18
3
0.299
9
RM337
8
(CTT)4
-
19
-
(CTT)
8
3
0.357