基因组学与生物技术
(
网络版
), 2013
年
,
第
2
卷
,
第
1-2
页
Jiyinzuxue Yu Shengwu Jishu (Online), 2013, Vol.2, 1-2
Copyright © 2013 5
th
Publisher
1
本刊评论
The Editorial
鳞翅目模式害虫小菜蛾基因组破译
The Genome of Diamondback Moth Sequenced, a Model Pest in Lepidoptera
Silas Xie
《基因组学与生物技术》编辑部,
British Columbia, Canada
通讯作者
: silas@sophiapublisher.com;
作者
基因组学与生物技术
, 2013
年
,
第
2
卷
,
第
1
篇
doi: 10.5376/gb.cn.2013.02.0001
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Xie S., 2013,
鳞 翅 目 模式 害 虫 小 菜 蛾基 因 组 破 译
,
基 因 组 学 与 生 物 技术
(online) Vol.2 No.1 pp.1-2 (doi:
10.5376/gb.cn.2013.02.0001)
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(
英文
)
:
Xie S., 2013, The Genome of Diamondback Moth Sequenced, a Model Pest in Lepidoptera, Jiyinzuxue Yu Shengwu Jishu (online)
Vol.2 No.1 pp.1-2 (doi: 10.5376/gb.cn.2013.02.0001)
摘
要
2013
年
1
月
14
日,国际著名学术期刊《
Nature Genetics
》上在线发表小菜蛾基因组测序的研究
成果,论文题目为《
A heterozygous moth genome provides insights into herbivory and detoxification
》。这项
研究由福建省福建农林大学主持,由福建农林大学和深圳华大基因研究院共同完成,英国剑桥大学等多家
单位参与。获得了
1 819
条
scaffold
序列
(N50=737 kb)
,大小约为
343 Mb
的小菜蛾基因组;预测到了
18 071
个蛋白质编码基因和
1 412
个小菜蛾特有的基因。小菜蛾基因组的测序对深入了解和阐明昆虫与寄主植物
协同进化的相互关系及分子机理,进一步开展鳞翅目昆虫的基因组研究具有里程碑意义。
关键词
小菜蛾;基因组;破译
2013
年
1
月
14
日,国际著名学术期刊《
Nature
Genetics
》上在线发表小菜蛾基因组测序的研究成
果,论文题目为《
A heterozygous moth genome pro-
vides insights into herbivory and detoxification
》。这项
研究由福建省福建农林大学主持,由福建农林大学
和深圳华大基因研究院共同完成,英国剑桥大学等
多家单位参与。
小菜蛾属鳞翅目菜蛾科,学名:
Plutella xylostella
(L.)
,英文名:
Diamondback moth
,被认为是分布
最广泛的世界性鳞翅目害虫。由于小菜蛾发生世
代多,繁殖能力强,寄主范围广,因此,也被作
为研究鳞翅目昆虫的一个模式害虫。通过研究小
菜蛾基因组,对于揭示小菜蛾与十字花科植物协
同进化及其抗药性的适应进化与治理等均具有重
要的科学价值。
大多数农业害虫基因组自身高度杂合、结构变
异复杂的特点以及动物自交衰退的遗传特性,要获
得理想的全基因组测序是一项十分挑战的工作。对
小菜蛾基因组测序,不但首先要构建小菜蛾自交品
系,而且还要对不同自交世代的单个个体的基因组
变异进行比较。该研究组采用
Fosmid-to-Fosmid
结
合基于全基因组鸟枪法
(WGS)
策略进行小菜蛾基因
组测序和组装,解决了大片段重叠序列组装和杂合
区域排除的技术难题,最终获得了
1 819
条
scaffold
序列
(N50=737 kb)
,大小约为
343 Mb
的小菜蛾基因
组
(
图
1)
;预测到了
18 071
个蛋白质编码基因和
1 412
个小菜蛾特有的基因
(You et al., 2013)
。
收稿日期:
2013
年
01
月
17
日
接受日期:
2013
年
01
月
21
日
发表日期:
2013
年
01
月
22
日
Doi: 10.5376/gb.cn.2013.02.0001