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水生生物研究
, 2012
年
,
第
1
卷
,
第
1-6
页
Shuisheng Shengwu Yanjiu, 2012, Vol.1, 1-6
http://aor.5th.sophiapublisher.com
3
表
1
中华鳖
5
个群体
11
个微卫星位点的遗传多样性参数
Table 1 The parameters of genetic diversity of five populations of
Trionyx sinensis
at 11 microsatellite loci
位点
Loci
洞庭
(DT)
黄河
(HH)
黄沙
(HS)
日本
(RB)
绿卡
(LK)
Dongting(DT)
Huanghe(HH)
Huangsha(HS)
Riben(RB)
Lvka(LK)
Na Ne
PIC
Na Ne
PIC
Na Ne
PIC
Na Ne
PIC
Na Ne
PIC
P-01
3
2.8986 0.5812 3
2.9557 0.5876 4
1.7094 0.3894 4 3.0303 0.6125 4 2.6987 0.5627
P-04
3
2.4357 0.5052 3
2.1978 0.4415 3
2.9364 0.5851 3 1.8349 0.3656 3 1.9417 0.3825
P-05
3
1.1834 0.1470 3
1.1443 0.1213 3
2.0955 0.4166 3 2.5388 0.5380 3 1.3564 0.2415
P-06
3
1.8672 0.3832 3
1.8730 0.3720 2
1.9231 0.3648 2 1.5571 0.2938 3 1.8237 0.3754
P-09
5
3.6961 0.6813 5
3.1469 0.6217 5
3.7344 0.6936 3 2.4862 0.5169 5 4.1190 0.7147
P-10
3
1.8967 0.3988 3
2.4759 0.5095 3
2.9801 0.5904 3 1.7946 0.3585 3 2.2613 0.4778
P-11
3
1.9715 0.3867 3
1.6202 0.3212 2
1.9802 0.3725 3 1.2649 0.1935 3 1.9417 0.4064
P-12
4
1.4096 0.2697 3
1.3072 0.2142 3
1.2262 0.1754 2 1.0339 0.0323 4 1.7459 0.3892
PS-04
4
1.5721 0.3362 5
1.5345 0.3333 3
1.2685 0.1990 1 1.0000 0.0000 4 1.4140 0.2750
PS-11
5
2.7607 0.5908 5
2.5388 0.5678 6
1.4252 0.2883 6 3.4749 0.6687 6 2.3018 0.5381
HLJZHB
076
6
4.2959 0.7340 4
2.6866 0.5674 5
3.2907 0.6502 4 2.1924 0.4424 6 4.7619 0.7612
注
: N
a
:
等位基因数
; N
e
:
有效等位基因数
; PIC:
多态信息含量
Note: N
a
: Number of alleles; N
e
: Effective number of alleles, PIC: Polymorphism information content
表
2
中华鳖
5
个群体的平均遗传多样性参数
Table 2 The average value of genetic diversity parameters of five populations of
Trionyx sinensis
群体
平均有效等位基因
平均等位基因数
平均观测杂合度
平均期望杂合度
平均多态信息含量
Population
Ne
Na
Ho
He
CPI
洞庭
(DT)
黄河
(HH)
黄沙
(HS)
日本
(RB)
绿卡
(LK)
2.3625
2.1346
2.2336
2.0189
2.3969
3.8182
3.6364
3.5455
3.0909
4.0000
0.4939
0.5242
0.5333
0.4333
0.5545
0.5194
0.5121
0.4955
0.4278
0.5274
0.4560
0.4230
0.4300
0.4020
0.4660
表
3
中华鳖
5
个种群的
F
-统计量
(FST)
Table 3 Pairwise F-statistics estimates among five populations of
Trionyx sinensis
洞庭
(DT)
黄河
(HH)
黄沙
(HS)
日本
(RB)
绿卡
(LK)
Tongting(DT)
Huanghe(HH)
Huangsha(HS)
Riben(RB)
Lvka(LK)
洞庭
(DT)
Tongting(DT)
****
****
****
****
****
黄河
(HH)
Huanghe(HH)
0.0233
****
****
****
****
黄沙
(HS)
Huangsha(HS)
0.0558
0.0463
****
****
****
日本
(RB)
Riben(RB)
0.0969
0.0713
0.0691
****
****
绿卡
(LK)
Lvka(LK)
0.0256
0.0276
0.0487
0.0925
****
只有洞庭
(DT)
和黄河
(HH)
的杂交种绿卡
(LK)
的最
高，为
0.466 0
，接近
0.5
属于中度水平。吉磊等
(2011)
对卵形鲳鰺
3
个养殖群体的微卫星多态性进行分析
发现养殖群体的多态信息含量都处于
0.5
左右，属于
中度接近高度多态水平；蔡磊等
(2012)
对大口黑鲈
北方亚种和佛罗里达亚种及其杂交子代进行遗传
分析，其北方亚种和佛罗里达亚种的多态信息含量
(PIC)
分别为
0.450 6
和
0.465 2
，同样低于
0.5
。分析
原因有二，一是采样问题，因为本实验的采样都是
于良种场，都是经过了有意图定向选育的后代，多
态含量肯定会有所下降，这跟张海琪等
(2011)
运用
RAPD
对培育的中华鳖新品种日本品系和清溪乌鳖
的遗传多样性分析结果类似；二是微卫星引物的选
取也会影响到
PIC
值的大小，因为有几对引物扩增
的结果显示此位点的等位基因数极少且稳定，为保
守位点，可能是中华鳖进化过程中最原始最保守的