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分子植物育种
(
网络版
)
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online)
1013
2
根、茎、叶蛋白质浓度测定
Table 2 Concentration of the proteins extracted from roots, stems and leaves of soybean
A1
StemA1
A2
StemA2
A3
StemA3
B1
LeafB1
B2
Leaf B2
B3
Leaf B3
T1
Root T1
T2
Root T2
T3
Root T3
样品体积
(μL)
Volume (μL)
10
10
10
10
10
10
10
10
10
水化液
(μL)
Lysis buffer(μL)
90
90
90
90
90
90
90
90
90
G250
5
5
5
5
5
5
5
5
5
读数浓度
(μg/μL)
Reading concentration
(μg/μL)
0.3
0.8
0.6
1.2
0.4
1.2
0.3
0.5
0.8
实际浓度
Real concentration
3
8
6
12
4
12
3
5
8
3
等电聚焦程序表
Table 3 Steps of IEF
步骤
Step
电压
Voltage
泳动状态
Condition
时间
Time
S1
50 V
Slow
10 min
S2
250 V
Rapid
30 min
S3
1000 V
Rapid
30 min
S4
9000 V
Line
4 h:15 min
S5
9000 V
Rapid
65000 VH
其他参数:
GELS : 2
Limit : 50
Temp: 20
℃。
3.2.3
蛋白质
SDS-PAGE
平衡前,按
2
块胶
(17 cm
胶条
)
的量
(150 mL)
12.5%
SDS-PAGE
凝胶液如下:①
ddH
2
O 62.7 mL
30%
丙烯酰胺溶液
Acr/Bis 83.3 mL
;③
1.5 mol/L
Tris (pH 8.8) 50 mL
;④
10% SDS2 mL
;Ⅰ
10% APS
过硫酸氨
2 mL
;Ⅱ
TEMED 35.6~40 μL
。按顺序加
入试剂①②③④,用玻棒缓慢搅拌混匀
15~30 mim
再加入试剂Ⅰ、试剂Ⅱ,缓慢混匀后即可灌胶,用
异丙醇密封胶面。待胶凝固后,倾出异丙醇,改加
ddH
2
O
压平胶面,用保鲜膜覆盖,备用。
平衡时,
17 cm
胶条需平衡液
5 mL /
/
次。平
衡液
I
现加
(DTT, 1%
质量体积比
)
,缓慢摇晃平衡
15 min
;平衡液
II
现加
(IAA, 5%
质量体积比
)
,平衡
15 min
。平衡期间,准备蛋白分子量
Marker (
使用前
沸水煮
5 min)
将胶条和吸有蛋白分子量
Marker
的滤纸片转
入制备好的
SDS
聚丙烯酰胺凝胶。二向电泳程序,
40 mA
恒流电泳。看到溴酚蓝指示线整齐泳出后,
再将电压调至
30 mA/
根直到电泳结束。
3.2.4
考马斯亮蓝凝胶染色及扫描
电泳结束,需对凝胶中的蛋白质点进行固定,
固定液配方
(2
块胶
:
乙醇
400 mL,
乙酸
100 mL,
ddH
2
O 500 mL,
混匀
(1 000 mL)
,每块胶倒入
500 mL
固定液,固定
3 h
;循环水真空泵吸干固定液换上染
色液。考染法:
2
块胶染液配方:
ddH
2
O 200 mL
磷酸
100 mL
,硫酸铵
100 g
G250
称取
1.2 g
ddH
2
O
定容至
800 mL (
搅拌
30 min
),最后加上甲醇
200 mL
总体积
1 000 mL
。染色过夜,直到胶点明晰可辨。
二步法凝胶脱色。
2
块胶脱色液Ⅰ配方:硫酸铵
75 g
ddH
2
O
溶解后定容至
1 350 mL
,再加甲醇
150 mL
至总体积
1 500 mL
。其中
1 000 mL
用于第一次脱色
20~30 min
;剩余的
500 mL
脱色液Ⅰ,再加
500 mL
ddH
2
O
,混匀
(1 000 mL)
,即脱色液Ⅱ。第二次,脱
(
液Ⅱ
) 12~16 h
,或过夜,直至背景颜色透明而蛋
白点清晰易辨。于
GE Image Scanner
Ⅲ扫描仪上扫
描,分辨率统一设为
300 dpi
3.2.5
凝胶图像的
PDQuest 7.4
软件分析
PDQuest
软件读取
2
-
DE
图像,用点细化
(Spot
segmentation)
的方法检测和定量蛋白质斑点,主要
包括
:
斑点检测和定量、凝胶匹配、相对分子量和
等电点的确定、报告输出等。
分子植物育种
F
enzi Zhiwu Yuzhong