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分子植物育种
(
网络版
), 2013
年
,
第
11
卷
,
第
1154
-
1160
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2013, Vol.11, 1154
-
1160
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
Copyright © 2013 5
th
Publisher 1154
研究报告
Article Report
118
份水稻种质资源
SSR
遗传多样性分析
束爱萍
1,2
,
黄永兰
3
,
黎毛毛
1,2
,
刘增兵
4
,
余丽琴
1,2
1
．江西省农业科学院水稻研究所
,
南昌
, 330200
2
．水稻国家工程实验室
(
南昌
),
南昌
, 330200
3
．江西省超级水稻研究发展中心
,
南昌
, 330200
4
．江西省农业科学院土肥与资环研究所
,
南昌
, 330200
通讯作者：
lqyu480@163.com
；
作者
分子植物育种
, 2013
年
,
第
11
卷
,
第
22
篇
doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0022
这是一篇采用
Creative Commons Attribution License
进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用
,
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引用格式
(
中文
)
：
束爱萍等
, 2013, 118
份水稻种质资源
SSR
遗传多样性分析
,
分子植物育种
(online), 11(22): 1154-1160 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0022)
引用格式
(
英文
)
：
Shu et al., 2013, Analysis of Genetic Diversity of 118 Rice Germplasm Resource by SSR, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding),
11(22): 1154-1160 (doi: 10.5376/mpb.cn.2013.11.0022)
摘
要
为明确江西省农业科学院水稻研究所品种资源室保存的
118
份水稻种质资源的遗传多样性。本研究利用筛选到的
19
对
SSR
引物对其进行
PCR
扩增和遗传多样性研究。每对
SSR
引物检测的等位基因约
2~9
个，共检测到
99
个等位基因。
供试水稻种质资源间的遗传相似系数为
0.05~0.90
，平均
0.39
，表明所选水稻种质资源的遗传基础丰富，具有保存价值。聚
类分析结果显示，所选
SSR
标记不能区分水稻种质资源的籼粳亚种，这可能与利用的引物有关，也可能是因为所用的粳稻
材料与同组的籼稻材料有更大的遗传相似性。聚类结果与地理来源有密切联系。这些水稻种质资源丰富的遗传多样性将为水
稻育种亲本的选育提供了依据，减少育种工作中亲本选配的盲目性，提高育种效率。
关键词
水稻种质资源
; SSR
标记
;
遗传多样性
Analysis of Genetic Diversity of 118 Rice Germplasm Resource by SSR
Shu Aiping
1,2
, Huang Yonglan
3
, Li Maomao
1,2
, Liu Zengbing
4
, Yu Liqin
1,2
1. Rice Research Institute of Jiangxi Academyof Agricultual Sciences, Nanchang, 330200, P.R., China
2. National Engineering Laboratory for Rice(Nanchang), Nanchang, 330200, P.R., China
3. Super Rice Research and Development Center of Jiangxi, Nanchang, 330200, P.R., China
4. Soil and Fertilizer Institute of Jiangxi Academyof Agricultual Sciences, Nanchang, 330200, P.R., China
Corresponding author, lqyu480@163.com;
Authors
Abstract
19 pairs SSR markers were used in PCR and genetic diversity analysis with intent to clear the genetic diversity of 118
accesions, which collected and presevervated from Research Laboratory of Rice Resource in Rice Research Institute of Jiangxi
Academy of Agricultual Sciences. 99 bands were amplified from 19 SSR primers, with 2~9 bands per pair of primers. The genetic
similarity cofficient of 118 rice germplasm resource varied from 0.053~0.895, with an average of 0.393. Results indicated that the
genetic basis of 118 rice germplasm resources was rich and had preservative value. According to the dendrogram by UPGMA cluster
analysis with software NTSYS, 118 rice germplasm resources couldn’t distinguish as
indica
and
japonica
.This maybe relate to the
using SSR, or maybe the
japonica
material have higer genetic coefficent with the
indica
material in the same group than
japonica
material.The cluster could classify into groups acoording to geographical regions. Rich genetic diversity of above rice germplasm
will reduce blind and improve efficiency in rice breeding.
Keywords
Rice germplasm resource; SSR marker; Genetic diversity
研究背景
种质资源又称遗传资源或基因资源，是作物育
种和农业生产及其它农业科学研究中的物质基础。
育种成功的基础在于试验材料中可利用的遗传变
异及对所需性状的了解及合理的选育策略。一个育
收稿日期：
2013
年
06
月
18
日
接受日期：
2013
年
06
月
19
日
发表日期：
2013
年
07
月
22
日
基金项目：本研究由江西省农业科学院青年创新基金
(2010CQN005)
、江西省农业科学院创新基金
(2009
博
-2)
和十
二五国家科技支撑计划子课题
(2013BAD01B01)
共同资助