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分子植物育种(网络版)
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online)
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图 3 118 个水稻种质资源的聚类图
注: 右侧为材料编号, 编号与表 2 对应
Figure 3 UPGMA clustering of 118 rice germplasm resource
based on genetic similarity coefficients
Note: The number on the right is the material number, which is
corresponding to table 2
一个或者临近的亚群体中，表明这些群体的亲缘关
系较近。说明 SSR 标记聚类结果与地理来源有密切
的联系。聚类结果与前人研究结果一致。赵勇等
(2002)以 23 份水稻种质资源为研究对象，利用 16
对功能基因的 SSR 引物研究其遗传多样性，通过
SSR 可以有效的进行水稻种质资源分类、地理分布、
生态类型和系谱分析。刘炜等 (2005)用 37 对 SSR
引物研究了 72 个粳稻品种的遗传多样性，通过聚
类认为 SSR 标记能把不同来源和不同生态类型的
品种分到相应的类群。
在育种实践中，育种家要选择地理位置较远的
亲本进行选配，这样有利于创造好的育种材料。作
物种质遗传资源及遗传多样性是作物基因发掘、遗
传改良及新品种培育等研究的重要基础 (Zhao et al.,
2011; Glaszmann et al., 2010)。本试验减少了水稻育
种的盲目性，提高了育种效率。
3 材料和方法
3.1 供试材料
以江西省农业科学院水稻研究所品种资源室
近年收集和保存的材料中选取 118 份水稻种质资源
为试验材料 (表 2)。其中，东野一号和 R253 属于粳
稻类，其余为籼稻类。
3.2 SSR 引物筛选及 PCR 扩增
对吕广磊等 (2009)、束爱萍等(2009)、玄英实
等 (2010) 人研究中表现较好的引物进行筛选，得
到 19 对条带清晰、多态性较好的 SSR 引物，这
些引物均匀分布于 12 条染色体上。根据已发表的
序列 (Temnykh et al., 2000; Temnykh et al., 2001)，
引物由北京赛百盛基因技术有限公司合成。利用
筛选到了 19 对 SSR 引物对 118 份水稻种质资源
进行 DNA 多态性分析。按 Edwards 等(1991) 的
CTAB 方法提取 DNA ，且稍有修改，并进行 DNA
的纯化。 PCR 体系 (总反应体积为 20 μL) 如下：
10×PCR buffer ( 含 Mg2+) 2.0 μL，2.5 mmol/L dNTP
1.5 μL，ddH2O 12.0 μL，5 U/μL Taq 0.5 μL，2 μmol/L
SSR 引物 2.0 μL，20 ng/μL DNA 2.0 μL。扩增程序
为 94℃ 5 min (预变性) ，95 ℃ 30 s (变性)，60℃ 30 s
(退火)，72℃ 1 min (延伸)，38 个循环，然后 72℃ 10 min
( 延伸)，待温度降至 10℃后，放在 4℃冰箱内备用。
反应产物采用 6%的聚丙烯酰胺凝胶电泳，银染法
检测扩增结果。