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分子植物育种
(
网络版
), 2012
年
,
第
10
卷
,
第
1346
-
1353
页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1346
-
1353
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1350
表
2 18
份芥蓝品种
MSAP
带型分析
Table 2 DNA methylation patterns of 18 Chinese kales
MSAP
类型
MSAP Type
多态性帯数
Polymorphic bands
单态性带数
Monomorphic bands
多态性带数
Polymorphic bands
总数
Total
非甲基化片段
(
类型一
,
Eco
R
Ⅰ
+
Msp
I/
Eco
R
Ⅰ
+
Hpa
Ⅱ
)
Non methylation (First,
Eco
R
Ⅰ
+
Msp
I/
Eco
R
Ⅰ
+
Hpa
Ⅱ
)
24
86
110
总甲基化片段
Total methylation
322
甲基化片段
(
类型二
,
Eco
R
Ⅰ
+
Msp
I)
Methylation (Second,
Eco
R
Ⅰ
+
Msp
I)
50
60
110
半甲基化片段
(
类型三
,
Eco
R
Ⅰ
+
Hpa
Ⅱ
)
Hemimethylation (Third,
Eco
R
Ⅰ
+
Hpa
Ⅱ
)
11
141
152
其他甲基化变化
Other
－
60
60
的
30.61%~33.10% (F4~F10) (
李象松等
, 2010)
和甘蓝
的
53.3%~60.7% (Salmon et al., 2008)
，高于拟南芥的
24%~34% (Cervera et al., 2002)
、油菜的
15% (
陆光远
等
, 2005,
科学通报
, 50(24): 2750-2756)
和
5%~13.4%
(
柳李旺等
, 2006,
江苏农业科学
, 6: 203-206)
，暗示同
为十字花科植物，尽管亲缘关系紧密，但基因组甲
基化水平在不同物种之间还是有差别的。
MSAP
聚
类分析发现品种间遗传距离也较小，分布范围在
0.004~0.467
之间，与
RAPD
和
SRAP
检测结果基本
一致
(
陈文文等
, 2011;
李桂花等
, 2011)
，即芥蓝遗传
多样性水平较低，即使本研究参试品种较少。两个
泰国品种各具一类，可能反映了品种来源的地理差
异，毕竟本研究的多数品种来源于中国并分在一组。
十字花科植物表型和分子标记分类常不一致，
将两种鉴定方法结合运用则是评价遗传多样性比
较有效的方法
(
郭晶心等
, 2002;
杨华等
, 2006)
。本
文芥蓝齐口期、叶片数和
DNA
甲基化多态性不相
关，意味着仅根据一种鉴定来推测遗传多样性不十
分理想。究其原因可能在于芥蓝起源且主要种植在
南方地区，遗传多样性受地域限制而较低
(
陈文文等
,
2011;
李桂花等
, 2011)
，再次由于
MSAP
只检测
CCGG
位点甲基化水平，即不能反映出其它类型甲
基化变异，检测出的甲基化水平偏低，最后检测不
出基因组序列变化，所以出现两种分类不一致的现
象。研究发现拟南芥表观遗传变异可占植株高度和
开花时间表型变异
30% (Johannes et al., 2009)
，而且
拟南芥不同生态型具有不同的甲基化调控机制，使
得亲缘关系紧密的拟南芥由于甲基化多态性不相
关而不能归为一类
(Cervera et al., 2002)
，因而
DNA
甲基化与表型相关性可能无明显规律可循
(Oliver et
al., 2010)
，在芥蓝与萝卜杂种上也存在这个现象
(
李
象松等
, 2010)
，在水稻上与表型相关的表观标记更
可能出现在亲缘关系紧密的品系中
(Takata et al.,
2005)
，本文
MSAP
结果与已有分子标记研究相同，
也能够揭示地里信息，仍不失为芥蓝种质研究的
较好方法。
抽薹开花是一个受多基因和多途径调控的过
程，
DNA
甲基化参与春化作用调控
(Michaels and
Amasino, 1999; Sheldon et al., 2000)
。本研究芥蓝
DNA
甲基化多态性主要来源于非甲基化片段和半
甲基化片段，甲基化模式以半甲基化为主，说明在
自然条件下的齐口期
DNA
甲基化水平降低，与利
用去甲基化试剂
(5
-
aza)
处理降低
DNA
甲基化水平
取得的效果相同
(Burn et al., 1993; Finnegan et al.,
1998;
李梅兰等
, 2002; 2003;
汪炳良等
, 2005;
王薇
等
, 2008;
于锡宏等
, 2008)
，所以本文认为
DNA
甲
基化水平降低与芥篮齐口期调控有关，但是否如油
菜上去甲基化归因于春化作用的结论
(Filek et al.,
2006)
，还有待后续实验证实，研究也表明
MSAP
分子标记除了用于结构基因组研究，还可以用于功
能基因组研究。