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分子植物育种
(
网络版
), 2012
,
10
,
1346
-
1353
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1346
-
1353
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1347
研究背景
芥蓝
(
Brassica oleracea
L. var.
alboglabra
Bailey)
是我国南方特产蔬菜,以秋冬生产为主,收获期是齐
口期,即抽薹开花始期,此时植株正经历营养生长
向生殖生长的转换,受温光环境因素影响很大,如低
温利于春化作用诱导齐口期,而高温则阻滞生长、降
低菜薹产量和品质等
(
关佩聪和梁承愈
, 1989;
杨暹
和杨运英
, 2002;
刘厚诚等
, 2003)
,因此,齐口期不
但是生产上常用的品种分类标准,也是育种和种质
资源鉴定的重要指标。
通过模式植物拟南芥的研究发现,春化诱导开
花与微量的短暂的
DNA
甲基化水平降低相关
(Burn
et al., 1993; Finnegan et al., 1996; 1998; Sheldon et al.,
2000)
DNA
甲基化水平降低也能够诱导白菜、菜心、
萝卜和青花菜等的抽薹开花
(
李梅兰等
, 2002; 2003;
汪炳良等
, 2005;
王薇等
, 2008;
于锡宏等
, 2008)
。有
研究认为
DNA
甲基化作为表观遗传的重要形式,
参与春化途径调控并可能起着整合因子作用
(Sheldon et al., 2000)
,也有研究认为
DNA
甲基化水
平降低和春化作用是通过不同的调控途径诱导开
花时间关键基因
FLOWERING LOCUS C
(
FLC
)
下调
表达的
(Finnegan et al., 2005)
检测甲基化的诸多方法中,
MSAP (methylation
sensitive amplified polymorphism)
AFLP
原理相
同,如两者均无需了解全基因组序列信息,采用长
寡核苷酸随机引物进行
PCR
反应,利用聚丙烯酰胺
凝胶进行产物分离,既保留
RFLP
的可靠性又保留
PCR
的精确性和高效性,成为多态性检测效率非常
高的分子标记技术。不同之处是
MSAP
选用
HpalI
MspI
酶切
DNA
,这对同裂酶能够检测基因组
DNA
CCGG
位点的胞嘧啶甲基化状态
(McCle-
lland et al., 1994)
,结果
MSAP
既能象
AFLP
一样检
测基因组
DNA
的序列差异,又能检测由非序列变
化引起的表观遗传差异,演变成一种结构与功能相
结合的分子标记,在十字花科植物研究上得到广泛
应用,如拟南芥、白菜、油菜、萝卜的发育调控、种
质资源鉴定、抗逆性或多倍化后代的甲基化分析
(Cervera et al., 2002;
陆光远等
, 2005,
科学通报
,
50(24): 2750-2756;
齐心
, 2006;
李象松等
, 2010;
Salmon et al., 2008)
,但在芥蓝种质资源鉴定上还没
见报道。由于芥蓝种质资源狭窄,齐口期易受环境
因素影响,常规的分子标记技术仅能检测出基因组
结构变异,为此本研究利用
MSAP
检测
18
个芥蓝
DNA
甲基化水平,分析齐口期表观遗传多样性,探
DNA
甲基化对齐口期的影响,旨在为芥蓝育种
和栽培生产提供理论依据。
1
结果分析
1.1
芥蓝齐口期分析
18
份芥蓝齐口期和叶片数的调查结果如下
(
1)
齐口期最少为
35 d (
澄海芥蓝菜和大丰芥蓝
)
,最多
75 d (
正源澄海粗条芥蓝
)
,多数品种为
40~60 d
平均为
50 d
。齐口期叶片数最少的为
8
(
正源四季
甜芥蓝
,
白花尖叶粗苔甜芥蓝
,
甜脆黄花尖叶芥
)
,最多的为
15
(
泰国芥蓝
)
,平均叶片数为
10
片。
齐口期和叶片数相关系数为
0.296
,两者不相关,即
叶片数不随齐口期变化。变异系数表示性状离散性
特征,高值代表性状离散程度大,本研究中的齐口
期为
21%
,叶片数为
18%
,表明齐口期变异程度大
于叶片数。
根据
18
个芥蓝的齐口期和叶片数,利用
DPS
数据处理系统计算遗传距离,变化范围是
0~40
,平
均值为
12.227 6
。正源澄海粗条芥蓝和澄海芥蓝菜的
遗传距离最大
(40)
,香港白花甜芥蓝和正源大笋黄
花芥蓝、正源四季甜芥蓝和绿宝芥蓝,白花尖叶粗
苔甜芥蓝和甜脆黄花尖叶芥蓝的遗传距离最小,表
明几个品种亲缘关系最近。
利用欧式距离和类平均法进行聚类分析
(
1)
在遗传距离
10.62
处分为
3
类,第一类是齐口期为
35~50 d
之间的品种,包括白花甜芥蓝、甜脆白花
尖叶芥蓝、泰国中迟花粗茎尖叶芥兰、香港白花甜
芥蓝、正源大笋黄花芥蓝、中花芥蓝、顺宝芥蓝、
白花尖叶粗苔甜芥蓝、甜脆黄花尖叶芥蓝、大丰芥
蓝和澄海芥蓝菜。第二类是齐口期为
55~60 d
的品
种,包括正源大笋香菇芥蓝、大芯四季香菇芥蓝
104
、正源大笋迟花芥蓝、泰国芥蓝、正源四季甜
芥蓝和绿宝芥蓝。第三类为齐口期
75 d
的正源澄海
粗条芥蓝。
1.2
芥蓝
MSAP
分析
利用
5
MSAP
引物组合扩增
18
个芥蓝品
种,一共得到
432
条带,平均每条引物
86
条,其
201
条片段表现出多态性,推测芥蓝甲基化多
态性比率为
47% (201/432)
,可见
MSAP
检测芥篮
种质资源遗传多样性的效率很高,芥篮遗传多样
性也较丰富
(
2)
选用
Eco
R
Ⅰ和
Msp
Ⅱ组合获得的多态性条带,