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刘硕等
, 2011, SRAP
技术在桃
(
Prunus persica
L.)
遗传多样性研究上的应用
,
分子植物育种
Vol.9 No.76 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0076)
1561
之间,平均
PIC
值为
0.28
,属于中度水平
(Botstein et
al., 1980)
Yoon
(2006)
利用
SSR
标记检测
96
个桃材
料,其
PIC
值范围为
0.4~0.98
,平均
PIC
值为
0.8
,高
于本实验结果
0.28
。其原因为本实验在计算
PIC
值时
把无多态性的条带也一并统计在内,因此
PIC
值会
低于其它单位点检测标记
(
SSR)
的结果。一般来
说多态性的条带数越少
(
即多态性比例越低
)
PIC
越低,但我们也发现有些多态性高的引物组合,其
PIC
值并不高,如引物组合
Me4Em10
多态性条带最
多,比例高达
86.2%
,其
PIC
值仅为
0.46
,说明这些
多态性条带在整个群体中并不是均匀分布的,很多
多态性条带只在少数品种中出现
(
如保
1)
。在
28
个引
物组合中,
PIC
值最高的
5
个引物组合
(Me4Em7,
Me4Em10, Me4Em11, Me5Em4, Me7Em4)
能扩增出
98
条多态性条带,揭示了品种间丰富的遗传多样
性,因此这些引物组合可以优先用于桃品种的鉴
定、遗传多样性及遗传作图的研究中。
遗传多样性是物种长期进化的结果,是种群生
存和发展的基础。本研究利用
SRAP
技术对
48
个桃
品种进行遗传多样性的研究,品种的相似系数在
0.27~0.89
之间,平均相似系数为
0.57(
2)
,与史红
丽 等
(2009)
47
个 桃 材 料 聚 类 相 似 系 数
(0.501~0.842)
,陈巍等
(2007)
56
份桃材料聚类相似
系数
(0.2~0.79)
结果相近。此外,本试验结果高于柑
橘、柿子等其它木本果树植物的
SRAP
聚类结果,
说明桃具有更高的遗传多样性
(Guo and Luo, 2006;
Uzun et al., 2009)
,这可能与材料中包含有大量的亲
缘关系较远的地方品种有关。通过聚类分析,发现
日本的溶质普通桃和中国的蟠桃及部分溶质普通
桃聚在一起
(J
类群
)
,说明蟠桃品种虽然在果型上和
其它类型的桃之间有显著的差别,但其它性状的遗
传基础和普通桃类似;日本桃品种培育最早是以中
国上海的优异水蜜桃为基础的,和中国的溶质普通
桃应该具有较高的遗传相似性。我国的溶质普通桃
分布在不同的类群中
(J
I
类群
)
,说明我国的溶质普
通桃遗传背景比较复杂,起源可能是多元的
(
陈巍等
,
2007)
兴津油桃
和来源于日本的其它品种
(
普通
)
并没有聚在一起,说明日本油桃品种的选育和其
它桃的遗传基础不尽一致。其它小类群
(
A, C
I)
和以上这
4
大类群因相似系数较低,但所含的品种
来源一致,如来自新疆的
新疆大甜仁
新疆小甜
,这两个品种是桃的近缘种,和桃具有比较远
的亲缘关系
(
程中平等
, 2001)
。甘肃具有独特的生态
环境,
张黄
7
张黄
9
肉蟠桃
经过长期
的驯化形成了特殊的生态类型,故聚在一起。对所
有品种聚类结果分析发现,来自保加利亚的品种
1”
和其它桃品种的相似系数只有
0.27
,而其生物
学性状与其它品种之间并无显著差异,国内外的研
究报道并中无该品种的研究介绍,该材料也是首次
在本实验中被利用,在
SRAP
电泳图谱上也发现该
品种存在大量稀有位点,说明该品种存在着特殊的
遗传基础,有可能作为重要的种质材料进行桃品种
的选育,丰富选育品种的遗传多样性。
本实验不足之处是仅凭借
SRAP
一种分子标记
通常很难真实反映资源间的相互关系,只有通过多
种分子标记综合分析,并结合遗传起源、地理分布、
植物学和生物学性状调查分析,才能更准确地揭示
品种资源间的遗传差异,丰富与桃生物学性状紧密
相关的标记数量。本实验室也在将多种分子标记方
法同时应用于桃品种资源的扫描,目的在于借助不
同的分子标记方法,弥补单一标记的不足,更全面
更有效的揭示桃遗传多样性。
总之,本研究证明
SRAP
标记含有较高的多态
性信息,可以较好的对桃品种材料进行遗传多样性
分析,其聚类结果能够反映资源间的遗传起源、地
理分别、植物学和生物学性状等方面的相互关系。
从统计学角度对桃生物学性状进行相关分析,找到
一些与桃果实颜色、形状等重要性状相关度高的
SRAP
引物组合,为
SRAP
标记的应用及丰富桃品种
遗传多样性分析提供较好的实验结果。
3
材料与方法
3.1
试验材料
试验材料于
2009
年夏季取自北京市农林科学
院林业果树研究所桃国家资源圃,共
48
(
4)
其中中国地方品种
25
份,国外品种
(
日本、美国和
欧洲
)15
份,中国选育品种
8
份。取当年生枝条的
幼嫩叶片
0.2
g
,放入
2.0
mL
离心管中,液氮速冻,
置于-
80
℃ 低温冰箱保存。