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分子植物育种
(
网络版
), 2011
,
9
,
1197
-
1202
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2011, Vol.9, 1197
-
1202
http://mpb. 5th.sophiapublisher.com
1197
研究报告
A Letter
山杨种源遗传多样性的
SSR
分析
王艳敏
,
白卉
,
李春明
,
李正华
,
邢亚娟
黑龙江省林业科学研究所
,
哈尔滨
, 150081
通讯作者
:
xingyajuan@163.com;
作者
分子植物育种
, 2011
,
9
,
27
doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0027
收稿日期:
2010
12
01
接受日期:
2011
02
28
发表日期:
2011
03
07
这是一篇采用
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引用格式:
王艳敏等
, 2011,
山杨种源遗传多样性的
SSR
分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.27 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0027)
利用
SSR
分子标记技术对山杨
(
Populus davidiana
Dode)6
个种源的
208
个个体的遗传多样性和遗传变异进行了分
析,结果表明:
6
对引物在预期产物大小片段处共扩增出
29
个位点,每对引物扩增的
DNA
条带的数目在
3-7
条之间,平均
4.83
条,其中所有条带均具有多态性,多态位点百分率达到
100%
,表明本次研究的各种源山杨具有较大的遗传多样性。
所研究的山杨种源总的
Nei
遗传多样性指数
(
H
)
0.5957
Shannon
指数
(
I
)
1.1001
。遗传变异分析表明,
6
个山杨种源间的
基因分化指数
G
st
0.1143
,基因流
N
m
1.9366
。山杨种源内的遗传多样性占总群体的
88.57%
,种源间遗传多样性占总群
体的
11.43%
UPGMA
聚类结果显示:湖上种源和江山娇种源的遗传距离比较近被聚为一类,方正种源与苇河种源距离比
较近,聚为一类。
关键词
山杨
;
遗传多样性
; SSR
SSR Analysis on Genetic Diversity of Populations of
Populus Davidiana
Dode
Wang Yanmin , Bai Hui , Li Chunming , Li Zhenghua , Xing Yajuan
Forestry Research Institute of Heilongjiang Province, Harbin, 150081, P.R. China
Corresponding author, xingyajuan@163.com;
Authors
Abstract
Genetic diversity and genetic variation of 6
Populus davidiana
Dode provenances including 208 individuals were
analyzed with SSR molecular markers. Twenty-nine loci were amplified by 6 SSR primers in expected product size of the fragment.
Each of the primers amplified 3~7 DNA bands, with an average of 4.83. All the bands amplified were polymorphic, and the
percentage of polymorphic loci was 100%, which indicates that the sources of
P. davidiana
Dode have a large genetic diversity. The
Nei genetic diversity index (H) of total
P.davidiana
Dode was 0.5957, Shannon index (I) was 1.1001. Genetic variation analysis
showed that genetic differentiation (G
st
) between the six provenances was 0.1143, and the gene flow coefficient (
N
m
) was 1.9366.
Genetic diversity in the six provenances was 88.57% in the total population, and that among provenances is 11.43%. UPGMA cluster
analysis showed that the genetic distance between HS provenance and JSJ provenance were relatively close, which can be clustered
into one group. So were FZ provenance and WH provenance.
Keywords
P. davidiana
Dode; Genetic diversity; SSR
研究背景
研究林木基因资源遗传多样性是基因资源保
存的前提,对培育林木新品种具有重要的指导意
义。遗传多样性是伴随基因传递过程产生的同一物
种个体间的变异,包括极其微小的、不易见到的变
(
朱大保
, 1994)
。保护基因资源可以满足不同育种
目标和未来的良种需要,包括应对特殊环境和病虫
害都有赖于丰富的遗传多样性
(
魏润鹏
, 1995)
山杨木材结构均匀、质轻而软、颜色淡白,不
用填充其他原料即可用于造纸
(
刘培林和赵其基
,
1991)
。随着社会对这一树种需求量的日趋增加,天
然林已不敷需求,而多代萌生的山杨天然林心腐又
很严重,不能满足培育纸浆用速生丰产林的需要。
传统的林木育种方法周期长、见效慢,不可能在短
时期内培育出符合实际生产需要的山杨造纸用造
林新品种,而分子标记技术的快速发展及其在林木
育种中的应用,为在短时期内培育出纤维性状优
良、生长快的山杨纸浆材优良新品种提供了可能
性。
SSR
即微卫星
DNA
,由于
SSR
标记技术呈共显
性遗传,符合孟德尔遗传规律,能用
PCR
扩增、提