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蔡秋华等
, 2011,
利用
SSR
分子标记评价高代恢复系及遗传多样性分析
,
分子植物育种
Vol.9 No.17 (doi: 10.5376/mpb.cn.2011.09.0017)
1123
性状的新品种,常常在原有优良亲本材料的基础上
进行杂交改良创制新材料。在加快育种进程的同
时,也造成了创制的新品种遗传基础狭窄,对育种
水平的进一步提高有极大的局限性
(
王颖姮等
,
2009)
。在常规育种中,主要依据育种经验及株型选
择来选育新材料,源于同一供体亲本的株系间较难
筛选到遗传差异大的种质。复合杂交育种、航天诱
变育种等技术能够在一定程度上创造更多的变异
类型,丰富遗传基础,但在丰富遗传基础的同时,
性状的稳定需更多的世代,甚至加代至高代仍未能
稳定性状,给新品种选育带来了新的挑战。
DNA
分子标记在研究水稻材料遗传多样性中
被广泛应用。其中基于
PCR
SSR
分子标记快捷
简便,重复性好且多态性丰富,在水稻遗传多样性
检测中得到广泛应用,此外
SSR
标记不仅能够鉴
定纯合体和杂合体,而且结果可靠,方法简单,省
时省力
(
白玉
, 2007)
。王秋实
2007)
利用
64
SSR
引物对
38
份材料进行分析,鉴定到多份遗
传差异较大的材料,并提出选用抗病材料与遗传差
异大的材料杂交选育新的抗病新品种的策略。段世
华等
(2002)
采用
SSR
分子标记技术对
35
份恢复系
材料进行遗传多样性分析,结果表明我国杂交水稻
恢复系资源丰富但遗传差异较小,遗传背景较为单
一。吕广磊等
(2009)
采用
64
SSR
标记对
96
份云
南地方品种及选育品种进行比较分析,表明云南栽
培稻选育品种与地方品种亲缘关系较近,其遗传基
础可能源于云南地方品种,同时也认为云南地方品
种遗传多样性丰富,存在大量优质性状可供育种实
践选择。因此,如何有效地利用较为丰富的种质资
源,创制新材料,提高育种效率是目前急待解决的
难题。运用
SSR
标记技术分析评价复合杂交系谱选
育的高代恢复系
(8~10
)
稳定性及遗传多样性尚未
见到报道。本研究采用
SSR
分子标记技术,对源于
诱变、籼粳杂交及复合杂交为一体的高代恢复系材
(8~10
)
进行遗传稳定性评价和遗传多样性分
析,为进一步利用这些高代恢复系材料进行杂交水
稻新组合的配制提供依据并为分子标记技术评价
遗传稳定性提供参考。
1
结果与分析
1.1 27
份高代恢复系材料的
SSR
扩增结果
本实验选用水稻新品种鉴定用的
24
SSR
记对
27
份水稻高代恢复系材料进行遗传多样性分
析,结果显示所有引物均能扩增出稳定清晰可辨的
扩增产物。
24
对引物共扩增出
165
DNA
带,其
9
对引物具有共
38
个多态性位点,占总条带的
23.03%
。每对引物检测出
2~8
个多态性片段,平均
4.2
个。每个多态性
SSR
位点的多态性信息量
(PIC)
变化范围在
0.299~0.866
,平均值为
0.592 (
1)
1
为引物
RM71
对供试的
27
份材料的
SSR
电泳
图,图中所示的具有不同的
SSR
带型,多态性检测
率较高,另从该图也可看出部分株系具有共显性的
杂合带型,说明该部分株系材料还有待进一步加代
稳定农艺性状。
1 9
SSR
引物在
27
份高代恢复系材料中检测到的等位变异数和多态性
Table1 Allele numbers and PIC value of 9 SSR loci detected in 27 high generation restorer lines of hybrid rice
编号
NO.
SSR
引物
SSR Markers
染色体位置
NO.of Chromosome
重复单位
Repeat Units
多态位点数
Allele numbers of polymorphisms
PIC
Value of PIC
1
RM17
12
(GA)
21
6
0.847
2
RM18
7
(GA)4AA(GA)(AG)
16
8
0.865
3
RM71
2
(ATT)10T(ATT)
4
8
0.866
4
RM209
11
(CT)
18
3
0.571
5
RM219
9
(CT)
17
3
0.537
6
RM224
11
(AAG)8(AG)
13
2
0.493
7
RM273
4
(GA)
11
2
0.495
8
RM336
7
(CTT)
18
3
0.299
9
RM337
8
(CTT)4
-
19
-
(CTT)
8
3
0.357