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田术美等
, 2011, 56
份大白菜种质资源的
SSR
遗传多样性分析
,
分子植物育种
(online) Vol.9 No.109 pp.1791-1798 (doi: 10.5376/mpb. cn.2011.09.0109)
1792
关系进行分析
,
结果显示，结球白菜类群的划分与传
统上按叶球类型的划分结果具有一定的相似性
(
虞
慧芳等
, 2008)
。
近年来，基于
PCR
的
DNA
分子标记技术已被
广泛应用于蔬菜作物的种质资源遗传多样性和亲
缘关系研究，其中
SSR (simple sequence repeat)
标记
成为重要的研究手段之一。
SSR
标记多数为共显性
标记，变异丰富、多态性高、在整个基因组中分布
均匀
(Gupta and Varshney, 2000)
。
SSR
分子标记具有
不受环境条件限制，表达稳定、重现性好
(
马静等
,
2011)
，对模板
DNA
的质量要求不高，需要量较少，
技术难度低，实验成本也较低
(
周杰
, 2009)
等诸多优
点，而被广泛应用于芸薹属蔬菜种质资源遗传多样
性及品种鉴定研究中。聂平等利用
SSR
分子标记对
不同生态类型甘蓝型油菜进行遗传多样性分析，聚
类结果显示总体上春性材料聚在一起
,
半冬性材料
聚在一起，这同时也说明春性和半冬性品种
(
系
)
的
遗传差异比较大
(
聂平等
, 2008)
。姚艳梅等利用
SSR
标记研究了特早熟春性甘蓝型油菜品系及其亲本
的遗传多样性和亲缘关系，结果表明，利用甘蓝型
油菜与白菜型油菜种间杂交培育出的新型甘蓝型
油菜品系遗传多样性丰富，且与其甘蓝型亲本有一
定的遗传差异
(
姚艳梅等
, 2008)
。曾川等利用
SSR
分子标记对三峡库区的
10
份芥菜型油菜品种的遗
传多样性进行分析，研究结果表明地理和生态条件
是影响三峡库区芥菜型油菜类群的主要因素
(
曾川
等
, 2011)
。目前，国内尚没有利用该技术对大白菜
种质资源的遗传多样性及亲缘关系进行研究的报
道。本研究旨在通过
SSR
分子标记技术，对部分大
白菜种质资源进行聚类分析，探讨利用
SSR
分子标
记技术研究大白菜种质资源遗传多样性的可靠性，
了解大白菜部分种质资源的遗传背景和亲缘关系，
确定亲本之间的遗传差异和遗传距离，为杂交亲本
的选配、杂交优势群的划分和杂种优势的预测提供
一定的理论依据。
1
结果与分析
1.1 SSR
标记的多态性分析
电泳图谱中每条扩增带代表引物的一对结合
位点，且被视为有效的分子标记。同一引物的扩增
产物中电泳迁移率一致的条带被认为具有同源性
(
张羽等
, 2011)
。利用筛选出的
20
对
SSR
多态性引
物，在
56
份大白菜自交系间共检测出了
58
个多态
性位点，每对
SSR
引物可检测到的多态性位点为
2~4
个不等，平均每对
SSR
引物检测到
2.9
个多态
性位点。图
1
为引物
5(
表
2)
的扩增电泳图。
图
1
引物
5
在
56
份材料中的扩增电泳图
注
: M: DNA marker pBR322 DNA/Mspl;
电泳图中的数字
1~56
分别为材料
C1~C56 (
表
1)
Figure 1 Amplificaion products with primer 5 in the 56 materials
Note: M: DNA marker pBR322 DNA/Mspl; The number 1~56 above the figure were C1~C56 (table 1)
1.2
大白菜种质资源的遗传关系分析
利用
NTSYSpc2.11
遗传分析软件，根据电泳结
果统计的数据计算
56
个材料的遗传相似系数
(GS)
，
这些材料之间既存在遗传差异较大的材料，也存在
遗传差异很小的材料，其
GS
变化范围为
0.4151~0.9655
。材料间的遗传相似系数，以
C1
和
C4
间的最大，为
0.9655
，其次是
C3
和
C34
，为
0.9643
，其中
C1
和
C4
都是来自日本的材料，表型
性状差异也较小，具有较高的相似性。遗传相似系
数最小的是
C10
和
C26
，为
0.4151
，
C10
为合抱、
长炮弹形，属秋播生态型；而
C26
为叠抱、近球形，
属耐热极早熟生态型，田间性状差异大。由此结果
可以推出，利用
SSR
标记研究大白菜种质资源的遗
传多样性是可靠的。
1.3 SSR
标记聚类结果分析
根据
20
对多态性
SSR
引物电泳结果的统计数
据，采用
UPGMA
法进行聚类分析得到
56
份材料的
系统关系树
(
图
2)
，本研究参试的
56
份材料在遗传相