Page 5 - CMB-Vol.01-No.04

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计算分子生物学
(
网络版
), 2012
,
1
,
4
,
23
-
28
Jisuan Fenzi Shengwuxue (Online), 2012, Vol.1, No.4, 23
-
28
http://cmb.5th.sophiapublisher.com
23
研究报告
Research Report
濒危黑颈长尾雉圈养种群的
RAPD
遗传多样性分析
庾太林
,
韩增超
,
管清新
,
张良建
,
刘晓辉
广西师范大学生命科学学院
,
桂林
, 541004
通讯作者
:
yutail@163.com;
作者
计算分子生物学
, 2012
,
1
,
4
doi: 10.5376/cmb.cn.2012.01.0004
收稿日期:
2012
08
28
接受日期:
2012
09
07
发表日期:
2012
09
10
本文首次发表在《基因组学与应用生物学》
(2012
年第
31
卷第
4
369-373
)
上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用
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(
中文
)
庾太林等
, 2012,
濒危黑颈长尾雉圈养种群的
RAPD
遗传多样性分析
,
计算分子生物学
(online) Vol.1 No.4 pp.23-28 (doi:
10.5376/cmb.cn.2012.01.0004)
引用格式
(
英文
)
Yu et al., 2012, Genetic Diversity of the Domesticated Population of Endangered
Syrmaticus humiae
Revealed by RAPD Amplification, Jisuan Fenzi
Shengwuxue (online) (Computational Molecular Biology) Vol.1 No.4 pp.23-28 (doi: 10.5376/cmb.cn.2012.01.0004)
摘 要
运用
RAPD
技术对黑颈长尾雉圈养种群的遗传多样性进行了分析。从
50
条随机引物中筛选出
14
条引物,对
24
个体的基因组
DNA
进行了
PCR
扩增,从检测出的
119
个位点中有
98
个多态位点,占总位点的
82.35%
,标记的分子量大小
范围是
0.2~3 kb
24
个个体间的遗传距离幅度
0.159 7~0.487 4
,平均是
0.281 0
;用软件
NTsys 2.10e
构建了
24
个个体相互
关系的分支图,
24
个个体可分为
3
个类群。实验表明:黑颈长尾雉圈养种群的遗传多样性水平较高,圈养种群内遗传差异
性较大。
关键词
黑颈长尾雉
;
圈养种群
; RAPD;
遗传多样性
Genetic Diversity of the Domesticated Population of Endangered Syrmaticus
humiae Revealed by RAPD Amplification
Yu Tailin , Han Zengchao , Guan Qingxin , Zhang Liangjian , Liu Xiaohui
College of Life Science, Guangxi Normal University, Guilin, 541004
Corresponding author: yutail@163.com;
Authors
Abstract
The genetic diversity of cultured stocks of
Syrmaticus humiae
has been studied by RAPD technique. 24 individuals DNA
were used for genetics analysis and 14 of 50 random primers have been selected for PCR amplification. Among the amplified 119
loci, 98 loci were polymorphic which occupied 82.35% in total. The molecular weights were from 0.2 kb to 3 kb. The genetic
distance among 24 individuals ranged from 0.159 7 to 0.487 4 and the average genetic distance was 0.281 0. After the dendrogram
was constructed by NTsys 2.10e software, the 24 individuals of
Syrmaticus humiae
could be separated into 3 major clusters. In
conclusion, there are higher genetic diversity and differentiation of
Syrmaticus humiae
in captivity population.
Keywords
Syrmaticus humiae
; Domesticated Population; RAPD; Genetic diversity
黑颈长尾雉
(
Syrmaticus humiae
)
属国家
级保
护雉类,已列入国际鸟类保护委员会世界濒危鸟类
红皮书和我国国家重点保护野生动物名录。在我国
仅分布于广西、云南的少数几个县境内
(
郑作新
,
1978,
科学出版社
, pp.172-177;
李汉华等
, 1998)
目前生境严重破坏,野生数量已极端稀少,资源接
近枯竭。因此,制定濒危动物野生和圈养种群的保
护管理策略的一个主要目标,就是要维持该物种的
遗传多样性
(Frankham et al., 2002)
。黑颈长尾雉的有
效保护和人工繁殖对于扩大其种群,保护珍稀动
物,维持生态平衡有着重要的意义。
目前对黑颈长尾雉的研究主要有黑颈长尾雉
的分布
(
李汉华等
, 1998;
韩联宪
, 1997;
范喜顺等
,
2004)
,繁殖
(
陈伟才等
, 2006;
刘小华等
, 1991)
,种
群扩散
(
贝永建等
, 2005)
,人工饲养和繁殖
(
庾太林
, 1996)
,笼养状态下求偶炫耀行为
(
李汉华等
,
1999)
,尚未发现对黑颈长尾雉的遗传多样性研究的
报道。
5TH